| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP016816 | 311,175 | Δ8 bp | intergenic (‑98/‑209) | JCVSYN2_01300 ← / → JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP016816 | 311157 = | 127 (0.040) | 2095 (0.740) | 214/214 | 0.0 | 95.7% | intergenic (‑80/‑234) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| ? | CP016816 | = 311148 | 79 (0.030) | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
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TTTAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/311301‑311157‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatatatatatatatataATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < CP016816/311148‑311022 AATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATAT > 2:6284852/1‑128 AATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATAT > 2:5956309/1‑128 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1:3360247/1‑128 ATATAATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTG < 1:1006514/128‑1 ATAATGAATGGATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGT < 1:1635203/128‑1 AATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < 1:2356011/128‑1 AATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < 2:2383016/128‑1 AATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < 2:3621689/128‑1 TTTAATAATTTTTCAAATTACTTTTTTAAATAAAAATAGATTTTATTAGTAAATAAGTAGTATATTTACTATTTTTTTACTTTATAAACGGTTGCTATTATACCATATTTTCATTTACATATTGCAT‑‑TATATATATATATATATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP016816/311301‑311157‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tatatatatatatatataATGAATGTATGTTATATATGTTTTGAATCGTATGTAACAAGTATTTTATTTTTTAATAAGGGGTGTGTAAAATGAAAAAGTTAATTACAATTTTAAGTTCATTTGGATTAGTTATTACAACTGGTAC < CP016816/311148‑311022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |