Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*CP016816105,3620A.41.7% 1200.7 / inf 1052intergenic (+857/+69)JCVSYN2_00420/JCVSYN2_00430translation elongation factor Tu/alanine‑‑tRNA ligase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (339/271);  new base . (120/316);  total (459/593)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.40e-20
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.11e-26

Only 100 of 1273 total aligned reads displayed.

TGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCAT  >  CP016816/105235‑105489
                                                                                                                                  |                                                                                                                                
  tAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATaaa                                                                                                                                >  2:1131841/1‑128 (MQ=255)
  tAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATATAATTAAAATATTTTAATaaa                                                                                                                                >  2:456146/1‑128 (MQ=255)
     aaTCACTTTTTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTATAATATATTATTTAATTTATCCTTTAAAAATAAATAATTTAATTAAAATATTAAAATaaaaaa                                                                                                                             >  2:150645/1‑128 (MQ=255)
     aaTAACTTATTATAGTATTAAATAATAAAGATTAATTTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAaaaaaaaa                                                                                                                             <  2:3465218/128‑1 (MQ=255)
         aatttatataTTATGAAATAATAAATTTTTATGTTAATATAAATTATTTAATTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaa                                                                                                                         <  1:989540/122‑1 (MQ=255)
             ttttttttATTAAATAATAAATATTAATTTTAAATTAAATTATTTAATTTTTTTTTATGATTTTTTATTTTTTTTTTACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                     <  2:2006152/121‑1 (MQ=255)
              ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTATCTAATTATTTATTAATATAAATAATTTTATATATAAAATTAATATAATAAATTAAATAAAAAAATAATAATaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                    >  2:2877033/1‑128 (MQ=255)
              ttatAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                    >  1:812627/1‑128 (MQ=255)
               tataGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATAAATTTAATAAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                                   >  2:1837471/1‑128 (MQ=255)
                   ttATTAAATAATAAATATTAATTTTAATATAAATTATTTAAGTTTTTTTTAGTATTTATTAGTTTTTTTATCCTTTTAAAATAATTAATTAAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaaaaacaa                                                                                                               <  1:2603523/127‑4 (MQ=255)
                    ttttaaaTAATAAATATTAATGTTAATAAAAATTATCTAATTATTTATTATGTTTTTTTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACaa                                                                                                              <  2:1311358/124‑1 (MQ=255)
                    tATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACaa                                                                                                              >  2:3043053/1‑128 (MQ=255)
                       gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacaaa                                                                                                           >  2:859665/1‑122 (MQ=255)
                       gAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                           >  2:313648/1‑125 (MQ=255)
                        taattatAAATATTAATGGTAAAATAAAATTGCTTATTATTTATTATGTTTTTTTATTTTTATTATCCTTTTAATTTAATTAATTTAATTTAAAATTTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCt                                                                                                         <  2:3428931/127‑1 (MQ=255)
                        aaaTAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                          >  2:63466/1‑124 (MQ=255)
                          ataaaataatttAATGTTAATAAAAATAAGTTAATTATTTATTTGTATTGTTTATTTTATTAATACTTTAAAATAAATTAATTAAATTAAAATTTTTTA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAat                                                                                                      <  2:3183180/118‑1 (MQ=255)
                           taataaAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACaaaaaaaaa                                                                                                       >  2:3245180/1‑121 (MQ=255)
                           taataaAGATTAATGTTAAAATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa                                                                                                       >  2:1031820/1‑121 (MQ=255)
                                  gATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAATACATAATATTTTTa                                                                                               >  2:3376550/1‑128 (MQ=255)
                                   tttAATTTTAATATAAATTATCAAATTATTTATTATGTTTTATTTTTTTATTTTTCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                                              <  1:2525084/127‑1 (MQ=255)
                                   aataaatttAAAAAAAATTATCAAAGATATTATTATTTTTTATTACTTTTTTTAAACTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTaa                                                                                              <  2:1569583/121‑1 (MQ=255)
                                       ttacgatcttaAATTATCTTATTTTTTATTTTGTTTTATTTTTTTTTTTATTCTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAAc                                                                                          <  2:3766931/119‑1 (MQ=255)
                                          ttAATATAAATTATCTAATTATTTATTATGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaa                                                                                        <  1:1445841/128‑1 (MQ=255)
                                             aaataAATTTTCTAAGTATTTATTTGGTTTTTTTACTTTAATTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACaattaa                                                                                    <  2:2252732/126‑1 (MQ=255)
                                               ataAATTATCTAAGTATTTTTTATGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                                                 <  1:3860777/128‑1 (MQ=255)
                                                aaaatttcgtAAGTATTTTTTATGTTTTATTATTTTTTTTATACTTTTAATATAATTTATTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAattaatta                                                                                 <  2:2312615/119‑1 (MQ=255)
                                                 aaaTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA‑‑AAATATTTTAAAAAAAAAttaataaaa                                                                               >  2:747137/1‑127 (MQ=255)
                                                 aaaTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACATAATATTTTTAAAAAAAAttaattaa                                                                                >  1:345957/1‑128 (MQ=255)
                                                  aaTTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGt                                                                              <  2:1426360/128‑1 (MQ=255)
                                                  aaTTAGATAATTATTTTATTTTATTGATTAATTTATTTATACTTTTAAAATAATTAAATTAATTAAAAAAATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAAttaattaa                                                                                <  1:2652472/128‑1 (MQ=255)
                                                     tatatAATTATTTATTATTTTTTATTATTTTATTTATAATTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCt                                                                           <  1:3200016/124‑1 (MQ=255)
                                                       tcaaattatttattTTGATTGATTTTTTTATTTAAACTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTg                                                                         <  2:945750/122‑1 (MQ=255)
                                                       tcTAAGTTTTTATTATGTTTTATTATTTTATTTATCCTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTg                                                                         <  1:3766320/127‑1 (MQ=255)
                                                       gCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAATATTTTTAAAAAAAAtaaataaataatta                                                                          >  2:3879599/1‑122 (MQ=255)
                                                          atttatttattATGATTGATTTTTTTTTTTTATCTTTTAATATAATTATATTAATTAAAATTTTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGa                                                                        <  1:1785186/125‑1 (MQ=255)
                                                          aattatttattTGGATTTATTATTTTATTTATACTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGAtt                                                                      <  1:3679403/125‑1 (MQ=255)
                                                           aGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTAATATTTTTAAAAAAAAttaattaataattaatttt                                                                     >  2:3660207/1‑117 (MQ=255)
                                                           aGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGAACAAATATTTTTAAAAACAATTAATTAATTCtttattta                                                                    >  2:3980967/1‑128 (MQ=255)
                                                            ttattttttAGGAATTATTAGTTAATTTATCCTTTTAAAATAATTAAATTAAATAAAAAATTTTA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttat                                                                   <  1:3906883/127‑1 (MQ=255)
                                                            ttatttattAGTATTTATTATTTTATTTATCCTTTTAAAAAAATTAATTTATTTAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATtta                                                                    <  1:627352/127‑1 (MQ=255)
                                                            gTATTTAATATGATTTTTTATTTTAATTATAAATTTAAAATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATtta                                                                    <  1:3998782/128‑1 (MQ=255)
                                                             tttttattATGATTGATTATTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttat                                                                   <  1:2347334/126‑1 (MQ=255)
                                                              ttttattAGTATTTATATTTTTATTTATACTTTTAAAATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttatta                                                                 <  1:336110/127‑1 (MQ=255)
                                                              atttattATTTTTGATTAGTTTATTTATCATTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttatt                                                                  <  1:1333873/128‑1 (MQ=255)
                                                               tttatttttatttattATTTTAATTATAATTTTAATATAATTTAATTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATttatta                                                                 <  1:699157/119‑1 (MQ=255)
                                                                ttatttTGATTGAATATTTTATTTATAATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAAAATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTaa                                                                <  1:884799/128‑1 (MQ=255)
                                                                ttattaGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAATTAAATATTTATTTATaaa                                                                >  2:2412409/1‑128 (MQ=255)
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                                                                       gattgattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAATACTAAATATTTTTAAAAAAAATTAATAAATTATATATTTTTTAAAtattat                                                         >  2:1735286/1‑128 (MQ=255)
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                                                                           gattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAAAATATTTTAAAAAAAAATTAATAAAGTATTTATATATTAAATATTAttttt                                                     >  2:3338331/1‑128 (MQ=255)
                                                                           gattAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑‑‑AAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTTTTAAAAACAATTAATTAATTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTaa                                                  >  1:3076636/1‑128 (MQ=255)
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                                                                             tttttttatttaTATTTTTAATAAAATTAATTTAATTAAAATTATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTa                                                   <  2:2077544/124‑1 (MQ=255)
                                                                             ttATTTTTTTTATAATTTTAATATATTTATTTTAATTAAAATAATTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTaa                                                  <  1:1606758/128‑1 (MQ=255)
                                                                             ttAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCAAATTATTTTAAAAACAATTAATTAAGTATTGATTTATTAAATTTTATTTTTTa                                                   >  2:2145501/1‑128 (MQ=255)
                                                                               tttttatttaTCATTTTAATATAATTAAATTAAATAAAATATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAAc                                                 <  1:2757126/126‑1 (MQ=255)
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                                                                                     aattttaattttAATATAATTTATTTAATTAAAAATATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAAt                                             <  2:1885951/120‑1 (MQ=255)
                                                                                      tttatCATTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATATTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAAttt                                           <  1:4039059/128‑1 (MQ=255)
                                                                                      tttatACTTTTAATATAATTAATTTATTTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATAATATTTTTTAACAAAtt                                            <  1:2133444/128‑1 (MQ=255)
                                                                                         ttcattttAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCt                                       <  1:2012517/124‑1 (MQ=255)
                                                                                         atCCTTTTAATATAATGAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAATTTTAAAAAAAAATAATTAAATAATTAATTTATAAAATATATTTTTTTAAAAAATTAAc                                         >  1:2288742/1‑128 (MQ=255)
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                                                                                                           atttaattAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACATAATATTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACATTGAGCTAAATTAGCtttt                     >  1:3715943/1‑128 (MQ=255)
                                                                                                           atttaattAAAATATTTTAAT‑‑AAAAAAAAAAAAAAAACAAGACAAAATATTTTTAAAAACAAATAATTAATTCTTGATTTATTAAATATTTTTTTTTAAAAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGtta                     >  2:3719819/1‑127 (MQ=255)
                                                                                                             ttaattaaAATATTTTAAT‑‑‑AAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtcct                  <  1:2236454/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                             ttaattaaAAAATTTTA‑‑AAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtcc                   <  2:4019892/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                attaaAATATTTTTATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTtcctc                 <  1:1898077/128‑1 (MQ=255)
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                                                                                                                      aaTATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACATAATTTTTTTAAAAAAAATTAATTAATTATTTATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACATTTATATAAATTAGATTTtcataaaaat            >  1:2407782/1‑120 (MQ=255)
                                                                                                                      aaTATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCAAAAATTTTTAAAAACAATTAATTAAATATTTATTTAATAAAATTTATTTTTTAACAAATTTAACTTTAACTAAATTATCGTTtccacccaaa            >  2:2599850/1‑124 (MQ=255)
                                                                                                                         atTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTa         <  2:514375/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                           tttAAATAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAg        <  1:1063766/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                            tatataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAg        <  1:1140032/122‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                 aaaaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGAACTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCa   <  1:3402969/127‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                  aaaaaaaaaaaaaaaaaaCAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCAt  <  1:1972350/128‑1 (MQ=255)
                                                                                                                                  |                                                                                                                                
TGTAAAATCACTTATTATAGTATGAAATAATAAAGATTAATGTTAATATAAATTAGCTAAGTATTTATTAGGATTGATTAGTTTATTTATCCTTTTAATATAATTAATTTAATTAAAATATTTTAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAGACCTAATATTGTTAAAAACAATTAATTAAGTCTTGATTTATTAAATATTATTTTTTAACAAATTTACCTTGAGCTAAATTAGCGTTTCCTCCACCTTTAGTCTCAT  >  CP016816/105235‑105489

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: