Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3390TG57.5% 1268.7 / 301.2 1079intergenic (+834/+92)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (81/365);  new base G (444/159);  total (551/528)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 0.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1280 total aligned reads displayed.

CTTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGT  >  CP016816/105211‑105468
                                                                                                                                 |                                                                                                                                 
    ttAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATAtaatgaat                                                                                                                                <  1:92351/128‑1 (MQ=255)
    ttAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATAtaatgaat                                                                                                                                <  1:1761922/128‑1 (MQ=255)
     tAATCAAGCATTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                               <  2:2212234/128‑1 (MQ=255)
       aacAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaattta                                                                                                                             >  2:3251237/3‑128 (MQ=255)
        tCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGTATTTATTAATTTATTTATAATTTTAATATAAtaaatataa                                                                                                                            >  2:1777884/1‑128 (MQ=255)
        tCAAGACTTTTTTATTTGTAAAATCAATTATTATAGTATGATATAATAAAGATTAATGTTAATATATATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                            <  2:3483692/128‑1 (MQ=255)
        acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATaatgaatt                                                                                                                               >  2:2134942/2‑125 (MQ=255)
        acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAttaatttaa                                                                                                                            >  2:1908297/2‑128 (MQ=255)
        acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                            >  2:3579241/2‑128 (MQ=255)
        acAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAAtgaatttaa                                                                                                                            >  2:3897731/2‑128 (MQ=255)
         cAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATATTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTAGTATTTATTAGTTTATTTATAATTTTAATATAAttaatttaat                                                                                                                           >  2:3200016/1‑128 (MQ=255)
          aaGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGTATTGATTAGTTTATTAATCCTTATAATATAATtaatttaatt                                                                                                                          >  1:3758549/1‑128 (MQ=255)
           agacTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGAATAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATttaatta                                                                                                                         <  1:1094492/125‑1 (MQ=255)
            gCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATttaattaa                                                                                                                        <  1:494248/128‑1 (MQ=255)
            gCCTTTATTATTTGTAAAATAACTAATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAAAAATAAAATTAATTATTATTATTAATAATTAAATTAATAATTTAAATATAATTAATttaattaa                                                                                                                        >  2:667581/1‑128 (MQ=255)
             ccTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaa                                                                                                                       <  2:2882543/128‑1 (MQ=255)
             acTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTaaa                                                                                                                       <  1:3655206/127‑1 (MQ=255)
               ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTAGTATTTATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTAAATTAAAat                                                                                                                     >  1:3590091/1‑128 (MQ=255)
               ttttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTaaatt                                                                                                                     >  2:3676987/1‑126 (MQ=255)
                 ttttATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAatat                                                                                                                   >  2:3738317/1‑128 (MQ=255)
                           aaaaTCACATTAAATATTATGAAATAAAAAAGATTAATGATAATAAAAAATATCAAATTATTAATTACGATTTATTATTTTAAATAACCTTTTAAAATAATTAATTAAATTAAAATATTTTAATaaaa                                                                                                         <  1:2280014/128‑1 (MQ=255)
                            aaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTATATAAGTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaa                                                                                                        >  2:2430695/1‑128 (MQ=255)
                            aaaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAAGTATTTATTATTATTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaa                                                                                                        >  1:2635660/1‑128 (MQ=255)
                             aaTCACTTTTTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATAATATATTATTTAATTTATCCTTTAAAAATAAATAATTTAATTAAAATATTAAAATaaaaaa                                                                                                       >  2:150645/1‑128 (MQ=255)
                             aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATATATTAGTATTTATTATTTTATATATAATTTTAATATAATTAATATAATTAAAATATTTAAATaaaaaa                                                                                                       >  2:136190/1‑128 (MQ=255)
                             aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATttaatta                                                                                                                         >  2:569632/1‑110 (MQ=255)
                             aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaa                                                                                                       >  2:1158454/1‑128 (MQ=255)
                             aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaa                                                                                                       >  1:1569583/1‑128 (MQ=255)
                             aaTCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGAATGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaa                                                                                                       >  2:2773684/1‑128 (MQ=255)
                              ataaCTTATTATATTATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATTTTTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTaaaaaaaaaa                                                                                                      <  1:1391200/125‑1 (MQ=255)
                               tCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaa                                                                                                     >  2:3417610/1‑128 (MQ=255)
                                   ttttttttttttGAAATTAAAAAATTAAATGTTAATATAAATTTGATATTTATTTTTTTTTATTTTTTATTTTATTTATCCTTTTTATATAATTAATTTAATTAAAATTATTTAaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                 <  2:2006160/117‑1 (MQ=255)
                                   tttttatATTTTTAAATAATAAATATTTATTTTAAAATAAATTATCTAATTATTTTTTATGATTTATTATTTTATTTTACCTTTTAAAATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaa                                                                                                 <  1:3862445/125‑1 (MQ=255)
                                   ttattaatttATTAAATAAAAAATATTAATTTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATGATTTATTTTTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaa                                                                                                 <  2:1090343/119‑1 (MQ=255)
                                      ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAAATAGCTAAGTATTTATTATGATTGATTATTTAATTTATCATATTAATATAATGAATATAATAAAAATAAATTAATaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                              >  2:2550245/1‑128 (MQ=255)
                                          attATTAAATAATAAATATTAATTTAAAAATAAATTATCTAATTATTTATTATTATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                          <  1:2838715/126‑4 (MQ=255)
                                          aGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaaaaaca                                                                                          >  2:2318642/1‑126 (MQ=255)
                                           ttATTAAAAAAAAAATATTTATGTTAATATAAATTTTTTAATTTTTTTTTATGATTTTTTATTTTATTTTAACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACaa                                                                                        <  1:1179355/127‑1 (MQ=255)
                                            tATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                        >  2:1556813/1‑128 (MQ=255)
                                             aTGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                       >  2:1018876/1‑127 (MQ=255)
                                              tgtaataatAAATTTTAATGTTAAAATAAATTTGCTATGTATTTATTAGGTTTGTTTAGTTTTTTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGAc                                                                                     <  1:353913/125‑1 (MQ=255)
                                                aaaaaaaaaattttAATTTTTATATAAAATTTATTATTATTTATTTGTTTTTATTATTTTATTTAATAATTTAATATAAATAAATTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                   <  2:3068673/116‑1 (MQ=255)
                                                aaaTAATAAATATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                   <  1:1920901/128‑1 (MQ=255)
                                                aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                    >  1:3100286/1‑124 (MQ=255)
                                                   aaataatGATTATTTTTAATATAAATTATCTTTTTTTTTTTTATTTTTGATTTTTTTATTTATAATTTTAATATAATTAATTTTATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                <  2:2643540/127‑1 (MQ=255)
                                                   aaaataattttAATGTAAATATAAATTATCTAATTATTTATTATGATTTATTATTTTATTTTTTCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                <  2:3345644/119‑1 (MQ=255)
                                                       aaaTATTAATTTTTATATAAATTAGCTAATTATTTATTATGATTTTTTATTTTATTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTg                                                                            <  2:3848727/128‑1 (MQ=255)
                                                            ttAATTTTAAAATAAATTAGCTAATTATTTATTAGGTTTTATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                        <  1:1834761/128‑1 (MQ=255)
                                                            ttAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAACATAATAtttaaaaa                                                                       >  2:1675652/1‑122 (MQ=255)
                                                              aaTTTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGTTTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTT‑‑‑TAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACa                                                                   <  2:3777983/128‑1 (MQ=255)
                                                               aTGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAAACCAAAAATTTTTaaaaaaa                                                                   >  2:496404/1‑126 (MQ=255)
                                                                 tatAAAATAAATAAGCAAAGTATTTATTAGGATTCAACAGTTTATTTATCCATTTAAAAAAATTAATTTAAATAAAAAATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACa                                                                   <  1:735251/126‑1 (MQ=255)
                                                                  ttAATATATATTATCTAATTTTTTATTTTTTTTTATTATTTTATTTATCCATTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACCTAATATTGTTAAAAACaat                                                                 <  1:3410320/128‑1 (MQ=255)
                                                                  ttAATATAAATTATCTAATTTTTTATTATGATTGATTAGTTTATTTTTCCTTTTAAAATAATTAATTTTATTAAAAAATTTTAAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaa                                                              <  1:873372/128‑1 (MQ=255)
                                                                  ttAATATAAATTATCTAATTATTTATTATGATTTATTTTTTTATTTATACTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaat                                                                 <  1:2176514/128‑1 (MQ=255)
                                                                     atatAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAAAATTTATAAAAAAaataaa                                                              >  1:330807/1‑128 (MQ=255)
                                                                      tataAATTAGCTTAGTATTTATTAGTATTTATTATTTTTTTTATCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaat                                                             <  2:3308130/128‑1 (MQ=255)
                                                                       ataAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGACATAATATTGTTAAAAAAaattaatt                                                            >  1:3450593/1‑128 (MQ=255)
                                                                        ttaattatattaGTATTTTTTATGATTTATTTTTTTATTTTTACTTTTAATATAATGTATTTAATTAAAATAATTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                           <  1:1330992/117‑1 (MQ=255)
                                                                        taAATTATTTAATTTTTTAATATGATTTTTTTTTTTTTTTAAAATTTTAATATAATTAATTTAATTTAAATTATTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                           <  1:3704489/128‑1 (MQ=255)
                                                                        taAATTATATAAATATTTATTATGATTTTTTTTTTTTATATATATTTTTAAATAATTATTTTTATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                           <  2:1261338/128‑1 (MQ=255)
                                                                         aatttatatAATTATTTATTTTTATTTATTATTTTATTTAACATTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                           <  1:2444511/120‑1 (MQ=255)
                                                                          aaTTAGTTATTTTTTTATTATTATTTATTTGTTTAATTAACCTTTTAATATAATTTATTTTATTAAAATTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAATACAATTAATTAAg                                                         <  1:295332/128‑1 (MQ=255)
                                                                          aaTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                        <  2:1426360/128‑1 (MQ=255)
                                                                          aaTTAGATAAGTATTTTTTAGTATTGATTAGTTTATTTATTCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                        <  2:3532287/128‑1 (MQ=255)
                                                                           aatatcTAATTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATAATTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                        <  1:653741/123‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                  tCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTAAAAAAAAATTAATTAAGTATTTTTTTTTAAAATATTTTTTTTTAAAAAAtataaa                   >  2:3957916/1‑126 (MQ=255)
                                                                                                                   ccTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑ATCACCTATTATTGTTAAAAACAATTAATAAATTCTTAATTTTTTAAAAATTATTTTTTAAAAATTTTACAttt                >  1:1988944/1‑127 (MQ=255)
                                                                                                                   cattttAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATAAAATTTTAAAAAAAAATAAATTAAGTATTTATTTATTAAAAATAATTTTTTAAAAAATTTACAtt                 >  2:4006899/3‑128 (MQ=255)
                                                                                                                       ttAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAATAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGc             <  1:203617/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                         aaTATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAATTTTAAAAAAAAATAAAATAATTATTAATTAATAAAAAATTAAATTTTAAAAAAtataaatttacat            >  1:1686950/1‑119 (MQ=255)
                                                                                                                             taatgaatTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACATAATATTTTTAAAAAAATTAAATTAATTATTTATTAATTAAATTTTATTTTTTAAAAAATTAACATTGaaataaat        >  1:3940659/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                                             taatgaatTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAAtt       <  2:3151963/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                              aattaattTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTa      <  1:2752589/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               atttatttAATTAAAATATTTTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAACTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAg     <  2:345808/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                               attaattTAATTAAAAAATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTa      <  1:3485117/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 |                                                                                                                                 
CTTGTTAATCAAGCCTTTTTTATTTGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGT  >  CP016816/105211‑105468

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: