Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP016816 | 214,105 | 0 | G | T | 64.2% | 624.4 / inf | 872 | intergenic (+16/‑75) | JCVSYN2_00905/JCVSYN2_00910 | 50S rRNA methyltransferase/30S ribosomal protein S16 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (149/162); new base T (257/301); total (407/465) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.20e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 884 total aligned reads displayed.
AAAATTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCATTTTATAG > CP016816/213979‑214232 | aaTTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGtat > 2:1616509/1‑128 (MQ=255) aTTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGtata < 1:84641/128‑1 (MQ=255) tCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACATCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAAtt < 2:579245/128‑1 (MQ=255) cTTTATCAAAAATTACTTTACCACACCACTTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTtaattataatta < 2:839290/128‑1 (MQ=255) cTTTAGCAAAATTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGGtaattataatta < 1:1043439/128‑1 (MQ=255) tttAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTAc > 2:1416746/1‑128 (MQ=255) tAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACtt > 1:246761/1‑128 (MQ=255) gCAAATATTACTTTAACTCACCATATATGTAGAATAGTTTTATTTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAATATGAATAATATCATAAATAATTTTTAAGGTTTTAATTATAATTACTTGa < 2:1267058/128‑1 (MQ=255) gCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAACATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGa > 1:982939/1‑128 (MQ=255) gCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGa < 1:576338/128‑1 (MQ=255) aaaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGacac > 1:789536/1‑128 (MQ=255) aaaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGacac > 2:488262/1‑128 (MQ=255) aaaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGacac > 2:1352786/1‑128 (MQ=255) aaaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACAcc < 1:45329/128‑1 (MQ=255) aaTTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCt < 2:913812/128‑1 (MQ=255) aaTTACTTAACCACCACCATTATGGATAATATTTTTAAATGAAAAAATTTATCGTTGTTTTAAAATTATTAAAAATGTAAAATATAATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCt < 2:1154910/128‑1 (MQ=255) tttACAACACCAATTATTTATAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCTATTATTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTATAGGTTTTAATTATAATTTATTTacacatgttgta > 1:682159/1‑120 (MQ=255) ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa > 2:1914440/1‑128 (MQ=255) ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa > 2:1582287/1‑128 (MQ=255) ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa > 2:1115600/1‑128 (MQ=255) ccACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTaaaa < 1:1603350/128‑1 (MQ=255) cacCAATTATGTAGAATAGTTTTATTTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTg < 2:819231/128‑1 (MQ=255) aTTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGataat < 1:184143/128‑1 (MQ=255) aTTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGataat > 2:982979/1‑128 (MQ=255) tGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAAtatta < 1:389486/128‑1 (MQ=255) gTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAAtattat < 1:1620473/128‑1 (MQ=255) tAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGATTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATattatt < 1:1380275/128‑1 (MQ=255) tAGAATAGTGTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATattattatt > 1:316752/1‑128 (MQ=255) aGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATAttatta > 1:1419070/1‑128 (MQ=255) gAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTaa > 1:1192782/1‑128 (MQ=255) gAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGAGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTaa > 1:481065/1‑128 (MQ=255) gAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAACTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTaa > 1:1707100/1‑128 (MQ=255) aTAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAg < 2:517267/127‑1 (MQ=255) aTAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAAtt > 2:1533476/1‑112 (MQ=255) aGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGCCACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGtt > 1:1004345/1‑128 (MQ=255) aGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGtt < 1:272012/128‑1 (MQ=255) ttttAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGtttt < 2:455061/128‑1 (MQ=255) tttAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTa < 1:914271/128‑1 (MQ=255) ttAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTaa < 1:1803466/128‑1 (MQ=255) aaTTGAAAAAATTTATCGAGTTTTTTAAATTATAAAAAATGATTAATATAATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACATCTTTTTTTTAAATTGATAATATTTTTAAGGTTTTaaaa < 1:729810/128‑1 (MQ=255) ttGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAat > 1:1169576/1‑128 (MQ=255) gAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAatat < 2:1093046/128‑1 (MQ=255) gAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAAAGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAatat < 2:776024/128‑1 (MQ=255) aaTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATAtattat < 1:1668996/128‑1 (MQ=255) aaTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATAtattat < 2:223988/128‑1 (MQ=255) aaTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGGGTTAAGTATAATTACTTGACAACTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATAtattat < 1:1225117/128‑1 (MQ=255) aTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAATATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATtata < 2:259467/128‑1 (MQ=255) aTTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATtata > 2:1663683/1‑128 (MQ=255) aTTTATCGAGTTTTTAAAAATATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGTTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATtata > 1:1589217/1‑128 (MQ=255) tttATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATag > 2:1821378/1‑128 (MQ=255) ttATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATagg < 2:1195446/128‑1 (MQ=255) tATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATagga < 2:1385313/128‑1 (MQ=255) tCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGGATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAAGATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATaggagg > 1:1274335/1‑128 (MQ=255) cGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAggagga > 1:1765235/1‑128 (MQ=255) aGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa < 1:512918/128‑1 (MQ=255) aGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa > 2:1240715/1‑128 (MQ=255) aGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTATTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa < 1:1652744/128‑1 (MQ=255) gattttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAATGTTTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAATATAGATAATATTATTAAGTTTGTAAAATTATATTATaggagtcaac > 1:884517/3‑123 (MQ=255) gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAAc > 1:1893248/1‑128 (MQ=255) gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAAc > 1:200705/1‑128 (MQ=255) gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAatatat < 2:1059961/115‑1 (MQ=255) gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaaa > 2:1040222/1‑127 (MQ=255) gTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAAc > 2:1699922/1‑128 (MQ=255) tttttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACa < 2:1490101/128‑1 (MQ=255) ttttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACaa > 2:337079/1‑128 (MQ=255) tttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAAt < 2:1015825/128‑1 (MQ=255) tttAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTTTTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAAt > 2:1756286/1‑128 (MQ=255) tAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAATGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATgt > 1:1536625/1‑127 (MQ=255) aaaTTATAAAAAATGAAAAATATAATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGtt < 2:944907/128‑1 (MQ=255) ataAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGaaa < 2:1859649/115‑1 (MQ=255) ataAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAATATATATTAAAGGAGGAAACAATGTTTatata > 1:822283/1‑127 (MQ=255) taAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTTAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTa < 1:1347867/128‑1 (MQ=255) aaaaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAATGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAg < 1:619937/128‑1 (MQ=255) aaaaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAg > 2:1326697/1‑128 (MQ=255) aaaaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTaaa > 2:1790140/1‑93 (MQ=255) aaaaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACa < 1:1506899/114‑1 (MQ=255) aaaaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAg < 1:1931951/128‑1 (MQ=255) aaaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGTTGTTTATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGa < 2:671712/128‑1 (MQ=255) aaaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGAt < 2:1898822/128‑1 (MQ=255) aaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGAtt > 2:555644/1‑128 (MQ=255) aaTGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCCTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGAtt > 1:1094754/1‑128 (MQ=255) gAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTaaa > 2:1469313/1‑128 (MQ=255) atatCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGaa > 2:61824/1‑128 (MQ=255) atatCATAAATAATTTATAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGaa < 2:648605/128‑1 (MQ=255) tCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCg < 2:1982235/128‑1 (MQ=255) ataaataaTTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGt < 1:1441961/128‑1 (MQ=255) aaataaTTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTaa < 2:298324/128‑1 (MQ=255) aatTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACAGCTTTTTTTATAATTGATAATATTTTTAAGGTTTTAAAAATATTTTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTaaaaaa < 1:1250275/128‑1 (MQ=255) aatTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTaaaaaa < 1:94751/128‑1 (MQ=255) ctttttAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc < 1:648883/127‑1 (MQ=255) atTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc > 2:388754/1‑128 (MQ=255) atTTTTAAGGTGTTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc < 2:163348/128‑1 (MQ=255) atTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAAc < 1:43468/128‑1 (MQ=255) aaGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAgcgc > 2:425299/1‑128 (MQ=255) aGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGcc > 1:1476344/1‑128 (MQ=255) gtgtTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCAt < 1:535345/128‑1 (MQ=255) gtgtTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCAt < 1:1742425/128‑1 (MQ=255) tgtTAATTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCTCCagt > 1:1118283/1‑126 (MQ=255) gtTAATTATAATTTCTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCAttt < 2:718355/128‑1 (MQ=255) taattataattaCTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCATTTta < 2:1441743/128‑1 (MQ=255) | AAAATTTCTTTAGCAAAAATTACTTTACCACACCAATTATGTAGAATAGTTTTAATTGAACAAATTTATCGAGTTTTTAAAATTATAAAAAATGAAAAATATCATAAATAATTTTTAAGGTGTTAAGTATAATTACTTGACACCTTTTTTTAAAATTGATAATATTATTAAGGTTTTAAAAATATATTATAGGAGGAAACAATGGTTAAATTAAGATTAAAAAGAATCGGTAAAAAACAAGCGCCATTTTATAG > CP016816/213979‑214232 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |