| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | = 165049 | 5657 (1.170) | 200 (0.050) | 85/222 | 32.6 | 3.9% | intergenic (+13/‑529) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser |
| ? | CP016816 | = 165050 | 4841 (1.130) | intergenic (+14/‑528) | JCVSYN2_00665/JCVSYN2_00670 | tRNA N6‑adenosine(37)‑N6‑threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit TsaB/tRNA‑Ser | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 5822 total aligned reads displayed.
AATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAA > CP016816/164922‑165176 | ataaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCtt > 2:3336985/1‑128 (MQ=255) taaATTATTATAAATTTGATTATTTAAAACATTATTTATATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATTATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTa < 1:6856935/128‑1 (MQ=255) taaATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCtaa < 1:9118195/128‑3 (MQ=255) aaaTGATTATCTATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTAAg < 1:2458004/128‑1 (MQ=255) aaaTGATTATCAATTTTATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTAAg < 1:2095288/128‑1 (MQ=255) aaaTGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAg < 2:10075377/128‑1 (MQ=255) aaaTGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTT‑AAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGa > 1:6532771/1‑128 (MQ=255) aaTGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGa < 2:4950366/128‑1 (MQ=255) tGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGaaa < 2:1143898/128‑1 (MQ=255) aTTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGt < 1:66864/128‑1 (MQ=255) ttATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTc < 2:7700532/128‑1 (MQ=255) tATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCt > 1:4493459/1‑128 (MQ=255) cAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCtttt < 1:3136868/128‑1 (MQ=255) cAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCtttt < 2:316009/128‑1 (MQ=255) cAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCtttt < 2:8827870/128‑1 (MQ=255) aTTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCtttttt > 1:2769958/1‑128 (MQ=255) ttGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTg < 1:1036187/128‑1 (MQ=255) tGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGt < 2:2994604/128‑1 (MQ=255) tGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTATTTTGt > 1:7578397/1‑128 (MQ=255) attattTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTat < 2:7331140/128‑1 (MQ=255) attTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaa < 1:7235878/128‑1 (MQ=255) tAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTattaatta > 2:981927/1‑128 (MQ=255) aaaaCATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAATAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAattat < 2:1328012/128‑1 (MQ=255) aaaCATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAattatt > 2:1536936/1‑128 (MQ=255) aaaCATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAattatt < 1:3508102/128‑1 (MQ=255) aaCATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAAttattt > 1:8950607/1‑128 (MQ=255) cATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAAttatttat > 2:6972743/1‑128 (MQ=255) attattTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTtata < 2:211413/128‑1 (MQ=255) ttattTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTatat < 2:5661377/128‑1 (MQ=255) tttAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATAtctc > 1:5089824/1‑128 (MQ=255) tAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCt < 2:6029651/128‑1 (MQ=255) aGATTTAAAAAAACATTTTATTATAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCtt < 1:5522194/128‑1 (MQ=255) gATTTAAAAAATCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCATTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCttt < 2:2282680/128‑1 (MQ=255) gATTTAAAAAAACGTTTTATTAATATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTATCTTAGAAAGTCTTTTTTTTTATTAATAATTTATATATCCttt > 1:9885908/1‑128 (MQ=255) gATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCttt < 2:471429/128‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATTATTATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAATAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc < 1:8377625/128‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc < 1:1102875/128‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc > 1:4077626/1‑128 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc < 1:60896/128‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc < 2:9200732/128‑1 (MQ=255) aTTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTc < 1:4954310/128‑1 (MQ=255) tttAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCt > 1:4267767/1‑128 (MQ=255) ttAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTa < 1:1706770/128‑1 (MQ=255) aaaaaCATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTa < 2:7888710/128‑1 (MQ=255) caatttCTTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTGTATATATCAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTa < 1:5713097/125‑1 (MQ=255) cATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTa < 1:2594471/128‑1 (MQ=255) cATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTa < 1:706086/128‑1 (MQ=255) aTTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAATTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTaa < 2:2487909/128‑1 (MQ=255) ttttATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAAt < 2:8065568/128‑1 (MQ=255) tttATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATACTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAAtt < 2:7509016/128‑1 (MQ=255) ttattaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATAtc > 2:9583774/1‑106 (MQ=255) tattaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGt > 1:8721756/1‑128 (MQ=255) tattaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGt < 2:90345/128‑1 (MQ=255) attaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTa < 2:2633529/128‑1 (MQ=255) attaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTATAATTGTa > 1:4714/1‑128 (MQ=255) ttaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAt > 2:418701/1‑128 (MQ=255) ttaAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAt > 2:2793324/1‑128 (MQ=255) taAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAtt > 1:5292828/1‑128 (MQ=255) aaaaTTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAtta > 1:10005102/1‑128 (MQ=255) aaaTTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttac < 2:3767017/128‑1 (MQ=255) acgatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTAttactttact < 2:7158115/126‑1 (MQ=255) tgatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTa < 1:10165452/128‑1 (MQ=255) gtttataataAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAg < 1:2284735/124‑1 (MQ=255) gatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAg > 2:5842459/1‑128 (MQ=255) gatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAg < 1:3340544/128‑1 (MQ=255) gatgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAg < 2:8662624/128‑1 (MQ=255) atgatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGt < 1:1879970/128‑1 (MQ=255) gatAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATAAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTg > 2:190265/1‑128 (MQ=255) aataaATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGata < 2:4000899/128‑1 (MQ=255) aataaATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGata < 2:4509337/128‑1 (MQ=255) taaattaaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACt < 1:2983564/99‑1 (MQ=255) tattaaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTAAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAatat < 1:9353626/127‑1 (MQ=255) ttaaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATAttt < 2:1734586/128‑1 (MQ=255) taaatCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTa < 1:7801076/128‑1 (MQ=255) atCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGtt < 2:6207528/128‑1 (MQ=255) atCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGtt > 1:8559470/1‑128 (MQ=255) ccTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTc < 1:5930692/128‑1 (MQ=255) acTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTc < 1:6267868/127‑1 (MQ=255) atatataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTaa > 2:6605317/1‑128 (MQ=255) tatataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAAt < 1:9689694/128‑1 (MQ=255) tatataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAAt < 2:937715/128‑1 (MQ=255) atataAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAAtt < 2:6799574/128‑1 (MQ=255) tattaaGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTAATTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTAt < 2:10448932/124‑1 (MQ=255) aaaaGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTATTTGATAATATTTAGTTTCATTTATTTATCg > 1:1536420/1‑128 (MQ=255) aaaGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTTATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCga > 1:8167608/1‑127 (MQ=255) aGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATATCCTTTCTATTTACTTTAATTTTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCgaaa > 2:3547455/1‑125 (MQ=255) gTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACt > 2:5132742/1‑128 (MQ=255) atttaAAAAAAGACTTTCTTAGATAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCTCACTTGTAt > 2:5482754/1‑128 (MQ=255) atttaAAAAAAGACTTTCTTAGATAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTAt < 2:4336710/128‑1 (MQ=255) ttaAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCATTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTATACTAGTTTATAATATTTAGTTTAATTAATTTATAGCACTTTTATGa > 1:7405194/1‑128 (MQ=255) taAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCTCACTTGTATGaa > 1:3887838/1‑128 (MQ=255) aaaaaaaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAAt > 2:5314717/1‑128 (MQ=255) aaaaaaaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATATACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAAt > 1:8004707/1‑128 (MQ=255) aaaaaaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAAtt > 2:8276312/1‑128 (MQ=255) aaaaGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAg < 2:10236806/128‑1 (MQ=255) aGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTaa < 1:371479/128‑1 (MQ=255) aGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTaa > 1:9509840/1‑128 (MQ=255) gACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAg < 2:8482306/128‑1 (MQ=255) tCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTTATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATATATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGaaact > 2:6398098/1‑128 (MQ=255) ttAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGaaactaa > 1:1343883/1‑128 (MQ=255) | AATAAATGATTATCAATTTGATTATTTAAAACATTATTTAGATTTAAAAAAACATTTTATTAAAATTGATGATGATAATAAATTAAATCCTTTATATATAAAAAGTTTTATTTAAAAAAAGACTTTCTTAGAAAGTCTTTTTTTGTATTAATTATTTATATCTCCTTTCTATTTACTTTAATTGTATTACTTTACTAGTTGATAATATTTAGTTTCATTAATTTATCGCACTTGTATGAATTAGTAAGAAACTAA > CP016816/164922‑165176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |