Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_021214 | 1,831,886 | C→A | intergenic (‑141/+126) | TMARI_RS09460 ← / ← TMARI_RS09465 | sugar ABC transporter substrate‑binding protein/carbohydrate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_021214 | 1,831,886 | 0 | C | A | 99.5% | 737.5 / ‑3.7 | 183 | intergenic (‑141/+126) | TMARI_RS09460/TMARI_RS09465 | sugar ABC transporter substrate‑binding protein/carbohydrate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (90/92); total (91/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.74e-01 |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GTGATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATCACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTGA > NC_021214/1831652‑1832120 | tGATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATaacaca > 2:338448/1‑239 (MQ=255) gATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACAt > 2:166449/1‑239 (MQ=255) ggTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACGTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCa < 1:469179/239‑1 (MQ=255) aTTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCa < 1:855550/239‑1 (MQ=255) aTTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCa < 1:883737/239‑1 (MQ=255) aTTGTCATGTCCGCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCa < 2:695371/239‑1 (MQ=255) tCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTAtt > 1:75563/1‑239 (MQ=255) tCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTAtt > 2:374173/1‑239 (MQ=255) cTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTAttt > 2:224188/1‑238 (MQ=255) aaaaCAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGa > 1:734995/1‑239 (MQ=255) aaaaCAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGa < 1:440153/239‑1 (MQ=255) aaaaCAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGa < 2:201207/239‑1 (MQ=255) aaacaaacACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGac > 1:727200/1‑238 (MQ=255) acaaacaCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGaaaa > 2:677028/1‑239 (MQ=255) cacCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAAAACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACaaaa > 2:330955/1‑239 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATTAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACAATGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGa < 2:712959/239‑1 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGa < 1:827777/239‑1 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGa < 2:778370/239‑1 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGa < 1:919095/239‑1 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGa < 2:440773/239‑1 (MQ=255) agcaAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGc < 1:876245/237‑1 (MQ=255) gcaAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCAACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAg > 2:317367/1‑239 (MQ=255) caAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCCCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGa < 2:101003/239‑1 (MQ=255) aaaaTCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGa < 2:746792/238‑1 (MQ=255) cATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATAtctc < 2:287105/239‑1 (MQ=255) cAAGCAACAGCAAAACTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACGTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATAATATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGAt < 1:443693/239‑1 (MQ=255) aGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATaa > 2:323643/1‑239 (MQ=255) aCAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTc > 2:504635/1‑239 (MQ=255) cAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGAATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAaat > 2:51945/1‑239 (MQ=255) aaaCCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCa < 2:180212/235‑1 (MQ=255) ccTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAACACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAaataat > 1:918869/1‑238 (MQ=255) ttCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCaaa < 1:139705/231‑1 (MQ=255) gAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTa < 1:694612/181‑1 (MQ=255) aaaaCACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCaaa < 1:816598/239‑1 (MQ=255) acCTCCCATCTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAatat < 1:13227/239‑1 (MQ=255) tCCAAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTAATGATAAATTCAAATAATTCCAAACAATCAAAAATATCt > 2:103096/1‑238 (MQ=255) cccAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTa > 2:806550/1‑238 (MQ=255) ccAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTa > 2:513588/1‑237 (MQ=255) aCTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTaa > 1:473744/1‑239 (MQ=255) ttAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTaaaa < 2:846461/239‑1 (MQ=255) ttAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTaaaa < 1:283228/239‑1 (MQ=255) aaGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATTCACCTAAAATg > 1:367581/1‑239 (MQ=255) aaGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATg > 2:580799/1‑239 (MQ=255) aaGATGAAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATg > 2:604108/1‑239 (MQ=255) gATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTaaa < 1:103577/234‑1 (MQ=255) aTGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATCTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGtt < 2:797934/239‑1 (MQ=255) tGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGt < 1:117490/237‑1 (MQ=255) tGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTg < 1:902966/239‑1 (MQ=255) aaTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTg > 2:435594/1‑236 (MQ=255) aaTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTg < 1:435594/236‑1 (MQ=255) aaTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatt > 1:169413/1‑239 (MQ=255) aTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAATTAATTACCAACAATCAAAAATATCTACGTAAAATGGTTGatta > 1:768076/1‑239 (MQ=255) aTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatta > 1:55047/1‑239 (MQ=255) aTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTAATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatta > 1:337627/1‑239 (MQ=255) aaaaTTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTaa < 1:166449/239‑1 (MQ=255) aaTTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATCAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAAc > 2:115690/1‑238 (MQ=255) cGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTcac < 2:891760/239‑1 (MQ=255) cATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAg < 1:602547/239‑1 (MQ=255) gTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCa < 1:312056/239‑1 (MQ=255) gTATTTCATATCCGAAAAAACCCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATAATAATTTCCAAAAGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCa < 2:322385/239‑1 (MQ=255) tttCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCa < 1:574090/239‑1 (MQ=255) tttCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCa < 1:517356/239‑1 (MQ=255) tttCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCACCAGc > 1:368801/1‑238 (MQ=255) cATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGattat < 2:136959/215‑1 (MQ=255) cATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTc > 1:65373/1‑239 (MQ=255) cATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTc > 1:184838/1‑239 (MQ=255) tatCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCa > 2:251584/1‑238 (MQ=255) tCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGat < 2:53805/148‑1 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTaa > 1:388386/1‑213 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTaa < 2:388386/213‑1 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGcc > 1:667926/1‑239 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGcc < 1:225732/239‑1 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGcc < 2:169413/239‑1 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGcc < 1:452286/239‑1 (MQ=255) ccGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGcc < 2:146978/239‑1 (MQ=255) gAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAg < 1:599249/239‑1 (MQ=255) acaaacCGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGAAGGATATTAAATTCCACAGGAATTAAATTAATCAAGAACATATTATCACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCATATTTCCACTCGAAAACAAAACATAGGGCAAGATATTACATGATAAATTAAAATAATTCCCAACATTCACAAATATCTACCCAAAAAGTTTGATTAGTAACCTGTCACCTCACAAGCACCCAAGCCa > 2:399428/3‑237 (MQ=255) gCTTTTTCTGCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAAGAATTAAATCAATCCAGAACATATTAAAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGAtt < 2:805592/239‑1 (MQ=255) cTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTAAAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGAttc < 1:323643/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaCGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTaaaa < 1:328656/177‑1 (MQ=255) aaacgCAAGATAATAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACg < 1:224188/239‑1 (MQ=255) aacgCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATCAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACg < 1:115690/238‑1 (MQ=255) aaTTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTgg < 1:765091/239‑1 (MQ=255) aTTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGa < 1:535546/239‑1 (MQ=255) tCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCAAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGc > 1:804322/1‑239 (MQ=255) cAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGt > 2:559635/1‑239 (MQ=255) cAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGt > 2:585460/1‑239 (MQ=255) attaaatcaaTCCAGAACATATTATAACCCATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGACGCGTGACGATa > 2:879965/1‑239 (MQ=255) taaTCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTg < 2:918869/239‑1 (MQ=255) caaTCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTg < 1:374173/238‑1 (MQ=255) aTCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCg > 2:577070/1‑239 (MQ=255) ccAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGc < 2:184838/239‑1 (MQ=255) gAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCAt > 2:941444/1‑239 (MQ=255) gAACATATTATAACAAATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACATTATTTCCACAAGAAAAAAAAAGATAAGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATAAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACACTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATAACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCAGCGGCCAt > 1:475821/1‑239 (MQ=255) tattatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGa > 1:2399/1‑236 (MQ=255) attatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTgg < 1:462412/180‑1 (MQ=255) attatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg > 2:828846/1‑239 (MQ=255) attatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg > 1:265008/1‑239 (MQ=255) attatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg > 2:734633/1‑239 (MQ=255) tataACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTGa > 2:85321/1‑238 (MQ=255) | GTGATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATCACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTGA > NC_021214/1831652‑1832120 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |