BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	CP016816	245,230	C→T	A1620V (GCT→GTT)	JCVSYN2_01035 →	ABC transporter permease

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP016816	245,230	0	C	T	99.5%	6574.7 / NA	2065	A1620V (GCT→GTT)	JCVSYN2_01035	ABC transporter permease
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (1070/982); minor base A (4/6); total (1075/990)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.34e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2065 total aligned reads displayed.

ATTTTATATTTTAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGA  >  CP016816/245105‑245354

  tttATATTTTAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTAtt                                                                                                                          >  1:4416816/1‑128 (MQ=255)

  tttATATTTTAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTAtt                                                                                                                          <  1:1866029/128‑1 (MQ=255)

  tttATATTTTAAATGGGCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTAtt                                                                                                                          <  1:4125476/128‑1 (MQ=255)

   ttATATTTTAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTAttt                                                                                                                         >  1:4176186/1‑128 (MQ=255)

    tataTTTTAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTGCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTc                                                                                                                        <  1:1358064/128‑1 (MQ=255)

          ttAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTgg                                                                                                                  >  1:3710059/1‑128 (MQ=255)

             aaTGGTCTTGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGAGGTTATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAAt                                                                                                               <  1:2290298/128‑1 (MQ=255)

             aaTGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAAt                                                                                                               <  1:378218/128‑1 (MQ=255)

               tGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGt                                                                                                             >  2:3160645/1‑128 (MQ=255)

                ggTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGtt                                                                                                            <  2:1725750/128‑1 (MQ=255)

                  tCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGttat                                                                                                          >  2:3921538/1‑128 (MQ=255)

                    aTGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGttatta                                                                                                        <  2:2594379/128‑1 (MQ=255)

                    aTGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGttatta                                                                                                        <  1:3579935/128‑1 (MQ=255)

                       gAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATtaata                                                                                                     >  1:2628596/1‑128 (MQ=255)

                       gAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATtaata                                                                                                     <  2:2769470/128‑1 (MQ=255)

                         gCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTaataat                                                                                                   <  1:4344185/128‑1 (MQ=255)

                              aTCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTaataat                                                                                                   <  1:3391649/123‑1 (MQ=255)

                               tCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTATTAATTACAGt                                                                                             >  1:1245266/1‑128 (MQ=255)

                               tCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGt                                                                                             <  2:4345445/128‑1 (MQ=255)

                                cTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTa                                                                                            >  1:730353/1‑128 (MQ=255)

                                cTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTa                                                                                            >  2:3505692/1‑128 (MQ=255)

                                 tGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTaa                                                                                           <  2:3997605/128‑1 (MQ=255)

                                  gCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAat                                                                                          <  2:1563897/128‑1 (MQ=255)

                                  gCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAat                                                                                          >  1:364069/1‑128 (MQ=255)

                                     tCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAattat                                                                                       <  2:2044760/128‑1 (MQ=255)

                                     tCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAattat                                                                                       >  1:3306721/1‑128 (MQ=255)

                                       tGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAAATACTTTTATAGTTATTTCTATTTGAATGATATTAATAAATACAGTAatattta                                                                                     >  2:1355993/1‑123 (MQ=255)

                                           gatgatgatATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAATACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTc                                                                                 <  2:4633733/128‑1 (MQ=255)

                                              gatgatATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAg                                                                                              >  1:971593/1‑112 (MQ=255)

                                               atgatatgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCt                                                                             <  1:395312/128‑1 (MQ=255)

                                                  atatgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGt                                                                                             >  1:425567/1‑109 (MQ=255)

                                                    atgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACt                                                                        <  2:2425336/128‑1 (MQ=255)

                                                    atgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACt                                                                        >  2:1934937/1‑128 (MQ=255)

                                                     tgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTa                                                                       >  1:61272/1‑128 (MQ=255)

                                                     tgatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTa                                                                       >  2:2473118/1‑128 (MQ=255)

                                                      gatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAg                                                                      <  1:4561593/128‑1 (MQ=255)

                                                      gatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAg                                                                      <  2:2691543/128‑1 (MQ=255)

                                                      gatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAg                                                                      <  2:300394/128‑1 (MQ=255)

                                                      gatTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAg                                                                      <  1:1685020/128‑1 (MQ=255)

                                                        ttAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTa                                                                    >  2:3356190/1‑128 (MQ=255)

                                                         tAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTaa                                                                   >  2:737430/1‑128 (MQ=255)

                                                             aaTATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGtt                                                               <  1:532625/128‑1 (MQ=255)

                                                             aaTATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGtt                                                               <  1:1610723/128‑1 (MQ=255)

                                                               tatTAATAATCATAACTTATTAGCTACATCAATAACTGTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTCTTGGATTGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTaa                                                             <  1:3430247/128‑1 (MQ=255)

                                                                atTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAAt                                                            >  2:1274890/1‑128 (MQ=255)

                                                                atTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAAt                                                            <  2:4137932/128‑1 (MQ=255)

                                                                 ttAAAAATCAATACTTATTAGCTACATCAATAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAAtt                                                           <  2:897264/128‑1 (MQ=255)

                                                                        tCAAAAATTATTAGCTACATCAAAAAATTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGCAATGTTATTAATAAATTCAGAAATTATTACTTCAGCTTTACTATTAATGTTAATTTCAtata                                                    >  1:3513326/1‑128 (MQ=255)

                                                                         cAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGatat                                                   <  2:3630637/128‑1 (MQ=255)

                                                                         cAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGatat                                                   >  2:64798/1‑128 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTGTTTTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATAACTTCAGCTTTACTAGTATTGTTAATTTCAGATAtt                                                  >  1:2939332/1‑128 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAtt                                                  >  2:3820356/1‑128 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAtt                                                  <  2:4208030/128‑1 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAtt                                                  >  1:1060794/1‑128 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAtt                                                  <  1:3233507/128‑1 (MQ=255)

                                                                          aaaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAtt                                                  >  1:4032583/1‑128 (MQ=255)

                                                                           aaaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATAttt                                                 <  1:2390722/128‑1 (MQ=255)

                                                                            aaCTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAg                                                       >  1:2566734/1‑121 (MQ=255)

                                                                               ttattaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGt                                             >  2:236596/1‑128 (MQ=255)

                                                                               ttattaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGt                                             >  1:4629229/1‑128 (MQ=255)

                                                                                 attaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTAAAGTAATTATTACTTCAGATTTTCTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTag                                           >  1:3058432/1‑127 (MQ=255)

                                                                                  ttaGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAAc                                          >  2:455362/1‑128 (MQ=255)

                                                                                   taGCTCCATCAAACACTATAATTAATCAAATTACCTTTAGAGTTATTTCTATTCGAAAGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACt                                         <  1:1001060/128‑1 (MQ=255)

                                                                                       tACATCAAAACCTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGt                                     >  1:3893620/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         cATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTATCTCAGTAt                                   >  2:819043/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         cATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTAt                                   >  2:2130922/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         cATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTAt                                   >  1:2138815/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         cATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTAt                                   >  1:2073990/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         cATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTAt                                   >  2:1424512/1‑128 (MQ=255)

                                                                                           tCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCa                                 >  1:1521039/1‑128 (MQ=255)

                                                                                           tCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCa                                 <  1:2225462/128‑1 (MQ=255)

                                                                                            cAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCaa                                >  2:2238583/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                  cTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTa                                                                       >  1:2833281/1‑83 (MQ=255)

                                                                                                  cTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGttt                          <  2:1031431/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                     taattaatCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATg                       >  1:4461268/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                      aattaatCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGa                      >  2:4270414/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                       attaatCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAt                     >  2:3574752/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                          aatCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGAtttt                  <  2:2542177/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                           atCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTaa                                                             >  2:1173454/1‑84 (MQ=255)

                                                                                                           atCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                 >  1:1156839/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                           atCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                 >  2:3247234/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                           atCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                 >  2:2849924/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                           atCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                 <  2:1637525/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                            tCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTaa                <  2:4079012/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                            tCAAATTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTaa                >  2:3719391/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                             cAAATTACTATTCTAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAAt               <  1:815642/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                               aaTTACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGa             <  1:143641/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                  tACTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGATTATTATTTTAATGAAAg          >  2:2935781/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                   aCTTTTATGGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGc         >  1:887527/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                   aCTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTa                 >  2:3102578/1‑120 (MQ=255)

                                                                                                                    cTTTTATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTTTCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGcg        >  1:2449414/1‑127 (MQ=255)

                                                                                                                     ttttATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATTTAACTCATTATCATCAGATTATTATTTTAATGAAAGAtt       >  2:1829404/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                     ttttATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCtt       <  2:3426205/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                     ttttATAGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCtt       <  2:542260/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                     ttatataGTTATTACTATTGGAAAGTAATTAATAATTTCAGTAATTATTACTTCACCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCACCAGTTTATGATTTTAATGAAAGCtt       <  1:3152494/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                                        tataGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAg    >  2:4432019/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                         ataGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTTCTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAgg   >  1:1795844/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                         ataGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAgg   >  1:1952132/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                          taGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGa  >  1:2502321/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                                          taGTTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGa  >  1:2712547/1‑128 (MQ=255)

ATTTTATATTTTAAATGGTCATGGAGCTTCATCTGCTTCTGGTGATGATGATATGATTAGTAATATTAAAAATCAAAACTTATTAGCTACATCAAAAACTTTAATTAATCAAATTACTTTTATAGCTATTTCTATTGGAATGTTATTAATAATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGA  >  CP016816/245105‑245354

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 15 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`