| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP016816 | 266,403 | G→T | D688Y (GAT→TAT) | JCVSYN2_01110 → | guanosine‑3',5'‑bis(diphosphate) 3'‑pyrophosphohydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP016816 | 266,403 | 0 | G | T | 99.5% | 9179.7 / NA | 3099 | D688Y (GAT→TAT) | JCVSYN2_01110 | guanosine‑3',5'‑bis(diphosphate) 3'‑pyrophosphohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/0); major base T (1591/1485); minor base A (10/7); total (1607/1492) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 3236 total aligned reads displayed.
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AATATTGATTGAACTAATATGAAATCAAGATTAGTAGTTGTGCAGTGAAATGAAGCAGTTGCTGAAAAAAATACATATACTACTAAATTAAAATATTTTGGTATTGATAGAAACAAACTACTTTATGATATAAGTAAAATTATTTCTGGATTAAAAGTATCAATTATTAATGCAAATATTTTTACAGATGAAAAATCTTTATTATCAAGTGGAGTAATTACTATTAAAATTAAAAACAGTAATCAGTTAAC > CP016816/266277‑266527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |