| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 437885 = | 1143 (0.540) | 366 (0.210) | 120/204 | 13.4 | 30.1% | intergenic (‑189/+233) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease |
| ? | CP016816 | = 437880 | 776 (0.450) | intergenic (‑184/+238) | JCVSYN2_01985/JCVSYN2_01990 | glycosyl transferase/ABC transporter permease | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 986 total aligned reads displayed.
ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatatatatatatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCTACTCAGCTCTAATTTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑A > 1:2082124/1‑128ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑A > 1:164827/1‑128 TTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCTCTTTC‑‑ATAT > 2:726737/1‑128 tAAAAATATTTAGTTTTAAAATATTAAAAATATAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATAT < 1:1433428/127‑1 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATATAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 2:1834380/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCCCCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 1:963032/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 2:580307/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 1:3450908/1‑128 AAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTAAAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCCATTAATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATA > 1:4081901/1‑128 AAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATA > 2:1963113/1‑128 AATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATAT < 2:3787020/128‑1 tAGTTTTAAAAAATTAAAAATCTAAATTATACACTTTAAAAACTATAAATAAAAACTACAAATATAAGACCAACTCAGATCTAAATTACACCAATTAATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATAT < 1:2932848/127‑1 GTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATAT > 2:4583967/1‑128 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCTCTTGC‑‑ATATATATATATATATATA > 2:1433601/1‑128 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATA > 1:1073839/1‑128 TTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATA > 2:1114358/1‑128 TTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA > 2:3109203/1‑128 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATAT > 2:833123/1‑128 TAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATAT > 2:3861088/1‑128 AAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATA < 2:3986067/128‑1 AAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATAT < 2:2647600/128‑1 TTAAAAATCTAAAATATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATcattaac < 1:3505617/128‑8 AAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTC < 1:3351280/128‑1 ATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACAAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATA > 2:3437620/1‑128 CTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATA > 1:2264968/1‑128 AATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAA < 1:3289016/128‑1 ATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTA < 2:2804864/128‑1 TTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA < 2:1503461/104‑1 TTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATA > 1:1503461/1‑104 TAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATA‑‑ATTAACTCTATATGTTATATTGA > 2:365237/1‑128 TAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATAT < 2:3576153/100‑1 AACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATTCTGATCGCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGG < 1:3751934/128‑1 ctataaAAACTATAAATAAAAACTAAAAAAATAAGACCAACTCATATCTAAAATTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGG < 1:2663809/122‑1 TTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTT > 1:4011759/1‑128 AAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTT < 2:4266524/128‑1 AAACTATAAATAAAAACTACAAAATTCAGACCAACTCACATATAAATTTCACCATTTTCTGCTGATCGCTTGCTTATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTT < 1:2994175/128‑1 AACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCATCTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTG < 1:2813045/128‑1 ATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTT > 2:2117032/1‑128 ATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAAGTTCACCATTTTATGCTGTTCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGC < 2:2399038/128‑1 AATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATAT > 1:3224151/1‑110 TAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCAATAACTCTATAGGTAATATGGATGTTTTTTCTTTGCTTC > 1:3153912/1‑128 AACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATATTTAACTCTAGTGGTTATATGGAGTTTTTTGGTTggaatcatgt > 1:3863027/1‑118 AACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCC < 2:117123/128‑1 CTACAAATTTAAGCCCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTGGGTTTGGTGCATGTCCTA > 1:1991795/1‑128 ACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGCATATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGAGGTTTTTTATTTTCTTAATATCa > 2:2022256/1‑127 ATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAAT < 2:2264968/128‑1 TTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGTAGTTTTTTGATTTGCTTCATTTCCTAAAATA > 2:646813/1‑128 TAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTAGC‑‑ATATATATATATATATATATATAAAATTATCTCTATAGTTAATATGGAGGGTTTTACTTTGCTTCATTTGCTTAAATATT > 1:1314600/1‑128 AAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTAT > 2:930267/1‑128 AAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑‑‑‑‑ATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTT > 1:3557006/1‑128 CAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTT > 2:32935/1‑128 CAACTCAGATCTAAATATCACCATTTTATGCTGATCGCGTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTT < 2:4046648/128‑1 ACTCAGATCTAAAATTCACCATTTTATGCTGATCTCTATC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAA < 1:4422989/128‑1 CTCAGATCTATATTTCACAATTTTATGCTGATCTCTTGC‑‑ATATATATAAATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAAAATTTATTTTAAA < 2:2936339/128‑1 CTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAA < 1:2447644/128‑1 catATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGA‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAA < 2:3502398/125‑1 GATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCTCTTTC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATA < 2:518483/128‑1 ATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATAC < 1:2187692/128‑1 TCTAAATTTCACCATTTTATCCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACA < 1:368408/128‑1 AAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATTGAGGTTTTTGATTTGATTCATTAACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATT > 1:4166394/1‑128 CACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATT > 2:3744348/1‑128 TTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑AGATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTGTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAA < 1:3105130/128‑1 TTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGGTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACATTTTTTATTTattat > 1:1154424/1‑123 TTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAAT > 2:4526768/1‑128 TTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATATCTAATA > 1:4218029/1‑128 TGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGGTTTGATTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTATAATATTT > 2:2469942/1‑128 CTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTTATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTAT > 1:4518129/1‑128 CTGATCGCTTGC‑‑‑‑ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTA < 2:1044788/128‑1 TGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATT < 2:3356696/128‑1 TCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAA > 2:2337061/1‑128 TCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAA < 1:67480/128‑1 CTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGTTAATATGGAGTTTTTTGCTTTGATTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATTAAAAAT > 2:4617020/1‑128 ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTTCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAATATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAAa > 1:237552/1‑127 ATATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAAC < 2:1322667/128‑1 TATTTATATATATATATATATATCATTAAATCTATAGGTAATATTTAGGTTTTTGCTTTGATTCATTTCATAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACT < 2:4424950/128‑1 TATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATTAAACT > 1:3906147/1‑128 ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGGTTTGCTTCATTTCATAAAATTTTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTT > 1:1784272/1‑128 ATATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGATTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTT > 2:4203776/1‑128 TATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTA < 2:2572378/128‑1 TATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATTAAAAATTAAACTTA > 2:3240548/1‑128 ATATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCCTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC < 2:3000507/128‑1 ATATATATATATATATATATCATTAACTATATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAC < 2:1771870/128‑1 TATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACA > 1:2727153/1‑128 TATATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAAAATTTATTAAAAATAAAACTTACA < 1:1003583/128‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTCTAGCTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT < 1:4600959/128‑1 ATATATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTAATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACT > 2:1720279/1‑128 ATAAATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATTAGGAGGTTTATGCTTTGCTGCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAAAGAAACTTACAACTAC < 1:2588230/128‑1 TATATATTTATATCGATAACTCTATAGGTAAAATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTGATTTCCTAATATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTATAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACA < 1:214941/128‑1 ATATATATATATCATTAACTCTCTAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTAtttttgtag < 1:437194/128‑10 ATATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAA < 2:218473/128‑1 TATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATAAAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAAATAACAACTACAAA > 1:505052/1‑128 caATATATATCATTAACTCTAAAGGTAATATGGAGGTTTTTGTATTGCTTCAATTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAA < 1:1890781/126‑1 ATATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTACTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAA < 2:1593318/128‑1 TATATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAA < 2:410752/128‑1 ATATATCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 1:852827/128‑1 ATATATCAATAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAA < 1:769544/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:1259850/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 1:607440/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 1:1715228/128‑1 TCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < 2:3187716/128‑1 ATGTTAAAAAATATTAAGTTTTAAAATATTAAAAATCTAAATTATTAACTTTATAAACTATAAATAAAAACTACAAATTTAAGACCAACTCAGATCTAAATTTCACCATTTTATGCTGATCGCTTGC‑‑ATATATATATATATATATATATAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/438035‑437885‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atatatatatatatatatatatatCATTAACTCTATAGGTAATATGGAGGTTTTTGCTTTGCTTCATTTCCTAAAATATTTATTTTAAAAATACAATTTTTATTTCTAATATTTATTAAAAATGAAACTTACAACTACAAAAATAAGTTTC < CP016816/437880‑437754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |