| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP016816 | 254,950 | C→T | S457L (TCA→TTA) | JCVSYN2_01075 → | RNA polymerase subunit sigma |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP016816 | 254,950 | 0 | C | T | 99.5% | 7917.7 / NA | 2577 | S457L (TCA→TTA) | JCVSYN2_01075 | RNA polymerase subunit sigma |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (1407/1157); minor base A (7/6); total (1414/1163) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 2577 total aligned reads displayed.
TGATTCAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTCAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGAAAAACA > CP016816/254825‑255074 | tGATTCAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAg < 1:5317064/128‑1 (MQ=255)tGATTCAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAg > 1:2284575/1‑128 (MQ=255) aTTCAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCt > 2:913022/1‑128 (MQ=255) tCAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAg > 1:3307137/1‑128 (MQ=255) cAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGa < 2:81156/128‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGaa < 2:1626244/128‑1 (MQ=255) aaaTGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGaa > 2:1430616/1‑128 (MQ=255) aaTGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAac < 2:428427/128‑1 (MQ=255) aaTGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAac < 1:574344/128‑1 (MQ=255) aTGCTATAGAATTAATACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTAAGCTAGAaca < 2:3738603/128‑1 (MQ=255) tGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAacac > 2:5218752/1‑128 (MQ=255) cTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTa > 1:5243917/1‑128 (MQ=255) tAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTag > 2:682969/1‑128 (MQ=255) tAAAGAATTAAAACAAGAAATTGAAGAATTAGATAATCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTag < 2:3815393/128‑1 (MQ=255) aaaGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTaga < 1:2742014/128‑1 (MQ=255) aTTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGaagaag > 2:3262110/1‑128 (MQ=255) ttAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGt > 1:763248/1‑128 (MQ=255) tAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGtt > 1:4524145/1‑128 (MQ=255) tAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGtt > 2:584153/1‑128 (MQ=255) aaaaCAAGCATTTGAAGATTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTCTAAAATTTAATAATCAAATCATTAATATTAATTTAGCAAAATATGATGTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTg < 2:5048849/128‑1 (MQ=255) aaCAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACAAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGa < 2:2828407/128‑1 (MQ=255) cAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGaaa < 2:4517144/128‑1 (MQ=255) cAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGaaa < 1:1197239/128‑1 (MQ=255) aGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAATTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTTGAAAAg > 1:5387133/1‑128 (MQ=255) gCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGa < 1:2064958/128‑1 (MQ=255) gCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGa > 2:5297351/1‑128 (MQ=255) gCAATTGAAGAAATAGATATTCATATAGATACACGAATTGAAAAAGTAAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATTATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGa < 2:3456933/128‑1 (MQ=255) cAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTATAACACTAGAAGAAGATGGATATGaa > 2:2631004/1‑128 (MQ=255) aaTTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAAt < 1:4427702/128‑1 (MQ=255) tGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTaa > 1:5480015/1‑128 (MQ=255) tGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTaa > 1:5151058/1‑128 (MQ=255) gaagaaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTaaa < 1:2658223/128‑1 (MQ=255) gaagaaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGATAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTaaa > 2:2367576/1‑128 (MQ=255) aagaaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAAt < 1:431858/128‑1 (MQ=255) agaaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATg > 1:4646757/1‑128 (MQ=255) gaaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGt < 2:5465334/128‑1 (MQ=255) aaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGtt < 1:299198/128‑1 (MQ=255) aaTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGtt > 2:4850361/1‑128 (MQ=255) aTTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTAGGAAAAGAATTAAATGTTa > 2:2134044/1‑128 (MQ=255) aTTAGATATTCATATAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTa < 2:4169774/128‑1 (MQ=255) ttAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTAc > 1:2893751/1‑128 (MQ=255) aGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTa < 1:4992230/128‑1 (MQ=255) gATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTag < 1:176101/128‑1 (MQ=255) gATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTag > 1:3920930/1‑128 (MQ=255) atatTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTaga > 1:853356/1‑128 (MQ=255) tCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGagaaa < 1:3416688/128‑1 (MQ=255) aTTTAGATACACCAATTGAATAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATATAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGagaaaga < 1:3514010/128‑1 (MQ=255) tttAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGagaaagaa > 2:1795671/1‑128 (MQ=255) ttAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTaa < 1:5091912/109‑1 (MQ=255) ttAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAAt > 1:1577601/1‑128 (MQ=255) acacCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACa < 1:2823837/128‑1 (MQ=255) ccAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAAt > 2:1095790/1‑128 (MQ=255) cAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAAtt > 1:1481693/1‑128 (MQ=255) ttGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTCGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGaa > 2:1898509/1‑128 (MQ=255) aaaGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCaaa < 2:1362007/128‑1 (MQ=255) aaaGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGAAAAATATGATTTAGCTAGAACAATAGAATAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGATAAAGAATCATACAAATTGATTCaaa > 1:4083605/1‑128 (MQ=255) aaGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCaaaa < 2:4393782/128‑1 (MQ=255) ttAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACt > 2:2233605/1‑128 (MQ=255) ttAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACGAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACt > 1:488209/1‑128 (MQ=255) tAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTa < 2:120763/128‑1 (MQ=255) aGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTAt > 1:2153919/1‑128 (MQ=255) gAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTAtt < 2:4726735/128‑1 (MQ=255) aaaaTTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTa < 2:3630367/128‑1 (MQ=255) aaaaTTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTa > 1:320097/1‑128 (MQ=255) aTTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGaa > 2:1285448/1‑128 (MQ=255) tttAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATATAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAAAGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTCAAGCAAACACTATAAGaaa > 2:2731733/1‑128 (MQ=255) ttAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGtt < 2:4610801/65‑1 (MQ=255) taataaTCTAATCATTAATAATAATTTAGCAAATTATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAAt < 2:3978572/128‑1 (MQ=255) atcaaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTaaaa < 2:3065715/128‑1 (MQ=255) atcaaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTaaaa > 2:3547893/1‑128 (MQ=255) tcaaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAaac > 1:2526766/1‑128 (MQ=255) tcaaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAaac > 1:1839155/1‑128 (MQ=255) caaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAaaca > 1:1005128/1‑128 (MQ=255) aaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAACAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGCATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAaacaa > 2:2942245/1‑128 (MQ=255) aaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAaacaa < 2:53764/128‑1 (MQ=255) aaatcaTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAaacaa < 1:663302/128‑1 (MQ=255) caTTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAAATGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCAt > 1:4007907/1‑128 (MQ=255) ttAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCa > 2:1535173/1‑128 (MQ=255) ttAATAATAATTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCa > 2:3890938/1‑128 (MQ=255) taataataaTTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCAc < 2:333007/128‑1 (MQ=255) taataataaTTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCAc < 1:3606018/128‑1 (MQ=255) aataataatTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCAcc > 1:1395351/1‑128 (MQ=255) taataatTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCaa > 1:3707623/1‑128 (MQ=255) aataatTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCaaa > 2:2518397/1‑128 (MQ=255) aataatTTAGCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCaaa > 1:1928808/1‑128 (MQ=255) gCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATc < 1:1114384/128‑1 (MQ=255) gCAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATc < 1:1659419/128‑1 (MQ=255) cAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAATCTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCt > 1:2444495/1‑128 (MQ=255) cAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCt < 2:1694518/128‑1 (MQ=255) cAAAATATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCt > 1:3808349/1‑128 (MQ=255) aaaaTATGATTTAGCTAGAACACTAGTAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTg < 1:3117468/128‑1 (MQ=255) aaaaTATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTg < 2:315323/128‑1 (MQ=255) aaaTATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTgg < 2:2000184/128‑1 (MQ=255) aaaTATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTgg > 1:969053/1‑128 (MQ=255) aaTATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGa < 2:4070566/128‑1 (MQ=255) aaTATGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGa < 1:4200287/128‑1 (MQ=255) atatGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGaa > 1:4793980/1‑128 (MQ=255) tatGATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAATTCTGGaaa > 2:5143710/1‑128 (MQ=255) gATTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGATAAAc > 2:495836/1‑128 (MQ=255) aTTTAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGAAAAACa < 1:1316134/128‑1 (MQ=255) | TGATTCAAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAGATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATCAAATCATTAATAATAATTTAGCAAAATATGATTCAGCTAGAACACTAGAAGAAGTTGGAAAAGAATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTAGAAAATTAAAACAACCATCACCAAATAATAAATCTGGAAAAACA > CP016816/254825‑255074 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |