Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | NC_021214 | 1,110 | +CTCCACAATGAAAAGAATAGATGGTAAGGTGTGCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAAC | intergenic (+1035/+2045) | TMARI_RS09660 → / ← TMARI_RS00005 | hypothetical protein/IGHMBP2 family helicase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_021214 | 1081 = | 44 (0.130) | 215 (0.740) +AAGCACACCTTACCATCTATTCTTTTCATTGTGGAG |
104/378 | 0.9 | 84.6% | noncoding (670/2694 nt) | CRISPR | repeat region |
? | NC_021214 | = 1110 | 49 (0.140) | noncoding (699/2694 nt) | CRISPR | repeat region |
Only 100 of 524 total aligned reads displayed.
AACGCGACAAGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGC > NC_021214/842‑1315 | cgcgACAAGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGtt > 1:773341/1‑240 (MQ=255) aagttttaccttttctcagacaacttcaactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTc < 2:203285‑M1/5‑1 (MQ=255) caaCGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACt < 2:62624/236‑1 (MQ=255) cACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACtt > 2:1324054/1‑238 (MQ=255) cGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCtt < 1:160808/240‑1 (MQ=255) tctcagacaacttcaactggaaaagtttcaatccttccttagaggtattgaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTag > 2:401224‑M1/223‑240 (MQ=255) tctcagacaacttcaactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTag > 1:709899‑M1/223‑240 (MQ=255) tctcagacaacttcaacaagaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTag > 2:344301‑M1/223‑240 (MQ=255) tCATGCACGGGGTGTTATCTGAGTTTCAATTCTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGTAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTag < 2:325560/239‑1 (MQ=255) tcagacaacttcaactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTagag > 1:257165‑M1/221‑240 (MQ=255) ggCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATCCTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGt > 1:980853/1‑240 (MQ=255) gAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGa > 2:38721/1‑240 (MQ=255) acttcaactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggcgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGa < 1:865247‑M1/27‑1 (MQ=255) cttcaactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGaa > 1:1022697‑M1/213‑240 (MQ=255) cccTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctcca > 1:38721‑M2/1‑235 (MQ=255) aaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATc > 1:138097‑M1/202‑240 (MQ=255) aaagttacaatccttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacgtgcgatcatacaattttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATc > 2:1375584‑M1/202‑240 (MQ=255) aGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatg < 1:1222914‑M2/240‑11 (MQ=255) gTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatg > 1:627127‑M2/1‑229 (MQ=255) tctGCCTTAAAGGTATGAAAACAATTTTTACCTTTTCGCAGACTACTTGAACAAGAAAAGTTTAAATACTTCCTTAAAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaata > 2:759577‑M2/2‑221 (MQ=255) ttCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaataga < 1:426636‑M2/240‑22 (MQ=255) ttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATAtt < 1:563075‑M1/54‑1 (MQ=255) atggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagacatcgcaaaggaggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaagcattgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAATTCTCGTATACGATATAATTATTATTCCTtcttat < 2:547148‑M1/64‑1 (MQ=255) tgaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgataatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTatat > 1:472133‑M1/175‑240 (MQ=255) gAAAAAAGTTTTACCTTCTCTCAGACATCTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgctt > 2:1101692‑M2/1‑204 (MQ=255) aaCAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACt > 1:346633/1‑183 (MQ=255) aactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGtt < 1:526842‑M1/69‑1 (MQ=255) actcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGttt < 2:852881‑M1/70‑1 (MQ=255) ttattttttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatactgccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATAc > 2:773341‑M1/165‑240 (MQ=255) tttacaaagacatgcgataattcaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaagtgggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTag > 1:968964‑M1/157‑240 (MQ=255) tctcATACAACTTAATCTGGAAAAGTTTAAATTCTTCCTTAGAAGTTTGGAAAATCGATTATTTATTTTAAAAAGACATGCGATCATACAAGTTACAATTCTTCCGTAGAGGTATGGAAACTATTCGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTAATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGTTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttag > 2:1071587‑M2/1‑186 (MQ=255) tctcAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttag > 2:509871‑M2/1‑186 (MQ=255) ttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTaga < 1:1468927‑M1/85‑1 (MQ=255) ttacaaagacatgagatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTaga > 1:299477‑M1/156‑240 (MQ=255) aagtttcaatacttccttagaggtagggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGt > 1:1028943‑M1/134‑240 (MQ=255) agtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGTTATGGAAACCCGCATCTCGTa < 1:1121544‑M1/108‑1 (MQ=255) cTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAAAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgcaaagactagatggtaaagtgtgcatgttttaatacttccttagaggtatggaaactcaagaatacgatataattca < 2:140208‑M2/240‑88 (MQ=255) tccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaagcgcaaaggtggtaatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTAttgcttgc > 1:1173665‑M1/121‑240 (MQ=255) agagGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGATGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgcaaagaataaatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatgtaaaccatagaatccgatataatcatatttcct < 2:523167‑M2/240‑95 (MQ=255) ggTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttat < 1:1350199‑M2/240‑98 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGTTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggggtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatagttcctaattat < 2:866725‑M2/240‑101 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattat < 2:98586‑M2/240‑101 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattat < 1:1150647‑M2/240‑101 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaat < 1:831795‑M2/184‑45 (MQ=255) aTGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctcaacaatgaaaagaatagacggtaatgtgtgcttgtttcaatacttccttagaggaatggaaacactcgaatctgatctaatccgatttctttattaa < 2:1036483‑M2/240‑101 (MQ=255) atggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGCATCTCGTAGGCATTGCTTGCCTTCTGTTc < 2:91231‑M1/129‑1 (MQ=255) ggAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatat > 1:310361‑M2/1‑138 (MQ=255) ggAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatat > 1:225453‑M2/1‑138 (MQ=255) aaCTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtt < 1:619743‑M2/240‑106 (MQ=255) aactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATAc < 2:254418‑M1/10‑1 (MQ=255) aactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTatat < 2:481172‑M1/66‑1 (MQ=255) cTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttc > 1:1420372‑M2/1‑133 (MQ=255) cTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttc < 1:479873‑M2/240‑108 (MQ=255) tattTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 2:1459527‑M2/1‑127 (MQ=255) tattTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 1:264789‑M2/1‑127 (MQ=255) tattTCTTTGACAAAGACATGCGAGCATACAAGTGTCAATACCTCCTTAGATGTATGGAAACTATACGTAGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTGCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaattcttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 1:1438839‑M2/1‑127 (MQ=255) cgttgtagaaatcgcaaaggtgatgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 1:1327536‑M1/98‑240 (MQ=255) ttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt < 1:205871‑M1/144‑1 (MQ=255) ttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTAAGAGGAAGGGAAACCCGCTTCTCGAAGTAATTCTTTGCTTTCTGTTCCCTTgtttcataatt < 2:834553‑M1/144‑6 (MQ=255) tagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGTTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCt < 1:489083‑M1/148‑1 (MQ=255) agaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCtt > 2:584353‑M1/92‑240 (MQ=255) aggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGAAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTCCCTTAGAGGTATGGa < 2:968843‑M1/160‑1 (MQ=255) gCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaata > 2:1263174‑M2/1‑107 (MQ=255) ggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGaaact < 1:445998‑M1/164‑1 (MQ=255) tCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgca > 1:1307231‑M2/1‑103 (MQ=255) ttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGtt < 2:144846‑M1/128‑1 (MQ=255) tccaattctttcttaatggtaggaaaactataacaatgaacagattagaggtgaccatttgcttGTTTCAATACTTCCTTAGATGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTGCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAAt > 2:364020‑M1/65‑240 (MQ=255) tCAATCCGTACTTAGAGTTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggta > 1:913567‑M2/1‑92 (MQ=255) tccttagatgtatgcaaacctcaacaatgaaaagaatagatggttaggtgtgctaGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa > 2:1301731‑M1/56‑240 (MQ=255) gctttagatgtatggaatgcgcctcaattaaaagaatagatgctaagatgtgtttGTTTCAATCCTTCCTTAGAGGTATGGAACCTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTGAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa > 2:429451‑M1/56‑240 (MQ=255) ctcttggatgtatggaaacttccacaaagaaaagaatatatggtaaggtgttcttGGTTCCATACTTCCTTATAGGTATGGAAAACGTTGAATACGATTTTATCATATTTACTTTTTATATGTTTCAATTCTTCCCTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGaa > 2:1121544‑M1/56‑240 (MQ=255) tCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttg < 1:758863‑M2/239‑156 (MQ=255) ggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGa < 1:67677‑M1/193‑1 (MQ=255) tatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCtt > 2:233790‑M1/46‑178 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACt > 2:1427579/1‑54 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttag > 2:971885‑M2/1‑73 (MQ=255) aaCTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtt < 1:131955‑M2/240‑173 (MQ=255) aaCTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtt > 1:992740‑M2/1‑68 (MQ=255) cctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt > 1:713856‑M1/38‑181 (MQ=255) cctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACt < 2:713856‑M1/144‑1 (MQ=255) ctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTcc < 1:1199759‑M1/57‑1 (MQ=255) cTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatcc < 2:1218662‑M2/142‑77 (MQ=255) ccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAAt < 2:1470456‑M1/206‑1 (MQ=255) ccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAAt < 1:1064673‑M1/206‑1 (MQ=255) gTTTTAGGAATCGCAAATGTGCTCATTTTAGTTTCACTACTTCCTTATATGTATGGAAACctcctcaatgaaaagaatagatggtaagttgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatccttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatact > 2:287345‑M2/1‑60 (MQ=255) gTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatact < 1:584353‑M2/240‑181 (MQ=255) gTTGTAGAAATCGAAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATTCTTCTTTAGAGTTATGGAAACctccacaatgaaaagaagagatggtaaggtgttcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgcctgctgttcccttgtttcaatact > 2:115821‑M2/1‑60 (MQ=255) ttGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatactt < 2:174928‑M2/240‑182 (MQ=255) ttGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatact < 1:1296958‑M2/239‑181 (MQ=255) tAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact > 1:701053‑M2/1‑56 (MQ=255) tAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatact < 2:701053‑M2/169‑114 (MQ=255) tCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagagg < 1:745001‑M2/240‑191 (MQ=255) aaaGGTGGTAATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtttgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatg > 2:1350199‑M2/1‑46 (MQ=255) aaGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAATCctgcatcatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcatgttttaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgtatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatgg > 1:1138146‑M2/1‑45 (MQ=255) taaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGt < 2:1142990‑M1/107‑1 (MQ=255) tgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTTCTTAGAGGTATGgaaacgaaac < 2:651251‑M1/233‑1 (MQ=255) gtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGgaaacgaaac < 1:1357732‑M1/233‑1 (MQ=255) ttAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgtt > 1:144846‑M2/1‑33 (MQ=255) ttAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaata > 2:8008‑M2/1‑33 (MQ=255) ttAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaata < 1:8008‑M2/52‑20 (MQ=255) | AACGCGACAAGCCCACGTTCAGGCACGAGGTGTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGC > NC_021214/842‑1315 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |