| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP016816 | 76896 = | 4388 (0.990) | 281 (0.070) | 124/226 | 14.7 | 6.9% | intergenic (‑145/+40) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein |
| ? | CP016816 | = 76892 | 3643 (0.910) | intergenic (‑141/+44) | JCVSYN2_00300/JCVSYN2_00305 | UTP‑‑glucose‑1‑phosphate uridylyltransferase/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 4382 total aligned reads displayed.
AAATTTATATATATTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGA‑TAAATTTTTTAAAGAAAAATA‑TT‑ACAA‑‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATCTT > CP016816/76765‑77019 | aaTTTATATATATTAGTGAACTTTATGATGTATAATACAAATTAAAAATAACTGTAAAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTTTAAAAATA‑TAAATTTTTTAAATAAAAATA‑TT‑TCAA‑‑‑C‑t < 2:2376079/128‑1 (MQ=255) ttATATATATTAGTGAAATTAAGGATTTATAATACAAATTAATAATAACTGTACCCCCAAAATTCCAATTTAAATTCAAATAAAATTATATAAATA‑TAAATTTTTTAAATAAAAATA‑TT‑ACAA‑‑‑C‑tttt > 2:60684/1‑128 (MQ=255) tatattaaTTATTGAACTTAATGATGTTAAAAACAAATTAAAAAAAACTGTACAACCCAAATTACCCTTTAAATTAAAAAAAAATTAAATAAATA‑AAAATTTTTTAAATAAAAATA‑TT‑AAAA‑‑‑C‑ttttt < 2:2546132/128‑1 (MQ=255) tataaataTTATTGAACTTAAGGATTTATAATACAAATTAAAAAAAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTAGAATAAAATTATATAAAGA‑TAAATTTTTTAAATAAAAATA‑TT‑ACAA‑‑‑C‑ttttt < 1:4211062/128‑1 (MQ=255) 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AAATTTATATATATTAGTGAACTTAAGGATGTATAATACAAATTAATAATAACTGTACAACCCAAATTCCCCTTTAAATTCAAATAACATTATATAAAGA‑TAAATTTTTTAAAGAAAAATA‑TT‑ACAA‑‑‑C‑TTTTTTTTTTTTTTTTGGAACTAACATATAATTTTACCAATTATTAGAATTTCAATTTCACAGATGAATTGATTTCTTCTAATAATTTGTCTATATAGATGTTTTTTATATCTAAATCAGTGATCTT > CP016816/76765‑77019 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |