New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP016816 | = 311148 | 137 (0.080) | 551 (0.270) +TATA |
111/192 | 17.8 | 75.2% | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
? | CP016816 | 311149 = | 203 (0.100) | intergenic (‑72/‑242) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 709 total aligned reads displayed.
GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/311022‑311148 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311149‑311275 |||||| GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑T > 1:1115284/1‑128 GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑T > 2:253708/1‑128 GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑T > 1:559439/1‑128 TACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTCTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATAC‑AA‑‑TA > 2:1203379/1‑128 ACCAGTTGTAATAACTAATACAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTAATAAAAAATAAAATACTATTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TAT > 2:828299/1‑128 CAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATAT > 2:756046/1‑128 CAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATAT > 1:122213/1‑128 GTTGAAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAAATGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATAT < 1:692238/128‑1 GTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATA > 2:2434077/1‑128 GTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATA > 2:147218/1‑128 GTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATA > 1:1665147/1‑128 TAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTCAAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAATATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACAAACAATC‑AT‑‑TATATATAGAT > 2:4015427/1‑128 AATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATA > 1:3490020/1‑128 ATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACTATTCAAAAAATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATAAATATAT > 2:1702439/1‑128 TAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATA > 2:1298294/1‑128 CTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATAT > 2:2645433/1‑128 CTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATAT > 1:4416157/1‑128 TAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATA > 2:3823899/1‑128 TAATACAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATA > 1:4059385/1‑128 ATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATA > 2:3478114/1‑128 TCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATAT > 2:1119624/1‑128 TCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATAT > 2:3181051/1‑128 CCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATA > 1:2197940/1‑128 tAAATTAACTTAAAATTGTAATTAAATTTTTAATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATAATATTAAAAAAATATATAAAATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATAT < 1:2237289/127‑1 CAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACTATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATAT < 2:2241534/128‑1 AAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATA > 1:1410750/1‑128 AATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATAT > 1:104158/1‑128 ATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATA > 2:2077452/1‑128 TGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACCCCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATTTATATATATAT > 1:2578791/1‑128 TGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAAAATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATAT > 1:3416182/1‑128 aataAAAATTTTAATTAACTTTTTCATTTTAAACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA < 2:4345073/124‑1 ACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATAaa > 2:1043341/1‑126 ACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA > 2:2756524/1‑128 CTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TAt > 1:3351322/1‑127 TTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATAattc > 2:675285/1‑124 TTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TAta > 1:1868508/1‑126 TTAAAATTGTAATTAAATTTTTCATTTTACAAACACCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATAAGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATAatgaatgt < 1:4273073/128‑9 TTAAAATTGTAATAAACTTTTTCATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAATAATTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TAta < 2:1638017/128‑3 AAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TAtaatg > 2:3268543/1‑123 AAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑Aaaaa > 2:1743156/1‑124 AAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AA‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TAtaatt > 2:3938196/1‑123 tttTAATTAAATTTTTAATTTTACACACACCTTATTAAAAAATAAAAATCTTGTTACATACGATTAAAAACATATATAACATAAATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TAtaatgcaa < 1:3179271/125‑9 TAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AA‑‑‑TCTATATGTAAAa > 1:3544365/1‑127 aaaTTTTTCATTTTAGACACACCTTATTAAAAAATATAATACTTGTTACATAATATTCAAAAAATATATAAAATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATG < 1:4519395/125‑1 TTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATAATTA‑AA‑‑‑GCAATATTTAAATTAAAA > 2:2848031/1‑128 CATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GAAATATCTAAATTAAAAAATG > 1:2430002/1‑128 taTTACACACACATTATTAAAAAATAAAATAATTTTTATATACTATTCAAAAAATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGT < 2:3755200/126‑1 TTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑TAAATATATAAATCAATATATta > 2:3516747/1‑126 TTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AA‑‑‑TCAATATTTAAATTAAAATATttta > 2:1787844/1‑124 TTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATTAAAATGAAAATATttt > 2:187525/1‑125 taaacaaaaCTTATTAAAAAATTATATATTTGTTACATAAGATTCAAAAAATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTA < 2:4293855/119‑1 ACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑AA‑A‑‑‑‑‑AAATATAAAAAAAAAAATATTATATAATA > 2:2190839/1‑128 CACACAACTTATTAAAAAATATAATAATTTTTACATACTATTCAAAAAATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAAT < 2:2795934/128‑1 ACACCCCTAATTTAAAAATATAATACTTATTACATACGATTCAAAACATATATAACATAAATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATA < 2:1444012/128‑1 CCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AA‑‑‑TCAATATGTAAATCAAAATATGATATAATAt > 1:2826774/1‑127 CCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCA > 2:1387493/1‑128 aCTTATTAAAAAATAAAATAATTGTTACATAATATTAAAAAAATATATAAAATACATTA‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAAC < 2:3971609/127‑1 TTATTAAAAAATAAAATACTTTTTTAATTCTATTCTAAAAATATATAAAATTCAATC‑AT‑‑TATATATATATAAATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCG < 2:2306156/128‑1 TATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AA‑‑‑TAAATATATAAAAAAATATATTTTATAATAtaaaaagt > 1:2536630/1‑120 AAAAAATAATATACTTTTTATATAATATTCAAAAAATATATAAAATATATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTT < 1:2735172/128‑1 AAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TATATAAATCAATATGTAAATGAAAATATGTTATAATATCAACCGT > 2:516982/1‑128 AAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GAAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGAAACAGTATAT > 1:1313070/1‑128 AAAATAAAATATTTTTTAAATAATATTTAAAAAATATATAAAATATATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTAT < 1:756046/128‑1 AAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑AAAATATGTATATTAAAATATGGTAAAATAtaaaagatttat > 2:294966/1‑116 AATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑TCAATATTTAAATTAAAATATGATATAATATAAACAATTTATAAAt > 1:4323017/1‑127 ATAAAATAATTTTTAAATAATATTATAAAAATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGT < 2:3071203/128‑1 AAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GAAATATGTAAATGAAAATATGATATAATATCAACCGTTTATAAAGTA > 2:3421599/1‑128 TTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AA‑‑‑TAAATATATAAATAAAAATATGTTATAATATAAACATTTTATAATGTAAAAAAATA > 2:626539/1‑128 TTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATTTAAAAGAAAATATGGTATAATATCCACCGGTTATAAAGTAAAAAAATACTA > 1:4119721/1‑128 taaattatATTAAAAAAATATATAATATAAATTA‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAA < 1:814281/120‑1 TACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCTATATGTAAAATAAAATATGTTATAATAGCAACATTTTATAAAGTAAAAATATAat > 1:3720346/1‑126 atataatATTAAAAAAATATATAAAAAACATTCTATA‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTA < 2:3351322/121‑1 agATACTATTAAAAAAATATATAACATACATTA‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTA < 1:3629639/126‑1 catattATTAAAAAAATATATATCATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAA < 1:3019417/122‑1 taatATTCTAAAAATATATAAAATATATTT‑TTTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAAT < 1:1978267/124‑1 TACTATTCAAAATATATATAAAATAAATTA‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAAT < 1:3855133/128‑1 aatATTAAAAACATATATAACATAGATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATA < 2:3646802/125‑1 tATTCTAAACATATATAATATAGATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATA < 2:479963/127‑1 tttAAAAAATATATAAAATAAATTT‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACT < 1:4180671/125‑1 CAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GAAATATTTAAATGAAAATATGGTATAATACAAAAAGTTTATAAAGTAAAAAAATATTAAATAaaataatt > 1:159632/1‑120 CAAAAAATATATAACATAAATTT‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTT < 1:2967543/128‑1 AAAACATATATAACATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACT < 2:3712577/128‑1 aaaATATATAAAATACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTA < 2:1939567/125‑1 ACATATATAACATACATTC‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑TCAATATGTAAATAAAAATATGGTATAATATAAAACGTTTATTAATTAAAAAAATATTAAATATAATACTTATat > 1:399419/1‑126 TATAACATACATTC‑AT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGAAAATGAAAATATTTTATAATAGAAACATTTTATAAAATAAAAAAATAGTAAATAAACTACTTATTTAATAAaa > 1:2672144/1‑126 atataATAAATTT‑AT‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAAT < 1:1746000/123‑1 AACATACATTC‑AT‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGTTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTAATAATAAAA > 2:3909465/1‑128 ACATTC‑ATTATATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑TAAATATGTAAATGAAAATATGTTATAATATCAACATTTTATAAATTAAAAAAATAGTAAATATAATACTTATTTACTAATAAAAT > 1:3916671/1‑128 C‑AT‑‑TATATATATATATGTATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATATCAACCTTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATAATAATTATTTACTAATAAAATCTATTTT > 1:937377/1‑128 ttaTATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTT < 1:1502910/125‑1 ttaTATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTT < 1:3268543/125‑1 T‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTA < 1:633848/128‑1 T‑‑TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTA < 1:48793/128‑1 tataaATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAATATATTTTATAATAGCAACCTTTTATAAAGTTAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTT < 2:4456261/123‑1 aTATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GAAATATGTAAATTAAAATATGTTATAATAGCAACCTTATATAAAATAAAAAAATAATAAATAAACTACATATTAACTAATAAAATCTAATTTTA > 1:2111706/2‑128 TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGTTATAATAGAAACATTTTATAAAGTAAAAAAATATAATATATACTACTTATTTAATAATAAAATATATTTTTAT > 2:1581914/1‑128 TATATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTAT < 2:4087976/128‑1 tTATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAGAATCTATTTTTATT < 1:3080355/127‑1 TATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑TCAATATTTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCTTATATAAATTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAAAAAAATCTATTTTTATTT > 1:3780898/1‑128 TATATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAATATCTATTTATATTT > 2:359112/1‑128 |||||| GTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTC‑AT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP016816/311022‑311148 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATATATATATATATATATATA‑‑TA‑AT‑‑‑GCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311149‑311275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |