Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816214,1050GT64.2% 624.4 / inf 872intergenic (+16/‑75)JCVSYN2_00905/JCVSYN2_0091050S rRNA methyltransferase/30S ribosomal protein S16
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (149/162);  new base T (257/301);  total (407/465)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.20e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 884 total aligned reads displayed.

AAAATTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCATTTTATAG  >  CP016816/213979‑214232
                                                                                                                              |                                                                                                                               
  aaTTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGtat                                                                                                                              >  2:1616509/1‑128 (MQ=255)
   aTTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGtata                                                                                                                             <  1:84641/128‑1 (MQ=255)
      tCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACATCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAAtt                                                                                                                          <  2:579245/128‑1 (MQ=255)
       cTTTATCAAAAATTACTTTACCACACCACTTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTtaattataatta                                                                                                                         <  2:839290/128‑1 (MQ=255)
       cTTTAGCAAAATTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGGtaattataatta                                                                                                                         <  1:1043439/128‑1 (MQ=255)
        tttAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTAc                                                                                                                        >  2:1416746/1‑128 (MQ=255)
          tAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACtt                                                                                                                      >  1:246761/1‑128 (MQ=255)
            gCAAATATTACTTTAACTCACCATATATGTAGAATAGTTTTATTTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAATATGAATAATATCATAAATAATTTTTAAGGTTTTAATTATAATTACTTGa                                                                                                                    <  2:1267058/128‑1 (MQ=255)
            gCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAACATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGa                                                                                                                    >  1:982939/1‑128 (MQ=255)
            gCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGa                                                                                                                    <  1:576338/128‑1 (MQ=255)
               aaaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGacac                                                                                                                 >  1:789536/1‑128 (MQ=255)
               aaaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGacac                                                                                                                 >  2:488262/1‑128 (MQ=255)
               aaaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGacac                                                                                                                 >  2:1352786/1‑128 (MQ=255)
                aaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACAcc                                                                                                                <  1:45329/128‑1 (MQ=255)
                 aaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCt                                                                                                               <  2:913812/128‑1 (MQ=255)
                 aaTTACTTAACCACCACCATTATGGATAATATTTTTAAATGAAAAAATTTATCGTTGTTTTAAAATTATTAAAAATGTAAAATATAATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCt                                                                                                               <  2:1154910/128‑1 (MQ=255)
                       tttACAACACCAATTATTTATAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCTATTATTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTATAGGTTTTAATTATAATTTATTTacacatgttgta                                                                                                         >  1:682159/1‑120 (MQ=255)
                           ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa                                                                                                     >  2:1914440/1‑128 (MQ=255)
                           ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa                                                                                                     >  2:1582287/1‑128 (MQ=255)
                           ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa                                                                                                     >  2:1115600/1‑128 (MQ=255)
                           ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa                                                                                                     <  1:1603350/128‑1 (MQ=255)
                              cacCAATTATGTAGAATAGTTTTATTTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTg                                                                                                  <  2:819231/128‑1 (MQ=255)
                                   aTTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGataat                                                                                             <  1:184143/128‑1 (MQ=255)
                                   aTTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGataat                                                                                             >  2:982979/1‑128 (MQ=255)
                                       tGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAAtatta                                                                                         <  1:389486/128‑1 (MQ=255)
                                        gTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAAtattat                                                                                        <  1:1620473/128‑1 (MQ=255)
                                         tAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGATTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATattatt                                                                                       <  1:1380275/128‑1 (MQ=255)
                                         tAGAATAGTGTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATattattatt                                                                                       >  1:316752/1‑128 (MQ=255)
                                          aGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATAttatta                                                                                      >  1:1419070/1‑128 (MQ=255)
                                           gAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTaa                                                                                     >  1:1192782/1‑128 (MQ=255)
                                           gAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGAGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTaa                                                                                     >  1:481065/1‑128 (MQ=255)
                                           gAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAACTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTaa                                                                                     >  1:1707100/1‑128 (MQ=255)
                                             aTAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAg                                                                                    <  2:517267/127‑1 (MQ=255)
                                             aTAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAAtt                                                                                                   >  2:1533476/1‑112 (MQ=255)
                                               aGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGCCACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGtt                                                                                 >  1:1004345/1‑128 (MQ=255)
                                               aGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGtt                                                                                 <  1:272012/128‑1 (MQ=255)
                                                 ttttAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGtttt                                                                               <  2:455061/128‑1 (MQ=255)
                                                  tttAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTa                                                                              <  1:914271/128‑1 (MQ=255)
                                                   ttAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTaa                                                                             <  1:1803466/128‑1 (MQ=255)
                                                     aaTTGAAAAAATTTATCGAGTTTTTTAAATTATAAAAAATGATTAATATAATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACATCTTTTTTTTAAATTGATAATATTTTTAAGGTTTTaaaa                                                                           <  1:729810/128‑1 (MQ=255)
                                                       ttGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAat                                                                         >  1:1169576/1‑128 (MQ=255)
                                                         gAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAatat                                                                       <  2:1093046/128‑1 (MQ=255)
                                                         gAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAAAGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAatat                                                                       <  2:776024/128‑1 (MQ=255)
                                                              aaTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATAtattat                                                                  <  1:1668996/128‑1 (MQ=255)
                                                              aaTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATAtattat                                                                  <  2:223988/128‑1 (MQ=255)
                                                              aaTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGGGTTAAGTATAATTACTTGACAACTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATAtattat                                                                  <  1:1225117/128‑1 (MQ=255)
                                                               aTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAATATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATtata                                                                 <  2:259467/128‑1 (MQ=255)
                                                               aTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATtata                                                                 >  2:1663683/1‑128 (MQ=255)
                                                               aTTTATCGAGTTTTTAAAAATATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGTTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATtata                                                                 >  1:1589217/1‑128 (MQ=255)
                                                                tttATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATag                                                                >  2:1821378/1‑128 (MQ=255)
                                                                 ttATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATagg                                                               <  2:1195446/128‑1 (MQ=255)
                                                                  tATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATagga                                                              <  2:1385313/128‑1 (MQ=255)
                                                                    tCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGGATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAAGATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATaggagg                                                            >  1:1274335/1‑128 (MQ=255)
                                                                     cGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAggagga                                                           >  1:1765235/1‑128 (MQ=255)
                                                                       aGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa                                                         <  1:512918/128‑1 (MQ=255)
                                                                       aGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa                                                         >  2:1240715/1‑128 (MQ=255)
                                                                       aGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTATTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa                                                         <  1:1652744/128‑1 (MQ=255)
                                                                        gattttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAATGTTTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAATATAGATAATATTATTAAGTTTGTAAAATTATATTATaggagtcaac                                                        >  1:884517/3‑123 (MQ=255)
                                                                        gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAAc                                                        >  1:1893248/1‑128 (MQ=255)
                                                                        gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAAc                                                        >  1:200705/1‑128 (MQ=255)
                                                                        gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAatatat                                                                     <  2:1059961/115‑1 (MQ=255)
                                                                        gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaaa                                                        >  2:1040222/1‑127 (MQ=255)
                                                                        gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAAc                                                        >  2:1699922/1‑128 (MQ=255)
                                                                         tttttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACa                                                       <  2:1490101/128‑1 (MQ=255)
                                                                          ttttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACaa                                                      >  2:337079/1‑128 (MQ=255)
                                                                           tttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAAt                                                     <  2:1015825/128‑1 (MQ=255)
                                                                           tttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTTTTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAAt                                                     >  2:1756286/1‑128 (MQ=255)
                                                                             tAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAATGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATgt                                                   >  1:1536625/1‑127 (MQ=255)
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                                                                                                     tCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCg                           <  2:1982235/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                       ataaataaTTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGt                         <  1:1441961/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                         aaataaTTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTaa                       <  2:298324/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                             aatTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACAGCTTTTTTTATAATTGATAATATTTTTAAGGTTTTAAAAATATTTTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTaaaaaa                   <  1:1250275/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                             aatTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTaaaaaa                   <  1:94751/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                              ctttttAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc                  <  1:648883/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                              atTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc                  >  2:388754/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                              atTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc                  <  2:163348/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                              atTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc                  <  1:43468/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                    aaGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAgcgc            >  2:425299/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                     aGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGcc           >  1:1476344/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                       gtgtTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCAt         <  1:535345/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                       gtgtTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCAt         <  1:1742425/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                        tgtTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCTCCagt        >  1:1118283/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                                         gtTAATTATAATTTCTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCAttt       <  2:718355/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           taattataattaCTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCATTTta     <  2:1441743/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                              |                                                                                                                               
AAAATTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCATTTTATAG  >  CP016816/213979‑214232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: