| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP016816 | 462,630 | Δ57 bp | coding (2164‑2220/2238 nt) | JCVSYN2_02140 → | PTS sugar transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 462629 | 1 (0.000) | 1012 (1.010) | 204/222 | 0.2 | 99.9% | coding (2163/2238 nt) | JCVSYN2_02140 | PTS sugar transporter |
| ? | CP016816 | 462687 = | 2 (0.000) | coding (2221/2238 nt) | JCVSYN2_02140 | PTS sugar transporter | |||||
Only 100 of 1166 total aligned reads displayed.
ATGAAATGAAAGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAGCAAAATCAACATCTTCTAAACCAAAAACAACTAAAGCTAAATCAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGA > CP016816/462502‑462754 | atgaaatgaaAGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTTATTAAAGTGCCTAATCAACGAAGTCATCTAGTTCTAAA > 2:616142‑M1/1‑128 (MQ=255) tgaaatgaaaGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAa > 2:444613‑M1/1‑127 (MQ=255) aaatgaaaGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAact > 2:1201793‑M1/1‑125 (MQ=255) aaatgaaaGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAact > 1:386653‑M1/1‑125 (MQ=255) aaGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaaca < 2:1340511‑M1/128‑10 (MQ=255) aGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaa < 2:2422048‑M1/128‑11 (MQ=255) gTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaac > 1:1196379‑M1/1‑117 (MQ=255) gTTGAAAAAACAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaac < 1:72844‑M1/128‑12 (MQ=255) ttGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTACAAACTCAACTAAGTCAACTAGATCTAAAacttaaacaact > 1:252105‑M1/1‑116 (MQ=255) gAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaa > 1:2148651‑M1/1‑114 (MQ=255) aaaaaCCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaa > 1:2356848‑M1/1‑113 (MQ=255) aaaaaCCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaa < 1:846135‑M1/128‑16 (MQ=255) aaaaCCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCATAATCAACATATTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacatatg > 2:1052518‑M1/1‑112 (MQ=255) aaaaCCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCTATATCAACTAAGTCAACTAGGTCTAAAgctaaaacaacataat > 1:1614906‑M1/1‑112 (MQ=255) aaaCCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAACTCTACATCTAAATCAAGTTCAAACTCAACTAAGTCAACTAGTTCTACAactaacaccacaaaata > 2:1894131‑M1/1‑111 (MQ=255) aaaaCAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaattataat > 1:1163368‑M1/1‑106 (MQ=255) aaaaCAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataat < 2:739812‑M1/128‑23 (MQ=255) acaaacTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttt < 2:1240958‑M1/128‑26 (MQ=255) aaacTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataattttta > 2:1735964‑M1/1‑101 (MQ=255) aaacTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataattttta < 2:1500609‑M1/128‑28 (MQ=255) aaacTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataattttta > 1:342199‑M1/1‑101 (MQ=255) acTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaat > 1:1453639‑M1/1‑99 (MQ=255) cTAGAACAAAATCTACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAACTCATCTAGTTCTAAAagtatcacaacaaaaaaagaattttaaatg > 2:2348617‑M1/1‑98 (MQ=255) cTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTACAactaaaccaacaaaataataattattaatt > 1:951859‑M1/1‑98 (MQ=255) gAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaa > 1:787966‑M1/1‑95 (MQ=255) aaCAAAATCAACAAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAATATCAACTAAGTCAACTAGATCTAAAactaaaacaacaaaataataatatttaattaaag < 2:581453‑M1/128‑35 (MQ=255) aCAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagt < 1:592339‑M1/128‑36 (MQ=255) cAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATATACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagta < 1:475110‑M1/128‑37 (MQ=255) aaaaTCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtac < 1:1266405‑M1/128‑38 (MQ=255) aaaaTCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaa < 1:1723421‑M1/104‑14 (MQ=255) cAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaat < 2:693088‑M1/128‑43 (MQ=255) aaCTAAAGTAATATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatt < 2:920872‑M1/128‑44 (MQ=255) aaGCAAAATCAACACCTTCAAAATCTACAAAATCTCCTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCGAAAactacaacaacaaaataataatttttaagtaaagtactcaagtaagct > 2:1102582‑M1/1‑80 (MQ=255) cAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctccc > 1:2327574‑M1/1‑77 (MQ=255) cAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctccc > 2:771450‑M1/1‑77 (MQ=255) aaaaTCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccg < 2:2315647‑M1/128‑53 (MQ=255) actcaACAACTACAAAAGCTACAAAATCTACATCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaa < 2:2086291‑M1/126‑55 (MQ=255) aagcaacaacttCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaactaataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaa < 1:668189‑M1/125‑55 (MQ=255) aaTCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaa < 2:317366‑M1/128‑55 (MQ=255) aaTCAACAAATTCAAAATCTACAATATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaattaataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaa < 1:1583694‑M1/128‑55 (MQ=255) aacaacTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTATTTCTAAAactaaaacaacaaaataatattttttaattaaagtactcaatttagctcacgaacacc > 2:642231‑M1/1‑70 (MQ=255) aacaacTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataagttttaattaaagtactcaatttatctccctaacccc > 1:1323247‑M1/1‑70 (MQ=255) caacTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAAGTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccat > 1:2065825‑M1/1‑68 (MQ=255) acTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatat > 2:535012‑M1/1‑66 (MQ=255) acTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatt < 2:1678347‑M1/109‑44 (MQ=255) ttCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattc > 1:2410311‑M1/1‑64 (MQ=255) tCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattcc > 1:1408238‑M1/1‑63 (MQ=255) tCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattcc > 2:285054‑M1/1‑63 (MQ=255) aaaatctacaaaatctacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaatataaatatataattaaagatctcaaattatctccaaaaccccatattacgg > 1:1698066‑M1/1‑61 (MQ=255) aaatctacaaaatctacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccgga > 2:2047322‑M1/1‑60 (MQ=255) tcaacaaaatctacttcTATATCATGTTCAAAATCAACTAAGTCATCTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactctatttatctcccgaagcccatattccggacta < 2:380230‑M1/125‑72 (MQ=255) ctacaaaatctacTTCTAAATCAAGTTCATAATGAACTAAGTCAACTAGGTCTAAAactaaaacaacataataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgtaccccatattccggactaa < 1:1518255‑M1/128‑73 (MQ=255) ctacaaaatctacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCGACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggcctaa > 1:624200‑M1/1‑56 (MQ=255) ctacaaaatctacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaa < 1:2446329‑M1/128‑73 (MQ=255) atctacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattcctgactaaaatccag > 2:2279430‑M1/1‑49 (MQ=255) atctacTTCTAAATCAAGATCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccag < 2:1164092‑M1/128‑80 (MQ=255) tctacATCTAAATAAAGTTCAAAATCAACTAAGACAACTAGTTCAAAAactaaaacaaaaaaataataatatataataaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccagg < 1:1812925‑M1/128‑81 (MQ=255) ctacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccagga < 1:1981582‑M1/128‑82 (MQ=255) tacTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaactacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaa > 2:1439339‑M1/1‑46 (MQ=255) acTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacataatattattttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaa < 2:1788914‑M1/128‑84 (MQ=255) acTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaa > 1:929281‑M1/1‑45 (MQ=255) ttCTAAATCAAGTTCAACATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatg < 2:875438‑M1/128‑86 (MQ=255) ttCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccagactaaaatccaggaaatg < 1:2224120‑M1/128‑86 (MQ=255) tAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaactacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaacccattattccggactaaaatccaggaaaggggg > 2:1399837‑M1/1‑40 (MQ=255) aaaTCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggt < 2:2459119‑M1/128‑90 (MQ=255) aaTCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtt > 1:1000464‑M1/1‑38 (MQ=255) tCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatata < 2:1290918‑M1/128‑99 (MQ=255) aaaaTCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaa > 2:2012481‑M1/1‑28 (MQ=255) aaaTCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccatgatatggggtttttatataaat > 1:1755382‑M1/1‑27 (MQ=255) aaaTCAACTAAGTAAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaat < 1:9859‑M1/128‑102 (MQ=255) aTCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatca < 2:2185052‑M1/128‑104 (MQ=255) tCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcac > 2:50316‑M1/1‑24 (MQ=255) cAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcact > 1:754092‑M1/1‑23 (MQ=255) cAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcact < 2:1934219‑M1/128‑106 (MQ=255) aCTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggcctaaaaaccaggaaatggggtttttatataactccctct > 1:2181126‑M1/1‑21 (MQ=255) aCTAAGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactct > 2:823869‑M1/1‑21 (MQ=255) aGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccgtactaaaatccaggaaatggggtttttatagaaagcactcttttt > 1:2265975‑M1/1‑17 (MQ=255) aGTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataattttcaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactcttttt < 1:1090869‑M1/128‑112 (MQ=255) gTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttc > 2:973946‑M1/1‑16 (MQ=255) gTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttc > 1:1220241‑M1/1‑16 (MQ=255) gTCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttc > 1:2107061‑M1/1‑16 (MQ=255) tCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatgtggtttttatttaaatctctctttttct > 2:2397830‑M1/1‑15 (MQ=255) tCAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttct > 1:185756‑M1/1‑15 (MQ=255) cAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttcta < 2:1706404‑M1/128‑115 (MQ=255) cAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttcta < 1:892153‑M1/128‑115 (MQ=255) cAACTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactcttattcta > 2:1828931‑M1/1‑14 (MQ=255) aaCTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcgatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctat < 1:1373066‑M1/128‑116 (MQ=255) aaCTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctat < 2:1005275‑M1/128‑116 (MQ=255) aaCTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataagttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggttgttatataaataactctttgtctat > 2:1562046‑M1/1‑13 (MQ=255) cTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattg < 1:54758‑M1/128‑118 (MQ=255) cTAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactcttattctattg > 1:29600‑M1/1‑11 (MQ=255) tAGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatatatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgt < 2:2142843‑M1/128‑119 (MQ=255) aGTTCTAAAactaaaccaacaaaataataatatttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgtt < 2:1970580‑M1/128‑120 (MQ=255) aGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgtt < 2:2236940‑M1/128‑120 (MQ=255) aGTTCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgtt < 1:809144‑M1/128‑120 (MQ=255) gTTCTTACaataaaaccacactataataatttttaattaaagtcctcaatttatctcccgacccccatattcaggactaaaatacaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgttc < 1:425017‑M1/128‑121 (MQ=255) ttCTAAAactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatacaggaaatggggtttttatttaaatcactcttgttctattgttct > 2:1624410‑M1/1‑7 (MQ=255) ctaaaactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgttctat > 1:1953937‑M1/1‑5 (MQ=255) taaaactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgttctatt < 1:1906199‑M1/128‑125 (MQ=255) aaaactaaaacaacaaaataataatttttaattaaagtactcaatttatctcccgaaccccatattccggactaaaatccaggaaatggggtttttatataaatcactctttttctattgttctattt < 1:2024444‑M1/128‑126 (MQ=255) | ATGAAATGAAAGTTGAAAAACCAAAACAAACTAGAACAAAATCAACTAAAGCAAAATCAACAACTTCAAAATCTACAAAATCTACTTCTAAATCAAGTTCAAAATCAACTAAGTCAACTAGTTCTAAAGCAAAATCAACATCTTCTAAACCAAAAACAACTAAAGCTAAATCAACTAGTTCTAAAACTAAAACAACAAAATAATAATTTTTAATTAAAGTACTCAATTTATCTCCCGAACCCCATATTCCGGA > CP016816/462502‑462754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |