| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | CP016816 | 311,173 | Δ6 bp | intergenic (‑96/‑213) | JCVSYN2_01300 ← / → JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | CP016816 | 311155 = | 111 (0.060) | 1038 (0.670) | 191/210 | 1.4 | 92.8% | intergenic (‑78/‑236) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 |
| ? | CP016816 | = 311148 | 69 (0.040) | intergenic (‑71/‑243) | JCVSYN2_01300/JCVSYN2_01305 | hypothetical protein/30S ribosomal protein S21 | |||||
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TGTACCAGTTGTAATAACTAATCCAAATGAACTTAAAATTGTAATTAACTTTTTCATTTTACACACCCCTTATTAAAAAATAAAATACTTGTTACATACGATTCAAAACATATATAACATACATTCATTATATATATATATATATATATATATAATGCAATATGTAAATGAAAATATGGTATAATAGCAACCGTTTATAAAGTAAAAAAATAGTAAATATACTACTTATTTACTAATAAAATCTATTTTTATTTA > CP016816/311021‑311275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |