| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 76896 = | 1133 (1.000) | 50 (0.050) | 35/226 | 20.8 | 4.8% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 959 (0.940) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑a‑aa‑‑a‑aa‑aa‑a‑aaaa‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A > 1:239820/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA > 1:1995645/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA > 1:334060/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA > 2:2433106/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑A‑AA > 2:903137/1‑128 TTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATATAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA > 2:610379/1‑128 TGATATTAAATTAAATATAACTGATTTATATATAAAAAAAATATATATAGACAAATTATTATAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A < 1:2176770/128‑1 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTATAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑AC‑A‑AA‑‑A > 1:1221283/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A > 1:392437/1‑128 TGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATCTTATTT‑CC‑A‑AA‑‑A > 2:1768927/1‑128 tATATTAAATTAAAGATAACTTTATTATATATAAAAAAAATCTATATAGACAAATTATTAGAATAAATCAATTAATATTTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑A < 1:1822131/127‑1 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTTAAATTTAAATTCTAATAATTTATAAAATTATATGTTAATT‑CA‑A‑AA‑‑A‑A > 2:1792948/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGATATTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑A > 2:940832/1‑128 GATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATATATATAGAAAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATATGTGAAATTAAAATACTAATAATTAGTAAAATTATATATTATTT‑CA‑A‑AA‑‑A‑A > 1:100240/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑AC‑A‑AA‑‑A‑AA > 1:738162/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATAATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA > 1:987527/1‑128 ATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTAGATAGCCAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA > 2:2005860/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑A > 1:1097245/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑A > 1:596876/1‑128 TATTAAAGTAAAGATCACTGAATTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAACAAATCAATTCATCTTTCAAATTTAAATTCTAATAATAGTTAAAAATATATATTAGTT‑CA‑A‑AA‑‑A‑AA‑A > 2:1801821/1‑128 ATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA > 1:1169424/1‑128 TTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTATTT‑AC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A > 2:2235123/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAATAAATCAATTCATCTGTTAAATTTAAATTCTAATAATTTTTAAAATTATATTTTAGTT‑CA‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑A > 1:1469100/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTTTTAAAATTATAAGTTATTT‑AC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑A > 1:1789175/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTATAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑TA‑‑A‑AA‑AA‑A‑A > 2:2329461/1‑128 TAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATAAATTCATCAGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTTTATGTTAGTT‑CA‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑A > 2:1693551/1‑128 AAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTAATCTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGTTAAAATTATATGTTATTT‑AA‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAA > 1:1456458/1‑128 AGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATTTATATAGAAAAATTATTATAATAAATCAATTCATATGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGGT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA < 1:304191/128‑1 AGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATAAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAAATTGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑CA‑A‑AAAAcaatt > 2:1315604/1‑123 CTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGAAATAT > 1:1118541/1‑128 TTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTaa > 2:2091881/1‑126 AAAAACATATATAAAGAAAAATTATTTTAAGAAATCAATTCATATGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTtaaagaaaaa < 1:2195860/128‑11 ATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATAAGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑ATATTAATAATTTTAATTAAAAAAataaaa > 2:373312/1‑122 TATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑TTTTTATTATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTT > 1:831217/1‑128 TATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTTTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTT > 1:2467968/1‑128 TATAGAAAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTTTGAAATTTAAATTATAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATA < 1:533223/128‑1 AGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAACTTTGAAATATTTTTCTTTAAAAAATTatactgttaata > 2:465418/1‑116 ACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑TTTGAAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAAT > 1:593696/1‑128 ttAATCAATTCTTCTGTTAAATTTAAATTTTAATAAATGGTATTATTATATGTTAGTTGCA‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTA < 1:638684/126‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTA < 2:831236/128‑1 GAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTA < 1:1634486/128‑1 AAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTTACA‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑TTTTTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTAACTTTAAATAATTTTATTTTAATTTAA > 2:920765/1‑128 CAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTTAATTTTTTATTTAAAAAATTTATATTTAAATTATGTTATTTTAATTTTAATGG > 1:685534/1‑128 AATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑TTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATATTGTTATTTGAATTTATAGTGG > 1:2217302/1‑128 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGATATTTTATTTTAAAGGGGAATTTG > 1:295191/1‑128 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTA < 2:2164934/81‑1 ATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTA > 1:2164934/1‑81 ttTGTGTAATTTAAATTATAATAATTTGTAAAATTATATGTTAGTTACA‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTG < 1:2075271/126‑1 TCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATTTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTG < 1:2100918/128‑1 CTGTTAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAATATTTTATGTTAGTT‑AC‑ATAA‑‑T‑AA‑AT‑T‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGG < 2:62119/128‑1 ttTGAAATTTAATTTATAATAATTGGTAAATTTTTATTTTAGTG‑AC‑A‑AA‑‑A‑AATAATA‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGG < 1:1272188/126‑1 tttAAATTCTAATAATTGTTAAAATTAAATGTTAGTG‑AC‑A‑AAATA‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTAC < 1:2245003/125‑1 TTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATTTGTTAGTT‑CCAA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACA < 2:2293761/128‑1 ATAATTTGTAAAATTTTTTTTTATTT‑TC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑ATAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAA < 2:7395/128‑1 ggttaacaTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AT‑A‑AACA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATAAAATGTTATTTGAATTTAAAGGGTAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTAT < 2:2190965/120‑1 tttTATGTTATTT‑CC‑A‑AA‑‑ATAA‑AA‑ATAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATAC < 2:120443/125‑1 gttatttttaaaA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCT < 2:34064/116‑1 AGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAATGTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTAATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTTTACAGTTTTTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAtt > 1:2010690/1‑126 tacatA‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTC < 1:2471783/123‑1 tataataatAA‑AA‑A‑AAAT‑GTTGTAATATTTTTCTATAAATAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTC < 1:459734/119‑1 atAA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTA < 1:352427/126‑1 A‑AA‑‑T‑AA‑AT‑A‑ATAA‑TTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:772020/128‑1 A‑AA‑‑A‑AT‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 2:1678456/128‑1 A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAg < 1:2147228/128‑2 A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 1:15208/128‑1 A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAA < 2:153824/128‑1 AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 1:1345651/128‑1 AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:430967/128‑1 AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAAT < 2:788331/128‑1 A‑‑A‑AA‑AA‑C‑ATAC‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 2:2096831/128‑1 A‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAT‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 2:1360029/128‑1 A‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATA < 1:1293385/128‑1 A‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTATTTTTTTTTATAATTCCTTAATTTCCGTAATA > 1:1870431/1‑128 A‑AA‑AA‑A‑TAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:686885/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑ATAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2235123/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑AATA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:523524/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑AATA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:1085059/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:679729/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:1445802/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:2250305/128‑1 A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 1:1363251/128‑1 tAA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTTAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:2147191/127‑1 tA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 2:2378204/127‑1 AA‑AA‑A‑AATA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:1123499/128‑1 AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTTTCTTTATTTAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTTGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTAAACTTCCTTAAGTGCACTATTATA > 1:619066/1‑128 AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:491739/128‑1 AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 2:258406/128‑1 AA‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATA < 1:406564/128‑1 aatatA‑AAAA‑TTTTTAATATTTTTCTTTAAATATTTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATAT < 2:1178659/123‑1 A‑AA‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATAT < 1:2460199/128‑1 AA‑A‑AAAA‑GTTGTATTATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTTTTTGAATTTAAAGGGGTATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTCTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 2:966845/128‑1 A‑A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATATTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTTTACATCCTTAAGTTCAATAATATATAT > 1:904386/1‑128 aatAAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATA < 1:1656574/125‑1 A‑AAAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTTTCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTTTACAGTTATTTTTAATTT‑TATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATTTATAA > 1:934597/1‑128 atAA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAA < 1:1560992/126‑1 atA‑GTTTTAATATTTTTCTTTATAATATTTATCTTTATATAATTTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAA < 1:1049247/126‑1 AA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTTAATTTAAAGTTGAATTTGTGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAAT < 1:576394/128‑1 AA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACTGTTATTATTAATTTGTATTATAAATCCTTAAGTTCACAAATATATATAAAT > 1:1982053/1‑128 AA‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAAT > 1:1943022/1‑128 A‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGTGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < 2:1427205/128‑1 AGTTGATATTAAAGTAAAGATCACTGATTTAGATATAAAAAACATCTATATAGACAAATTATTAGAAGAAATCAATTCATCTGTGAAATTGAAATTCTAATAATTGGTAAAATTATATGTTAGTT‑CC‑A‑AA‑‑A‑AA‑AA‑A‑AAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/77035‑76896‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑a‑aa‑‑a‑aa‑aa‑a‑aaaa‑GTTGTAATATTTTTCTTTAAAAAATTTATCTTTATATAATGTTATTTGAATTTAAAGGGGAATTTGGGTTGTACAGTTATTATTAATTTGTATTATACATCCTTAAGTTCACTAATATATATAAATT < CP016816/76892‑76766 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |