BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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Read alignment evidence...
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*	CP016816	245,380	0	A	T	99.0%	7520.6 / NA	2377	Y1670F (TAT→TTT)	JCVSYN2_01035	ABC transporter permease
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (18/5); new base T (1237/1116); total (1255/1122)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.91e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2380 total aligned reads displayed.

AATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGCAATACCTTATGGATTT  >  CP016816/245255‑245507

  ttACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGGAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCt                                                                                                                             >  2:1103305/1‑128 (MQ=255)

   tACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtt                                                                                                                            <  1:1717565/128‑1 (MQ=255)

     ctgTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtttt                                                                                                                          >  1:2355715/3‑128 (MQ=255)

     cAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtttt                                                                                                                          <  2:901871/128‑1 (MQ=255)

     cAGTAATTAGTACTTCAGCTATAGTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCtttt                                                                                                                          <  2:3652644/128‑1 (MQ=255)

       gTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTgg                                                                                                                        >  1:183986/1‑128 (MQ=255)

          attattACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAAc                                                                                                                     >  1:4859422/1‑128 (MQ=255)

           ttattaCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACt                                                                                                                    >  2:2438828/1‑128 (MQ=255)

            tattaCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGTAACTg                                                                                                                   >  1:4940305/1‑128 (MQ=255)

            tattaCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTg                                                                                                                   >  1:3975072/1‑128 (MQ=255)

               taCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCaa                                                                                                                >  2:3926772/1‑128 (MQ=255)

                aCTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTCGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAAt                                                                                                               <  1:106590/128‑1 (MQ=255)

                  ttCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtg                                                                                                             <  2:1195864/128‑1 (MQ=255)

                    cAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtgtg                                                                                                           >  2:4507390/1‑128 (MQ=255)

                    cAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATtgtg                                                                                                           >  1:3296403/1‑128 (MQ=255)

                      gCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtt                                                                                                         >  2:5001617/1‑128 (MQ=255)

                      gCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtt                                                                                                         >  1:3890823/1‑128 (MQ=255)

                      gCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtt                                                                                                         <  2:5106181/128‑1 (MQ=255)

                        tttACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgttta                                                                                                       >  2:691165/1‑128 (MQ=255)

                        tttAATAGTTATGTTAAATTCATATATTTATGTAACTCAGTATCAACACTTTATGCTTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgttta                                                                                                       <  1:219224/128‑1 (MQ=255)

                            cTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTgtttagttt                                                                                                   <  2:1622943/128‑1 (MQ=255)

                               gTAATGTTAATTTCAGATATATATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTATAATGAAAGCATTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGATATTTTGCTTTTGGAACTGCAAGTCTTTTTAGTTTAAt                                                                                                >  1:160783/1‑128 (MQ=255)

                                taattttaatttCATATATTTATGTATCTCATTATTAACATTTTATTATTTTATTGAAAGATTTAGGATATTCTAATTATAAAATTAGTTTTTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAAtt                                                                                               <  2:1319956/128‑1 (MQ=255)

                                tAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCTAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAAtt                                                                                               >  2:2808581/1‑128 (MQ=255)

                                tAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAAtt                                                                                               >  1:514607/1‑128 (MQ=255)

                                 aaTGTTAATTTCAGATCTTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTa                                                                                              <  2:2887540/128‑1 (MQ=255)

                                   tGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTAtg                                                                                            <  1:733856/128‑1 (MQ=255)

                                     ttAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGaa                                                                                                                      >  2:4311852/1‑100 (MQ=255)

                                     ttAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTAtgtg                                                                                          <  1:4554653/128‑1 (MQ=255)

                                      taatatattataaTTATGTAACTAAGTATAAACAGTTAATGTTTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTTCAATTGTGTTTAGTTTAATTAtgtta                                                                                         <  2:2710527/119‑3 (MQ=255)

                                        aTTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGc                                                                                       <  1:443798/128‑1 (MQ=255)

                                        aTTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGc                                                                                       <  1:3636272/128‑1 (MQ=255)

                                         tttCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCa                                                                                      <  2:4100801/128‑1 (MQ=255)

                                          ttCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTTCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCaa                                                                                     >  2:3370207/1‑128 (MQ=255)

                                          ttCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCaa                                                                                     >  1:27426/1‑128 (MQ=255)

                                           tCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGTAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAAt                                                                                    >  2:4773279/1‑128 (MQ=255)

                                           tCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTTGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAAt                                                                                    >  2:1921211/1‑128 (MQ=255)

                                           tCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTTGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAAt                                                                                    >  2:1706160/1‑128 (MQ=255)

                                              gATATTTATGTAACTCAGTATCCACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTc                                                                                 <  2:4413580/128‑1 (MQ=255)

                                              gATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTTTTTAGTTTAATTATTTGAGCAATTTc                                                                                 >  2:1407720/1‑128 (MQ=255)

                                              gATATTTATGTAACTCAGTATATACATTTTATTATTTTAATGAAAGCTTTAGTATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTc                                                                                 <  1:5447511/128‑1 (MQ=255)

                                                  tttATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACt                                                                             <  1:1937281/128‑1 (MQ=255)

                                                  tatATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACt                                                                             <  1:4065736/126‑1 (MQ=255)

                                                   ttctGTAACTCAGTATCACCAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATCTTCAAATTATAAAATTAGATATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGGGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATATCAACtt                                                                            <  1:3399369/125‑1 (MQ=255)

                                                   ttATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACtt                                                                            <  1:817868/128‑1 (MQ=255)

                                                      tGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAg                                                                         <  1:1003088/128‑1 (MQ=255)

                                                       gTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGc                                                                        >  2:402317/1‑128 (MQ=255)

                                                        tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                       <  1:647985/128‑1 (MQ=255)

                                                        tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                       >  2:2326677/1‑128 (MQ=255)

                                                        tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                       <  1:4271538/128‑1 (MQ=255)

                                                        tAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCt                                                                       <  1:4177242/128‑1 (MQ=255)

                                                            tCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTAT‑AAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTATAGATACTTg                                                                  >  2:180031/1‑128 (MQ=255)

                                                             cAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTg                                                                  <  2:3862155/128‑1 (MQ=255)

                                                             cAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTg                                                                  <  1:5348714/128‑1 (MQ=255)

                                                              aGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAAATTTAGCTACTTGa                                                                 >  1:2621559/1‑128 (MQ=255)

                                                               gTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATATCAACTTTAGCTACTTGaa                                                                >  1:2858946/1‑128 (MQ=255)

                                                                  tCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGTAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTAAACTTTAGCTACTTGAAttt                                                             >  1:1331117/1‑128 (MQ=255)

                                                                  tCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAttt                                                             <  2:2185083/128‑1 (MQ=255)

                                                                   cAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAAtttt                                                            >  2:418629/1‑128 (MQ=255)

                                                                      cAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAAATAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAAt                                                         >  2:3489342/1‑128 (MQ=255)

                                                                             tGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACatta                                                  <  2:3558183/128‑1 (MQ=255)

                                                                             tGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTACTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACatta                                                  <  2:2628882/128‑1 (MQ=255)

                                                                                ttttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACattaatt                                               >  2:3265243/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  ttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAattat                                             >  2:1504574/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  ttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAattat                                             >  2:1005178/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  ttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAattat                                             >  1:3204227/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  ttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAattat                                             >  2:3103266/1‑128 (MQ=255)

                                                                                  ttAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAattat                                             >  2:3196690/1‑128 (MQ=255)

                                                                                     aTGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCa                                          >  2:585548/1‑128 (MQ=255)

                                                                                      tGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCaa                                         <  1:1206838/128‑1 (MQ=255)

                                                                                       gAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCaaa                                        <  1:4665342/128‑1 (MQ=255)

                                                                                         aaGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAatt                                      >  1:1427432/1‑128 (MQ=255)

                                                                                         aaGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAatt                                      >  1:151323/1‑128 (MQ=255)

                                                                                          aGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAatta                                     >  2:2045976/1‑128 (MQ=255)

                                                                                             tttAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAAttatta                                  <  1:3083466/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              ttAGGATTTTCTAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                                 <  1:2449539/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              ttAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGATCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                                 <  2:3742051/128‑1 (MQ=255)

                                                                                              ttAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                                 >  1:3530658/1‑128 (MQ=255)

                                                                                              ttAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                                 <  2:2116528/128‑1 (MQ=255)

                                                                                               tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                                >  1:5230024/1‑128 (MQ=255)

                                                                                               tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                                <  2:811947/128‑1 (MQ=255)

                                                                                               tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                                >  2:489366/1‑128 (MQ=255)

                                                                                               tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                                >  1:5064571/1‑128 (MQ=255)

                                                                                               tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                                <  2:2993529/128‑1 (MQ=255)

                                                                                               tAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACa                                <  2:2249949/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                aGGATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACaa                               >  1:4765271/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                 ggATATTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATAACATTAATTATTCAAATTATTACAAg                              >  2:2502687/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                   atatTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGtt                            >  1:210055/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                     atTCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTAc                                 >  1:3754392/1‑121 (MQ=255)

                                                                                                      ttCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAg                         >  2:5458628/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                      ttCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAg                         >  2:4685014/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                      ttCAAATTATAAAATTAGTTATTATGCTTTTGGATCTGCAATTGAGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTGTAGATACTAGAATTATAAACACATAAATTATTCAAATTATTACAAGTTAAg                         >  1:895322/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                       tCAAATTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAgg                        >  1:2969341/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                        cataTTATAAAATTAGTTTTTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGt                       <  2:5352899/125‑1 (MQ=255)

                                                                                                         aaaTTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGAAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGtt                      <  1:2529167/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                          aaTTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGttt                     <  2:5209285/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                           tttATAATATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTAAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGtttt                    <  2:4610942/127‑1 (MQ=255)

                                                                                                           aTTATAAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGTtttt                    >  1:2280172/1‑128 (MQ=255)

                                                                                                              ataAAATTAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATTTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCTCATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGCa                 <  1:2018396/128‑1 (MQ=255)

                                                                                                                    ttAGTTATTTTGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGCAATACCt           <  1:558848/128‑1 (MQ=255)

AATTACAGTAATTATTACTTCAGCTTTACTAGTAATGTTAATTTCAGATATTTATGTAACTCAGTATCAACAGTTTATGATTTTAATGAAAGCTTTAGGATATTCAAATTATAAAATTAGTAAATATGCTTTTGGAACTGCAATTGTGTTTAGTTTAATTATGTGAGCAATTTCAACTTTAGCTACTTGAATTTTAATCACATTAATTATTCAAATTATTACAAGTTTAGGTTTTGCAATACCTTATGGATTT  >  CP016816/245255‑245507

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 14 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`