| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP016816 | 153,394 | G→A | S79F (TCT→TTT) | JCVSYN2_00620 ← | transcription elongation factor GreA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP016816 | 153,394 | 0 | G | A | 99.4% | 9309.5 / NA | 3023 | S79F (TCT→TTT) | JCVSYN2_00620 | transcription elongation factor GreA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); major base A (1523/1470); minor base T (8/11); total (1535/1488) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 3051 total aligned reads displayed.
TTAGATTAGAAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAGAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGATTACG > CP016816/153269‑153518 | tagattagaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAat < 1:6301841/128‑1 (MQ=255) agattagaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAatc < 2:3552397/128‑1 (MQ=255) tagaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAAtcatca < 1:2404634/128‑1 (MQ=255) tagaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAAtcatca > 2:2822935/1‑128 (MQ=255) agaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCaa > 1:617697/1‑128 (MQ=255) agaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCaa > 1:804647/1‑128 (MQ=255) agaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCaa > 1:3859731/1‑128 (MQ=255) gaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAAt < 1:3245916/128‑1 (MQ=255) gaAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAAt > 1:4508627/1‑128 (MQ=255) aaaaGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATaa > 2:1800968/1‑128 (MQ=255) gATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTa > 1:5792434/1‑128 (MQ=255) gATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTa < 2:2310164/128‑1 (MQ=255) cAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAg > 1:4763760/1‑126 (MQ=255) aGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCTATAACTTTAGctc > 1:6656183/1‑128 (MQ=255) gCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCACTAACTTTAGctct > 1:2143417/1‑128 (MQ=255) gCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGctct > 1:3020782/1‑128 (MQ=255) cTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTa < 2:6758990/128‑1 (MQ=255) cTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTa < 1:651891/128‑1 (MQ=255) tCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTatt < 1:46270/128‑1 (MQ=255) tAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTattaatt < 2:446237/128‑1 (MQ=255) gCACCATCAATTATAATTTCATTTAATTTATTATCTTAACTTGTAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTTACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTAttaattaa < 1:4166831/128‑1 (MQ=255) cACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTAttaattaa < 2:4567014/127‑1 (MQ=255) cACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTaaa > 2:60091/1‑128 (MQ=255) aCCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAg > 1:2877244/1‑128 (MQ=255) aCCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAg > 1:2722821/1‑128 (MQ=255) aaactattttaAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGt < 1:3607013/121‑1 (MQ=255) aacaaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTCTCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGttt < 2:5409778/128‑1 (MQ=255) aacaaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGttt > 2:3416055/1‑128 (MQ=255) acaaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTTAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTc < 2:1129199/128‑1 (MQ=255) acaaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTc > 2:4822584/1‑128 (MQ=255) caaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCa > 2:1927523/1‑128 (MQ=255) aaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCaa < 1:4389607/128‑1 (MQ=255) aaTTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCaa < 2:3852091/128‑1 (MQ=255) aagttAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGATACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAATTCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAAc < 2:4688437/125‑1 (MQ=255) tttAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAActt < 1:3497384/128‑1 (MQ=255) tttAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAActt < 1:5896668/128‑1 (MQ=255) ttAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCACcttc > 2:489459/1‑128 (MQ=255) aaTTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCATcttctt > 1:5527712/1‑128 (MQ=255) aaTTTATTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTAGATTTGATCAAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAActtctt < 2:1337324/128‑1 (MQ=255) aatttttttAATTTATTATCTAAACTAGAATCAAATAGTACATTTGATAAAATTTTAACTTCACCATTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCttt < 1:1522804/123‑1 (MQ=255) tttCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTa > 1:2047317/1‑128 (MQ=255) ttggttttAATTTATTATGTATTGTTGAATCAAATTGTACAGTTGTTCGATTTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTGTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTAATAATTAAAGTTGCAACTTCTTTa < 2:3003862/124‑1 (MQ=255) cTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAActtct < 1:1134913/122‑1 (MQ=255) cTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAAtt < 2:5743062/128‑1 (MQ=255) ttttAATTTTTTATCTAAACTTTAAACAAATTGTAAAGTTGTTCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTc < 2:2576817/128‑1 (MQ=255) ttttAATTTCTTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAActtc < 1:4263725/120‑1 (MQ=255) ttttAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTCGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTc < 1:1920066/128‑1 (MQ=255) tttAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCt > 2:396701/1‑128 (MQ=255) tAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTg > 1:1271400/1‑128 (MQ=255) aaTTTCTTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGc < 2:792764/128‑1 (MQ=255) tttATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTACTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCtt < 2:665039/128‑1 (MQ=255) ttattaTCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTc < 2:4115207/128‑1 (MQ=255) ttatCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTGTATTAATTAAAGTTTCAACGTCGTTAATTCTTGCTTCAAc > 2:4237072/1‑128 (MQ=255) ttatCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAAc > 2:327765/1‑128 (MQ=255) tatCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACt < 1:4982836/128‑1 (MQ=255) aCTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCtt > 2:5141196/1‑128 (MQ=255) aCTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCtt > 2:6297617/1‑128 (MQ=255) cTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTg < 1:718615/128‑1 (MQ=255) cTTGAAACAAATTGTACAGTTCCTCCAATTTTAACTTCCCCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTGTAGCTCTATTAATTACAGTTTCAACTTCGTTAATTCTTGCGTCCACTTCAGcggg > 2:6544629/1‑125 (MQ=255) gAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGTTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTACAGCTTGTCt > 2:528137/1‑128 (MQ=255) aaCAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAGTAACTTTa > 2:3116759/1‑70 (MQ=255) aaaTTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTc > 1:5136163/1‑128 (MQ=255) aTTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTa < 2:3757658/95‑1 (MQ=255) aTTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTa > 2:2458832/1‑128 (MQ=255) ttGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTag > 1:5994070/1‑128 (MQ=255) ttGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTag > 1:3372130/1‑128 (MQ=255) ttGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTag > 1:4006665/1‑128 (MQ=255) ttGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTa < 2:6183550/127‑1 (MQ=255) tACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCATCTTGTCTGTTTCTagcag > 2:887110/1‑128 (MQ=255) aCAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTagcagc > 1:3141393/1‑128 (MQ=255) gTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGcatc > 1:4884304/1‑128 (MQ=255) tGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGcatcat < 1:1803158/128‑1 (MQ=255) tGATCCAATTTTAACTTCAACAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGcatcat < 2:587237/128‑1 (MQ=255) tGATCAAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGcatcat < 2:2064682/128‑1 (MQ=255) aTCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATaa < 2:5538652/128‑1 (MQ=255) aTCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATaa < 1:1656761/128‑1 (MQ=255) aTCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTATCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCATCTAGTCTGTATCTAGCAGCATCATaa > 1:6407626/1‑128 (MQ=255) cAATTTTAACTTCCCCAGTAGAATGAGTGTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCa < 1:3729192/128‑1 (MQ=255) ttAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCAtt < 2:3653416/128‑1 (MQ=255) ttAACTTCACCAGTTGAATGAGAGTTAAAATCATAAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCAtt < 2:1454651/128‑1 (MQ=255) aaCTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCAtttt > 1:6781019/1‑128 (MQ=255) aaCTTCACCAGATGCATTAGATTAAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTGCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCAtttt < 2:700431/128‑1 (MQ=255) aCTTCACCAGTTCAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTTATTAAAGATTCCACATCTTTAATTCTTGCTTCACCTTCCGCTAGTCTGTTTCTAGCAGCCTCATTAACAGcctggtc > 2:5014747/1‑122 (MQ=255) ttCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCAtt < 2:1589809/123‑1 (MQ=255) tCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCaaa > 2:1024033/1‑126 (MQ=255) tCACCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACt < 2:6425403/128‑1 (MQ=255) cACCAGTTGAATGAGATTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACtt < 1:5275191/128‑1 (MQ=255) aCCAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCAGAATCCGCATTTTCACTTa > 2:5641665/1‑128 (MQ=255) ccAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTaa < 2:4327840/67‑1 (MQ=255) ccAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTaa < 2:1684491/128‑1 (MQ=255) ccAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATGTTCACTTaa > 1:2563555/1‑128 (MQ=255) cAGTTGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGAATTTTCACTTaaa > 2:2199278/1‑128 (MQ=255) ttGAATGAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAAtct < 1:5675458/128‑1 (MQ=255) gagaTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGa < 1:5408255/128‑1 (MQ=255) gAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGa > 1:2257214/1‑128 (MQ=255) gAGTTTTAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTATTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCCCTTAAATCTCCTTGa > 1:1388770/1‑128 (MQ=255) ttttAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGATTa > 2:1228293/1‑128 (MQ=255) ttttAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTAAATACTTGCTACAACTTCAGCAAGTCTCTATCAAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGATTa > 1:1000060/1‑128 (MQ=255) ttAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGATTACg > 2:2695149/1‑128 (MQ=255) ttAAAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGAGTACg > 1:925010/1‑128 (MQ=255) | TTAGATTAGAAAAAGGATCAGCTTCAATAGCACCAACAATTTTAATTTCTTTTAATTTATTATCTAAACTTGAAACAAATTGTACAGTTGATCCAATTTTAACTTCACCAGTTGAATGAGTTTTAGAATCATCAATAACTTTAGCTCTATTAATTAAAGTTTCAACTTCTTTAATTCTTGCTTCAACTTCAGCTTGTCTGTTTCTAGCAGCATCATAATCAGCATTTTCACTTAAATCTCCTTGATTACG > CP016816/153269‑153518 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |