BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP016816	249,593	T→A	I24I (ATT→ATA)	JCVSYN2_01060 →	DNA repair protein RecO

Read alignment evidence...
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*	CP016816	249,593	0	T	A	99.5%	5342.0 / NA	1675	I24I (ATT→ATA)	JCVSYN2_01060	DNA repair protein RecO
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/3); new base A (879/787); total (885/790)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.29e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1690 total aligned reads displayed.

AAGAAACTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATTTATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAATCAAAAAATA  >  CP016816/249468‑249717

 agaaACTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATATAATTATTACAatatat                                                                                                                           >  2:365533/1‑128 (MQ=255)

    aaCTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCt                                                                                                                        >  1:3832162/1‑128 (MQ=255)

    aaCTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCt                                                                                                                        >  1:2693061/1‑128 (MQ=255)

     aCTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGTATCAATATTAATGGAAATAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAAATTagaata                                                                                                                       <  1:2220049/128‑6 (MQ=255)

     aCTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAATGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTa                                                                                                                       >  1:47002/1‑128 (MQ=255)

       tCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGTAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAAt                                                                                                                     >  1:2757412/1‑128 (MQ=255)

       tCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAAt                                                                                                                     >  2:1096085/1‑128 (MQ=255)

         aacTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAAttt                                                                                                                   <  2:2716209/126‑1 (MQ=255)

         aCCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAAttt                                                                                                                   <  2:3341414/128‑1 (MQ=255)

           cTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGt                                                                                                                 <  1:1001348/128‑1 (MQ=255)

           cTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGt                                                                                                                 <  1:602938/128‑1 (MQ=255)

            tAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGACAACACCTTAAAGGGAATAGTTTTAATTAGTTTTGATTTTCAAGATTAGGATAAAATGATTACAATTTATTCTAAttgtta                                                                                                                >  2:2649891/1‑124 (MQ=255)

                tatatttaAAAACTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGa                                                                                                            <  2:2602689/125‑1 (MQ=255)

                 taattaaAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGaa                                                                                                           >  1:1838852/1‑128 (MQ=255)

                     ttaaaaacTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAATAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAt                                                                                                       <  2:846952/126‑1 (MQ=255)

                     taaAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAt                                                                                                       >  1:1664642/1‑128 (MQ=255)

                        aaaaaTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGTGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttag                                                                                                    <  2:1942600/128‑1 (MQ=255)

                        aaaaaTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttag                                                                                                    <  1:2172492/128‑1 (MQ=255)

                        aaaaaTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttag                                                                                                    <  2:1170099/128‑1 (MQ=255)

                         aaaaTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttagt                                                                                                   <  1:3690775/128‑1 (MQ=255)

                           aaTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttagttt                                                                                                 >  1:893953/1‑128 (MQ=255)

                            attgtttATAACAAGGATAATTATTAATGGAAAAAACCTTATAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttagttta                                                                                                <  1:1262952/123‑1 (MQ=255)

                            aTGGGTTATATCAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttagttta                                                                                                <  2:3905422/128‑1 (MQ=255)

                            aTGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttagttta                                                                                                <  2:2165812/128‑1 (MQ=255)

                             tGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAttagtttag                                                                                               <  2:2076408/128‑1 (MQ=255)

                                 ttATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAgtttg                                                                                           >  1:1742019/1‑128 (MQ=255)

                                   ataACAAGTAGCAATATTAATTGAAAAAACCTTAAAGGTATTAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAgtttgtt                                                                                         <  1:2295759/128‑1 (MQ=255)

                                     aagaaGGATCAATTTTAATGGAACAAAACTTTAAGGGAATTGTTTTAAATTGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGTAAAATTAGTTTAGTTTGTTTa                                                                                       <  2:185790/125‑1 (MQ=255)

                                     aaCAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGTAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTa                                                                                       >  2:3084720/1‑128 (MQ=255)

                                     aaCAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTa                                                                                       >  2:1697490/1‑128 (MQ=255)

                                     aaCAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTa                                                                                       >  1:2632586/1‑128 (MQ=255)

                                     aaCAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTa                                                                                       <  1:1595315/128‑1 (MQ=255)

                                          ggATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGgtgt                                                                                  <  2:3706226/128‑1 (MQ=255)

                                          ggATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGgtgt                                                                                  <  2:46458/128‑1 (MQ=255)

                                          ggATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGgtgt                                                                                  <  1:3891443/128‑1 (MQ=255)

                                           gATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGtt                                                                                 <  1:310419/128‑1 (MQ=255)

                                               aaTATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAAt                                                                                                       >  1:2563878/1‑102 (MQ=255)

                                                  atTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTaataaaa                                                                          >  1:539094/1‑128 (MQ=255)

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                                                    tAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTACTTTAGTTTGTTTAGGTGTTaataaaata                                                                        >  2:3577304/1‑128 (MQ=255)

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                                                        ggAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATaaaaa                                                                    >  2:2979836/1‑128 (MQ=255)

                                                         gAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAg                                                                   <  2:1635553/128‑1 (MQ=255)

                                                           aaaaaCCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGTTGTTAATAAAATAAAAAGTa                                                                 >  2:548895/1‑128 (MQ=255)

                                                            aaaaCCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTaa                                                                >  2:626190/1‑128 (MQ=255)

                                                             aaaCCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTaaa                                                               <  2:31544/128‑1 (MQ=255)

                                                              aaCCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTaaaa                                                              <  1:375490/128‑1 (MQ=255)

                                                                ccTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaat                                                            >  2:3486990/1‑128 (MQ=255)

                                                                  ttAAAGGGAATTGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaataa                                                          <  2:2877905/128‑1 (MQ=255)

                                                                  ttAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGTAAAAATTAGTTTAGTATGTTTAGGTCTTAATAAAATAAAAAGAAAaaataa                                                          >  1:766667/1‑128 (MQ=255)

                                                                  ttAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAATATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaataa                                                          >  2:3965696/1‑128 (MQ=255)

                                                                  ttAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaataa                                                          <  1:3270987/128‑1 (MQ=255)

                                                                   tAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaataaa                                                         <  1:3967287/128‑1 (MQ=255)

                                                                    aaaGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATGAAATAAAAAGTAAaaataaat                                                        <  1:3537675/128‑1 (MQ=255)

                                                                    aaaGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaataaat                                                        <  2:2410262/128‑1 (MQ=255)

                                                                      aGGGAAAAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAatat                                                      >  2:2319746/1‑128 (MQ=255)

                                                                        tgAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTCTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATgg                                                    <  1:1128655/127‑1 (MQ=255)

                                                                         gAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGTAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAAAAAATATGGt                                                   >  1:2072596/1‑128 (MQ=255)

                                                                         gAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAATATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATgtt                                                   >  1:704440/1‑126 (MQ=255)

                                                                          aaTAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTa                                                  >  1:1060215/1‑128 (MQ=255)

                                                                          aaTAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTa                                                  <  1:997111/128‑1 (MQ=255)

                                                                              gTTTTAATTAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTaa                                              <  2:3780876/128‑1 (MQ=255)

                                                                                tttAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAaaataaa                                                         <  1:1417201/115‑1 (MQ=255)

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                                                                                   aaaTAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAactact                                         <  1:2979836/128‑1 (MQ=255)

                                                                                     aTAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTa                                       <  1:822269/128‑1 (MQ=255)

                                                                                      tAGTTTTGATTTTCATGATTATGATAATATTTTTATAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGATTGTTTAGGGGTTTATAAAATTTATAGGAATAATAATTATGGTATTAACTACTTAt                                      <  2:792586/128‑1 (MQ=255)

                                                                                       aGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATc                                     <  1:3333036/128‑1 (MQ=255)

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                                                                                         ttttGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGTTATAAACTACTTATCat                                   >  2:1347450/1‑128 (MQ=255)

                                                                                           ttGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCatat                                 >  1:1342212/1‑128 (MQ=255)

                                                                                             gATTTTCAAGATTATGATAATATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTc                               <  2:3264254/128‑1 (MQ=255)

                                                                                             gATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTc                               >  2:1480439/1‑128 (MQ=255)

                                                                                              aTTTTCAAGCTTATGATAAAATTATTAAAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCa                              <  2:2481267/128‑1 (MQ=255)

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                                                                                               ttttCAAGATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCaa                             <  2:3037541/128‑1 (MQ=255)

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                                                                                                      gATTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTga                      <  2:1598125/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                      gATTATGATAAAATTATTACAATATATTCAAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTga                      <  2:3403160/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                       aTTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTTTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTgag                     <  2:383722/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                       aTTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTgat                     >  2:1766158/1‑127 (MQ=255)

                                                                                                       aTTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTgag                     <  1:3486990/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                       aTTATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTgag                     <  1:3030593/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                        ttATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTgaga                    >  1:3388519/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                        ttATGATAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTgaga                    <  2:1276381/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                             aTAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGAttttt               >  2:716527/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                             aTAAAATTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGAttttt               >  2:2820943/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                               aaaaTTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTaa             >  1:2814106/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                 aaTTATTACAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAAt           <  1:3635258/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                     attaCAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAATCaaa       >  1:2466283/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                      ttaCAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAATCaaaa      <  2:1227743/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        aCAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGTTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAATCaaaaaa    >  2:2004941/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                         cAATATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATAATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAATCAAAaaat   >  1:1980757/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                          aaTATATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTAATATTTTTAAAACAAAaaata  >  2:2237292/1‑128 (MQ=255)

AAGAAACTCACCTAGTTTAATTAAAAAAATGGGTTATAACAAGGATCAATATTAATGGAAAAAACCTTAAAGGGAATAGTTTTAAATAGTTTTGATTTTCAAGATTATGATAAAATTATTACAATTTATTCTAATTTGTATGGAAAAATTAGTTTAGTTTGTTTAGGTGTTAATAAAATAAAAAGTAAAAATAAATATGGTATTAACTACTTATCATATTCAAATTTTGAGATTTTTAAATCAAAAAATA  >  CP016816/249468‑249717

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 15 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`