| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 441 total aligned reads displayed.
TGTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCA‑‑T‑‑‑‑TATATATATATATATATATA‑‑TATAT‑‑A‑AT‑‑‑GCAATATGTAAAT‑‑GAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTT > CP016816/311021‑311274 | tGTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATAcattca‑‑t > 2:681361/1‑128 (MQ=255) gTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAAGATAcattca‑‑t‑‑‑‑t > 1:808298/1‑128 (MQ=255) tACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCA‑‑T‑‑‑‑ta > 1:418788/1‑128 (MQ=255) aCCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACAAACATTCA‑‑T‑‑‑‑tat > 2:1946776/1‑128 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |