| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP016816 | 87906 = | 610 (0.290) | 1270 (0.670) | 210/228 | 1.9 | 71.6% | intergenic (+33/‑827) | JCVSYN2_00345/JCVSYN2_00350 | hypothetical protein/50S ribosomal protein L31 |
| ? | CP016816 | = 87902 | 457 (0.240) | intergenic (+29/‑831) | JCVSYN2_00345/JCVSYN2_00350 | hypothetical protein/50S ribosomal protein L31 | |||||
Only 100 of 2076 total aligned reads displayed.
GTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTAGTTC > CP016816/87779‑88033 | tgtgtaacaaaagtggttattgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccat < 1:2068463‑M1/1‑1 (MQ=255)tgtgtaaaaaaagtggttattgatttgcaagtaaatttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaataattagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccat > 2:3856237‑M1/128‑128 (MQ=255) taacaaaagttgttattgagtttcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccattttt > 2:1250636‑M1/124‑128 (MQ=255) caaaagtggttattgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccatttttttt < 1:4424644‑M1/8‑1 (MQ=255) caaaagtggttattgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccatttttttt < 1:150016‑M1/8‑1 (MQ=255) caaaaggggttattgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattgtttaataatccatttaaatc > 1:1080756‑M1/121‑123 (MQ=255) gTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTAAAATGAATATTTAGATTTTGAATATCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAttttttttttt‑tt < 2:4491470/128‑1 (MQ=255) tGGTTATTGAGTTGCGAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAatttttttttt‑tta > 1:3896022/1‑127 (MQ=255) tGGTTATTGAGTTGAAAGTAAATTTAAAATTGATAATAAAATTTATATTTATGGAAATTCAAATGAATATTTATATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAttttttttttt‑ttt < 1:4521230/128‑1 (MQ=255) aagttgttattgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccatttttttt‑ttt > 2:1589253‑M1/118‑128 (MQ=255) aagtggttattgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccatttttttt‑ttt < 2:2643489‑M1/11‑1 (MQ=255) gTTATTGAGTTGCAATTAAAGTTAAAATTGATAATAAAATTTATATTAATGGAAATTCAAATGAATATTTATATTTTGAATATCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAttttttttttt‑ttaat < 2:2786816/128‑4 (MQ=255) ttATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTTATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATTAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCAttttttttttt‑ttaata < 2:3628750/128‑5 (MQ=255) ttGAGTTTCAAGTAAAGTTCAAATTGTTAATAAAATTGATATTAATTGAAATTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATATCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATaaa < 2:2256631/128‑1 (MQ=255) tGAGTTGCAATTAAAGTTAAAATTGTTAATAAAATTTATATTCATGGAAATTAAAATTAAAATTTATATTTTTAATATCTTATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATaaaa < 2:1344012/128‑1 (MQ=255) tGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATaaaa > 2:1865126/1‑128 (MQ=255) attgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATaaa < 2:4317249‑M1/19‑1 (MQ=255) attgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATaaa < 1:3797206‑M1/19‑1 (MQ=255) ttgagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATaaaa < 1:3579200‑M1/20‑1 (MQ=255) gagttgcaagtaaatttcaaatttataataaaattgatattcatggaaagtcaaattaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAg > 2:725508‑M1/108‑128 (MQ=255) gagttgcaagtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAAtaaaaat < 1:1642795‑M1/22‑2 (MQ=255) tgaattAAAGTTCAAATTGATTATAAAATTGTTATTCATTGAAAGTAAAATTAATATTTATTTTTTGAATAGCTTTTTTAAATTGATTATTAAACAATCCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTca < 2:2043505/123‑1 (MQ=255) aaattAAATTTCAAATAGATAATTAAATTTTAATTTATTGAAATTAAAATGATTATTTTTATTTTGTATATCTTATTTAAATTGATTATTAAACAATCCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTcac < 1:3182276/124‑1 (MQ=255) caagtaaagttaaaattgataataaaattgataatcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTcac > 2:2493195‑M1/101‑128 (MQ=255) tAAAGTTTAAATTGTTAATAAATTTGTTATTCATTGTAAGTAAAATTAATATTTAGATTTTGAATTGCTGATTTAAATGGATTATTAAAAAATCAA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACTTat < 1:3103420/128‑2 (MQ=255) aattaaatttaaaatttataataaaatttatattcatggaaattcaaatgaatatttatattttgaatagctgatttaaatggattattaaaaaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACtcact > 1:1563938‑M1/100‑127 (MQ=255) agtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACAt < 1:1154963‑M1/30‑1 (MQ=255) agtaaagttaaaattgataataaaattgatattaatggaaattcaaattaatatttatattttgaatagcttatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACAt > 1:274828‑M1/99‑128 (MQ=255) gtaaagttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATa > 1:371387‑M1/98‑128 (MQ=255) aGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGATGATTTAAATGTATTATTAAACAATCCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAAAcaaaaataatat > 2:816079/1‑117 (MQ=255) cAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTA‑AATAAAAAAAATCACATaatatact > 1:1215784/1‑122 (MQ=255) ttcaaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGt > 1:483260‑M1/92‑128 (MQ=255) tatttttaataaAATTTTTATTTATTGTAATTTAAATTTAAATTTATTTTTTTTATATCTTATTTTAATTGTTTATTAAAAAATCAA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCaa < 1:142626/122‑1 (MQ=255) catatttataataaaattgatattcatggaaattcaaatgaatttttatattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTc > 2:2948938‑M1/90‑128 (MQ=255) caaattgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAATActaaaataatttatta < 2:1976619‑M1/39‑8 (MQ=255) tgataataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTAAAATAAGTTAGTCAatta < 1:2621033‑M1/44‑2 (MQ=255) ataaaaaaATGATAATAATTGAAATACAAATTAAAAATTATATTTTTAATATCTCATTAAAATGGATTATTAAACAAAACA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGa < 2:1720615/124‑1 (MQ=255) taaAATTCATATTCTAGTAAAGTAAAATTAATAATTATATTTTTAATATCTGATTTAAATTGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGat < 2:3189144/128‑1 (MQ=255) aataaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAATAATCACATAATTTATACAAttgctat < 2:2868489‑M1/48‑4 (MQ=255) aataaaattcttattcatggaaaggcaaatgtatatttagattttgaatatctgatttaaatggagaattaaacaaaccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGat > 2:900064‑M1/81‑128 (MQ=255) aaaattgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGAATCACATAAGTTAATCAATTGCCattat < 1:2174938‑M1/51‑1 (MQ=255) attgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAAAAAAAATACTCACATAAGTGAGTCAATTTCGATTATtta < 1:3975729‑M1/54‑1 (MQ=255) attgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatcaaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCAAATAATTGATTAAATATAGATTATtta < 2:3289215‑M1/54‑1 (MQ=255) ttattattgtaaGGCAAATTTATAATTTTATTTTTTATACCTGATTTAAATGGATTAATAAACAAATCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATttaattat < 1:897034/118‑1 (MQ=255) tgatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAATACTAACATAATTTAGTAAATTGAAATTATttaat < 1:1316781‑M1/56‑1 (MQ=255) gatattcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATttaatt > 2:1172194‑M1/72‑128 (MQ=255) ttcatggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATttaattatta > 2:613553‑M1/68‑128 (MQ=255) aatggtaagtcaaatgaatatttatattttgaatatctgttttaaatggattaataaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATttaattattaat > 2:3794104‑M1/66‑128 (MQ=255) atggaaagtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAAACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATttaattattaatta < 1:3659061‑M1/64‑1 (MQ=255) atggaaaatcaaattaatatttagatttttaatagcttatttaaatggattaataaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATttaattattaatt > 2:468316‑M1/65‑128 (MQ=255) attaaaattaatatttagtttttgaatatctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCtt > 1:2224805‑M1/59‑128 (MQ=255) ttcaaaataatatttacatttttaattgcttatttaaatggttttttaaacaatacaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCttt > 1:4337886‑M1/58‑128 (MQ=255) gtcaaatgaatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccatttttttt‑ttt > 1:2362798‑M1/58‑68 (MQ=255) tgaaatgaataattatatttttaatatctgaattaaattgtttattaaaaaattcaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTtg > 2:1439842‑M1/57‑128 (MQ=255) ataaattttATATTTTTAATATCTCATTTAAATTGATTATTAAATAATACA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGTCTAACATATTTGATTAAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTTATGaa < 1:3517754/122‑1 (MQ=255) ttaattattagttttttaatatctgatttaaattgtttattaaacaattcaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGaa > 2:2330866‑M1/52‑128 (MQ=255) attatttttattttgaatagcttatttaaattgattaattaacaatccaTTTTTTTT‑TTT‑‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAt > 2:2571917‑M1/50‑128 (MQ=255) aatatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTTAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTTATGAACt < 2:2422895‑M1/79‑1 (MQ=255) tttAGATTTTGATTTTCTGTTTTAATTGGTTTATTAAAAAAT‑‑ATATTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTTAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAttt < 1:2494831/128‑1 (MQ=255) atatttagattttgaaaagctcgtttaaattgattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTa > 1:712198‑M1/49‑128 (MQ=255) tatttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAt > 1:995719‑M1/48‑128 (MQ=255) atttagattttgaatatctgtattaaatggattattaaaaaaacaaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAtt > 2:3475619‑M1/47‑128 (MQ=255) atttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAATACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTATTTGATGAACTAtt < 2:1807088‑M1/82‑1 (MQ=255) atttagattttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAtt > 2:1654798‑M1/47‑128 (MQ=255) aGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTAATAAATTTCGTTTATTTATTTTTTAATTTTTATTTTTTTAAATATTTAc > 1:4044449/1‑128 (MQ=255) tagattttttatagctgatttaaattgattattaaacaatacaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTAc > 1:3326437‑M1/44‑128 (MQ=255) attttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTAACATAATTTATTAAATTGCTATTATTTAATTATTAATTATTATTTGATTAAATATttacatt < 2:3037612‑M1/88‑4 (MQ=255) ttttaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTAGttacctaaag > 2:1517891‑M1/39‑124 (MQ=255) tttgaatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAAACTCACATAAGTGATTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTATTTTATTAACTATTTAccttta < 1:300900‑M1/90‑2 (MQ=255) gAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAATAATAAAATAATTTATTAAATTGATATTATTTAATTATTAATTATAATTTTATAAAATATTTAAatttattt > 2:2712944/1‑128 (MQ=255) gattatttgatttaaatgtattattaataaatcaaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTa > 1:4124251‑M1/36‑128 (MQ=255) atcTGATTTAAATTTATTATTAAACAATTCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAATATACTCACATAAGTGAGTAAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTATTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGt < 2:4094675/126‑1 (MQ=255) aatagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAAATATTAATTATTCTTTAATGAAATATTTACCTTTCTTTa < 1:1888138‑M1/94‑1 (MQ=255) gcttttttAAATTTTTTATTAAAAAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGt < 1:2290248/123‑1 (MQ=255) tagctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACctttct > 2:3570116‑M1/33‑122 (MQ=255) ctgtattAAATGGATTTTTTAAGAATACA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTa < 1:4183399/123‑1 (MQ=255) agtagttttaaatggatttttaaacaataaaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGt > 1:1787159‑M1/32‑128 (MQ=255) agctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTATCTTTAGGTa < 2:525079‑M1/97‑1 (MQ=255) tcttctttaaatgtattaataaaaaattcaTTTTTTTTATTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTa > 1:2831202‑M1/31‑128 (MQ=255) gctgatttaaatgttttattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTa > 2:3383092‑M1/31‑128 (MQ=255) gctgatttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACACACAAAAGTTAGTAAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTTATGAACTATTTACCTTTctttatgtt < 1:3418680‑M1/98‑5 (MQ=255) tttAAATGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACACACAAAATTGATTCAATTACGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATTAACTAATTACCTTTCTTTAgtaacata > 1:766434/1‑121 (MQ=255) tttAAATGGATTATTAAACAATCCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCAAAAAATTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAAATATTTACCTTAATTAAGTTAAAtaa > 1:2934597/1‑128 (MQ=255) tttaaatggattattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCAAATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTTTTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAAAtaa < 2:3105433‑M1/103‑1 (MQ=255) tGGATTATTAAACAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACACACATAATTGAGTCATTTGCGATTTTTTAATTATTAATTATTCTTTTATTAAATATTTACCTTTCTTTAGGTAACtaattaat > 1:1983140/1‑128 (MQ=255) ttattaAACAATCCA‑‑TTTTTTTTT‑TTTT‑AAAAAAAAGAAAAAAATAATTTATACATTTGCTATTTTTTATTTATTAATTATTGTTTATTAAAATTTTAACATTTGATAAGTTAATTAATTAATTAcat > 1:821798/1‑126 (MQ=255) ttattaaatattacaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAATTGATTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTa > 2:2183484‑M1/16‑128 (MQ=255) ttattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCt > 2:3702078‑M1/16‑128 (MQ=255) ttattaaaaaatcaaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCt > 2:4246684‑M1/16‑128 (MQ=255) tattaaacaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTTAGTCAATTGCGTTTATTTAATTATTATTTATTCTTTGATTAAATATTTACCTTTATTTAGGTAAATAATTATttacaaa < 1:2436975‑M1/114‑4 (MQ=255) tttaataatccattttttttt‑tttt‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCATTTGCGATTATTTAATTATTATTTATTCTTTGAGGAACTATTTACCTTTATTTAGTTAAATAATTAATAACCTAat > 2:4161150/13‑128 (MQ=255) aaaCAATCCA‑TTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGGGATTTTTTAATTATTATTTATTATTTTATGAAATATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACataata > 2:4381755/1‑128 (MQ=255) tataaaataaattttttttt‑tttt‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAata < 1:1704716/117‑1 (MQ=255) taaacaatacaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAata > 2:2121445‑M1/12‑128 (MQ=255) taaaaaatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAata > 2:3922405‑M1/12‑128 (MQ=255) aataatccaTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTTATTATTAATTTTTATTTTATGAAGTATTTAACTTTCTTTAGGTAAATAATTAATTACATAAtatta < 2:1094481‑M1/119‑1 (MQ=255) aaaaatcattttttttt‑tttt‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAAtatta < 1:100741/120‑1 (MQ=255) aatccaTTTTTTTT‑TTTTTAATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATattatt < 2:3986761‑M1/122‑1 (MQ=255) aattttttttt‑tttt‑AATAAAAAGAATCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTAg < 1:620436/126‑1 (MQ=255) ttttttttt‑tttt‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTAGtt > 1:4262948/1‑128 (MQ=255) | GTAACAAAAGTGGTTATTGAGTTGCAAGTAAAGTTCAAATTGATAATAAAATTGATATTCATGGAAAGTCAAATGAATATTTAGATTTTGAATAGCTGATTTAAATGGATTATTAAACAATCCATTTTTTTTTTT‑TTTT‑AATAAAAAGACTCACATAAGTGAGTCAATTGCGATTATTTAATTATTAATTATTCTTTGATGAACTATTTACCTTTCTTTAGGTAACTAATTAATTACCTAATATTATTTTAGTTC > CP016816/87779‑88033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |