Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA CP016816 530,150 G→A D475D (GAC→GAT JCVSYN2_02440 ← magnesium transporter

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816530,1500GA99.9% 6690.0 / NA 2075D475D (GAC→GATJCVSYN2_02440magnesium transporter
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base A (1072/999);  minor base C (0/2);  total (1073/1002)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.33e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2075 total aligned reads displayed.

ACCATTCCTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTGTCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACTGATGAAATTC  >  CP016816/530025‑530274
                                                                                                                             |                                                                                                                            
 ccATTCCTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATca                                                                                                                           <  2:2550155/128‑1 (MQ=255)
  cATTCCTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATcac                                                                                                                          <  1:2736159/128‑1 (MQ=255)
   aTTCCTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATcaca                                                                                                                         <  1:881916/128‑1 (MQ=255)
   aTTCCTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATcaca                                                                                                                         <  2:3536597/128‑1 (MQ=255)
      ccTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAg                                                                                                                      >  1:801204/1‑128 (MQ=255)
      ccTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAg                                                                                                                      <  1:3797850/128‑1 (MQ=255)
      ccTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAg                                                                                                                      >  1:3110237/1‑128 (MQ=255)
      ccTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTAATAACTTAAAACTAGTACTATATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATGTTTATAATTATCTCAAAg                                                                                                                      >  1:1633167/1‑128 (MQ=255)
        tAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGAt                                                                                                                    >  1:529319/1‑128 (MQ=255)
          aaTATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATTACTATTAACTTGATCAATTATCATATATATATAATAATCACAAAGATta                                                                                                                  >  2:845210/1‑128 (MQ=255)
            tatatTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaat                                                                                                                <  1:1393216/128‑1 (MQ=255)
            tatatTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaat                                                                                                                >  1:3262753/1‑128 (MQ=255)
             atatTTAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaata                                                                                                               <  2:17693/128‑1 (MQ=255)
             atatTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaata                                                                                                               <  2:1625399/128‑1 (MQ=255)
             atatTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaata                                                                                                               >  1:3883052/1‑128 (MQ=255)
              tatTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaataa                                                                                                              <  2:3840062/128‑1 (MQ=255)
                 tAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaataatca                                                                                                           <  1:3452349/128‑4 (MQ=255)
                  aaGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAAc                                                                                                             >  2:3703619/1‑125 (MQ=255)
                  aaGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTg                                                                                                          <  2:469586/128‑1 (MQ=255)
                   aGTTTTTATTATCAATAACATCTTAATTTTTATTAATTAAAACTAGTACTTTAAAACATTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGa                                                                                                         <  2:1132781/128‑1 (MQ=255)
                   aGTATTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATtaataatcaag                                                                                                         <  2:3611971/128‑6 (MQ=255)
                    gTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGat                                                                                                        <  2:1355851/128‑1 (MQ=255)
                     tttttATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATATTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGatt                                                                                                       >  2:1524923/1‑128 (MQ=255)
                     tttttATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAAACTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGatt                                                                                                       >  1:1243354/1‑128 (MQ=255)
                       tttATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGattat                                                                                                     <  2:2319725/128‑1 (MQ=255)
                       tttATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGattat                                                                                                     <  2:1213636/128‑1 (MQ=255)
                        ttattgataaTAAAAACTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGattatt                                                                                                    >  1:2884626/9‑128 (MQ=255)
                              tCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACAtt                                                                                              >  2:1051176/1‑128 (MQ=255)
                              tCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACAtt                                                                                              >  2:2788092/1‑128 (MQ=255)
                               cAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATta                                                                                             >  1:2306567/1‑128 (MQ=255)
                               cAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATta                                                                                             >  2:547264/1‑128 (MQ=255)
                               cAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCAAAAATATTAATAACATTATTATTAAAATta                                                                                             >  1:724915/1‑128 (MQ=255)
                                aaTAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATtaa                                                                                            >  1:259100/1‑128 (MQ=255)
                                  tAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATtaata                                                                                          >  1:2219435/1‑128 (MQ=255)
                                   aagaTCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAAACTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATtaataa                                                                                         <  1:1517996/125‑1 (MQ=255)
                                    aCATCTGAATTTTTATAACTAAAAACTAGTACTTTATAACATTTTTTAGTATAACTATTAACTAGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAAAATAATTATTAACATTAATaaa                                                                                        >  2:3484347/1‑128 (MQ=255)
                                     cATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATaaaa                                                                                       >  1:332017/1‑128 (MQ=255)
                                      aTCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTTATTATTAACATTAATAAAAc                                                                                      >  1:3405037/1‑128 (MQ=255)
                                       tCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATaaaaat                                                                                     >  1:943642/1‑126 (MQ=255)
                                        cTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTa                                                                                    <  2:3240363/128‑1 (MQ=255)
                                         tGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAg                                                                                   >  1:2026635/1‑128 (MQ=255)
                                          gAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGt                                                                                  >  1:2179847/1‑128 (MQ=255)
                                           aaTTTTTCTAACTTAAATCTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATAAATTATCATCTTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTa                                                                                 <  2:3372005/128‑1 (MQ=255)
                                            aTTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTaa                                                                                >  1:3179553/1‑128 (MQ=255)
                                             tttttATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAAt                                                                               <  2:1415663/128‑1 (MQ=255)
                                             tttttATAACATAAAACTATTCCTTTAAAAACTTTTTTAGTATAAATATTAACTTGATCAATTATAATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAAt                                                                               <  2:2377019/128‑1 (MQ=255)
                                              ttttATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAAtt                                                                              >  2:1846280/1‑128 (MQ=255)
                                              ttttATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAAtt                                                                              >  1:2806385/1‑128 (MQ=255)
                                                  ataACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTa                                                                          <  2:1473036/128‑1 (MQ=255)
                                                      cTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAatat                                                                      <  1:3718827/128‑1 (MQ=255)
                                                       ttAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTATTTTCTAATAtt                                                                     >  2:1989935/1‑128 (MQ=255)
                                                       ttAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATAtt                                                                     >  1:2107415/1‑128 (MQ=255)
                                                       ttAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATAtt                                                                     >  1:1724564/1‑128 (MQ=255)
                                                        tAAAACTATTAATTTATAACCATTTTTAGAATAACTAATAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATAttt                                                                    <  2:2612031/128‑1 (MQ=255)
                                                        tAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATAttt                                                                    >  1:296920/1‑128 (MQ=255)
                                                         aaaaCTAGTACTTTTTAACCATTTTTAGTATAACTATTAAATTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATttc                                                                   <  1:2421298/128‑1 (MQ=255)
                                                         aaaaCTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATttc                                                                   >  1:1563715/1‑128 (MQ=255)
                                                         aaaaCTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATttc                                                                   >  2:272000/1‑128 (MQ=255)
                                                         aaaaCTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACACTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATttc                                                                   >  2:609421/1‑128 (MQ=255)
                                                         aaaaCTAGTACTTTATAAACTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATttc                                                                   <  2:2071347/128‑1 (MQ=255)
                                                             cTATTACTTTATAACATTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTtcttct                                                               <  1:178223/128‑1 (MQ=255)
                                                              tAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTa                                                              >  2:3765216/1‑128 (MQ=255)
                                                               aGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTaa                                                             <  1:2648594/128‑1 (MQ=255)
                                                                gTACTTTATAACATTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTaaa                                                            <  1:1854318/128‑1 (MQ=255)
                                                                   cTTTATAGCCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTATTTTCTAATATTTCTTCTACACTa                                                         >  2:764113/1‑128 (MQ=255)
                                                                    tttATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTAc                                                        <  1:2372872/128‑1 (MQ=255)
                                                                     ttATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTAcc                                                       >  2:3170064/1‑128 (MQ=255)
                                                                     ttATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTAGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTAcc                                                       >  2:2238541/1‑128 (MQ=255)
                                                                     ttATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTATATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTaaa                                                            >  1:1170030/1‑123 (MQ=255)
                                                                       ataACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCtt                                                     >  1:456268/1‑128 (MQ=255)
                                                                         aaCCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTa                                                   <  2:3312811/128‑1 (MQ=255)
                                                                          aacTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAg                                                  <  1:1084584/126‑1 (MQ=255)
                                                                             tattttAGAATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTGGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTaa                                               <  2:3019225/126‑1 (MQ=255)
                                                                              tttttAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAAt                                              >  2:2861901/1‑128 (MQ=255)
                                                                               ttttAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAAtt                                             >  1:3619911/1‑128 (MQ=255)
                                                                                tttAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTa                                            <  1:3041532/128‑1 (MQ=255)
                                                                                 ttAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTaa                                           >  2:3123764/1‑128 (MQ=255)
                                                                                 ttAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATGAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTaa                                           >  1:1932398/1‑128 (MQ=255)
                                                                                  tAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTaaa                                          <  2:2932055/128‑1 (MQ=255)
                                                                                          cTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTaga                                  >  2:922413/1‑128 (MQ=255)
                                                                                           tATTAACTTGATCAATTCTCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTagag                                 <  1:634023/128‑1 (MQ=255)
                                                                                           tATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTATAAGATTagag                                 >  2:2466075/1‑128 (MQ=255)
                                                                                              tAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTa                              <  2:3425183/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                aCTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTAtt                            <  2:1569962/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                     aTCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAAt                       <  1:1304092/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                     aTCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAAt                       >  1:3373027/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                      tCAATTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTAAAAATATTTCTAATAAAATACCTTTAGTAATTAAAATATTAAAGAAATTAAAAtt                      >  2:1702714/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                        aaTTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTaa                    >  1:582241/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                        aaTTATAATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTaa                    <  2:1924319/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                         aTTATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAAt                   >  2:407539/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                          ttATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATc                  >  1:1003373/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                           tATCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTTATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCa                 <  2:2199450/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                             tCATATTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCaaa               <  2:1277049/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                tatTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGAt                                      <  1:2472334/102‑1 (MQ=255)
                                                                                                                tatTTTTATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACt            >  1:1455785/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                tatTTTAATAATTATAACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACt            <  1:2536715/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                    tttATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACtgatg        >  2:692926/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                     ttATAATTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACtgatga       <  2:2135198/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                     taataataATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACtgatga       <  2:2669852/126‑1 (MQ=255)
                                                                                                                         aaTTATCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACTGATGAAAtt   <  1:3532100/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                             |                                                                                                                            
ACCATTCCTAAATATATTAAGTTTTTATTATCAATAACATCTGAATTTTTATAACTTAAAACTAGTACTTTATAACCTTTTTTAGTATAACTATTAACTTGATCAATTATCATATTTTTATAATTGTCACAAAGATTAATAACTTGATTATTAACATTAATAAAACTAGTAATTTCTAATATTTCTTCTAAACTACCTTTAGTAATTAAAAGATTAGAGCTATTAAAATTAATCAAAACTGATGAAATTC  >  CP016816/530025‑530274

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: