Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_021214 | 1,831,886 | C→A | intergenic (‑141/+126) | TMARI_RS09460 ← / ← TMARI_RS09465 | sugar ABC transporter substrate‑binding protein/carbohydrate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_021214 | 1,831,886 | 0 | C | A | 99.6% | 923.8 / NA | 245 | intergenic (‑141/+126) | TMARI_RS09460/TMARI_RS09465 | sugar ABC transporter substrate‑binding protein/carbohydrate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (121/123); minor base T (1/0); total (122/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TGAGTGATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATCACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTGACC > NC_021214/1831649‑1832122 | gAGTGATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATaac > 2:360397/1‑239 (MQ=255) tggATTTCAGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCACAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATaacac < 1:360397/237‑1 (MQ=255) gATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACAt < 2:27050/239‑1 (MQ=255) gATTTAGGTGCCAAAAGTATTGTCAAGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCATCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGAAGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTTCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACAt < 1:1027653/239‑1 (MQ=255) ttCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTgc > 2:629265/1‑239 (MQ=255) ggTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCa > 2:310889/1‑239 (MQ=255) aaaaGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGttt > 2:646584/1‑240 (MQ=255) tATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCa > 1:869377/1‑240 (MQ=255) tATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCa > 1:343634/1‑240 (MQ=255) tATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCa > 2:2892/1‑240 (MQ=255) aatGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCaa < 2:1026004/238‑1 (MQ=255) ttttCATGTCCGCAGAGAAAACAAACCCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAATCTTTCCTCATTAAAAACTCCTTCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACTCATTGCGCAGCGGTTTTTTCaaa < 1:98859/237‑1 (MQ=255) tGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTAt > 1:431993/1‑240 (MQ=255) cAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTACGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTcc > 1:776076/1‑238 (MQ=255) aaagaAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACt < 1:630276/238‑1 (MQ=255) gaAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACt < 2:409987/237‑1 (MQ=255) aaaaCAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGaa < 2:221082/240‑1 (MQ=255) aaaaCAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGaa < 2:122440/240‑1 (MQ=255) aaacaaacACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGaa < 2:372893/239‑1 (MQ=255) aaacaaacACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGaa < 2:84537/239‑1 (MQ=255) aacaaacaCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGaaaa < 2:388674/240‑1 (MQ=255) aaacaCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACaa < 2:502655/240‑1 (MQ=255) aaacaCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACaa < 2:212981/240‑1 (MQ=255) aaacaCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACaa < 1:556352/240‑1 (MQ=255) aaacaCCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACaa < 1:240583/240‑1 (MQ=255) acacCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACaaaa > 2:913475/1‑240 (MQ=255) ccGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGAt < 1:570180/240‑1 (MQ=255) cGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATa > 2:6639/1‑240 (MQ=255) aCAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAgg < 2:588329/240‑1 (MQ=255) agcaAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGc < 1:653686/237‑1 (MQ=255) caAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGat > 1:218173/1‑240 (MQ=255) aaaaTCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGat < 2:1163127/239‑1 (MQ=255) aaaaTCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGat < 2:192589/239‑1 (MQ=255) aaaaTCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGa < 2:726281/238‑1 (MQ=255) cATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCa > 2:1184631/1‑240 (MQ=255) cATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCa < 1:338170/240‑1 (MQ=255) aaGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATaa > 1:696470/1‑240 (MQ=255) aaGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATaa > 2:161281/1‑240 (MQ=255) gCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAAt > 2:706601/1‑240 (MQ=255) aaCCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAaataat > 1:964292/1‑240 (MQ=255) tttCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTccc > 1:893531/1‑240 (MQ=255) tttCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTccc > 2:205958/1‑240 (MQ=255) cTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCcaaca < 1:386191/240‑1 (MQ=255) tCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGTCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCcaacaa < 2:963802/240‑1 (MQ=255) tCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCcaacaa < 1:188730/240‑1 (MQ=255) tCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCcaacaa < 1:404016/240‑1 (MQ=255) cATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCcaacaa > 2:782964/1‑239 (MQ=255) cATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCcaacaa > 2:55449/1‑239 (MQ=255) tGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGAt > 2:513371/1‑195 (MQ=255) tGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCa > 2:976188/1‑240 (MQ=255) ttAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAAt < 1:1067922/240‑1 (MQ=255) tAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATg < 1:856943/240‑1 (MQ=255) tAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATg > 1:723046/1‑240 (MQ=255) aaGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGc > 1:508702/1‑180 (MQ=255) aTGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTATCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTg < 1:706601/240‑1 (MQ=255) tGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGa < 2:591896/240‑1 (MQ=255) tGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGa < 2:765535/240‑1 (MQ=255) tAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatt > 2:855094/1‑240 (MQ=255) tAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatt > 1:309677/1‑240 (MQ=255) aaTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatta > 2:455961/1‑240 (MQ=255) aaTTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGatta > 2:698887/1‑240 (MQ=255) tAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTaa < 1:15888/240‑1 (MQ=255) aaaaTTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAAc < 1:205836/240‑1 (MQ=255) aaaaTTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTATAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAAc < 1:1056542/240‑1 (MQ=255) aaaaTTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTaa > 1:764430/1‑239 (MQ=255) aaaaTTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAAc < 2:814675/240‑1 (MQ=255) aTTAACGCAAATGTATTTCATATCCGAATAAACGCGTGTGCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACCCATTGCGCAACTGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTATAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCAAAAATGGTTGATTATTAACCCt < 1:659874/240‑1 (MQ=255) tAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGCTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAACGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTc > 2:189925/1‑240 (MQ=255) aCGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTcac > 1:1164525/1‑240 (MQ=255) gTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAg < 1:59430/240‑1 (MQ=255) tATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGc > 2:330050/1‑240 (MQ=255) tttCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAg > 1:918285/1‑147 (MQ=255) tCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTc > 2:444968/1‑240 (MQ=255) atatCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCaa > 1:481650/1‑240 (MQ=255) atatCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCaa > 2:543982/1‑240 (MQ=255) atatCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCAAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCaa > 1:699855/1‑240 (MQ=255) tatCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTa < 2:230932/195‑1 (MQ=255) atCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGc < 2:402398/240‑1 (MQ=255) gAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCa > 1:119118/1‑238 (MQ=255) gCTTTTTCTTCAAGAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGAttc < 2:1050691/240‑1 (MQ=255) cTTTTTCTTAAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGAttct < 2:1211528/240‑1 (MQ=255) tcAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGa > 2:874959/1‑240 (MQ=255) cAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGaa < 1:789750/240‑1 (MQ=255) tatTAATTTCCAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCAAAAg > 1:1211997/1‑240 (MQ=255) ccAAAGGAATTAAATCAATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTcc < 1:1005318/70‑1 (MQ=255) aattaaatcaATCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATa > 1:53243/1‑240 (MQ=255) attaaatcaaTCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATaa < 2:343634/240‑1 (MQ=255) taaatcaaTCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACg < 1:224883/240‑1 (MQ=255) aaTCCAGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCg > 1:290322/1‑240 (MQ=255) aGAACATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCAt > 2:1126155/1‑240 (MQ=255) aCATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCTGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCAt < 2:776076/237‑1 (MQ=255) aCATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCAt < 1:1126155/237‑1 (MQ=255) aCATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCAt < 2:893531/237‑1 (MQ=255) aCATATTATAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATg < 2:519392/238‑1 (MQ=255) tattatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAACCAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAACACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATCAGGTg > 2:805760/1‑240 (MQ=255) tattatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg > 1:1146448/1‑240 (MQ=255) tattatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg < 2:178862/240‑1 (MQ=255) tattatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg > 1:711041/1‑240 (MQ=255) tattatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTg > 1:66655/1‑240 (MQ=255) ttatAACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTGAc < 1:646584/240‑1 (MQ=255) | TGAGTGATTTCGGTGCCAAAAGTATTGTCATGTCCTCAGAGAAAACAAACACCGACAGCAGCAAAATCATACCAAGCAACAGCAAACCTTTCCTCATGAAAAACACCTCCCAACTTAAGATGTAATTTAAAATTAACGCATATGTATTTCATATCCGAAAAAACGCTTTTTCTTCAAAAAAAACGAAACGCAAGATATTAATTTCCAAAGGAATTAAATTAATCCAGAACATATTATCACACATTGCGCAACGGTTTTTTCAAACCTTATTTCCACTAGAAAACAAAAGATAGGGCAAGATATCTCATGATAAATTCAAATAATTCCCAACAATCAAAAATATCTACCTAAAATGGTTGATTATTAACCCTTCACAGCCCCAGCACTCAAGCCAGCTATGATTCTGTTCTGGAAGACCAAAACGAGTATCACAAGTGGAAGCGTGACGATAACGGCTGCGGCCATGAGCTGACC > NC_021214/1831649‑1832122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |