New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_021214 | = 141342 | 453 (1.310) | 45 (0.130) | 22/448 | 16.1 | 9.0% | coding (409/1233 nt) | TMARI_RS00650 | transposase |
? | NC_021214 | 141347 = | 454 (1.320) | coding (404/1233 nt) | TMARI_RS00650 | transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 472 total aligned reads displayed.
ATACCTGGTGCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGACAAAGAAGCGTGCCACTCTCCGTTGATCTTTTTGAAGCTTGCAGTTCGGTTGTACGTGTATTTGACGATCAAGCTCTTTCGCTTCGGTGGTTTATCCCAGAACTTCTTGACAGCTTTTGAATCAGGTTTGCGGCGCTTGAGTTCTTTGAACTGAGCCCAGAGAGTTTTGTACATTGCAGAGACGTCTCTGTTTACGTTAATAGCCATCTGTGCTGGAAGGTCGAAGTCTTCGCGGAT > NC_021214/141103‑141579 | tACCTGGTGCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGAc > 1:712146/1‑240 (MQ=255) tGGTGCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGACAaag > 1:1103852/1‑240 (MQ=255) tGGTGCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGACAaag > 1:682177/1‑240 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGACGTGTGGACAAAGAAGc > 2:1337447/1‑240 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGACAAAGAAGc > 2:253577/1‑240 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAAGCAACAGCAGCAATGTGTCTTTCTCCAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGACAAAGAAGc > 2:854296/1‑240 (MQ=255) gCCTTTGGGAGAAGCAACAGCAGCAATTGGTCTTGCTCAAACGTCAACACCGACGATTTCTTTTGGTTGATGTTCCTGAACTTCAAGAGTCACAGGAACAAGCAAGAAGAAGGTTTTGGATGATTTGTCGTAAGTCAGTATCGGATCGCCGATCTTGCAAGACTTGAGGTACTCAAAGTGTTTGGACCAGCCTTTCATCGGGATCCATTTGATTCGACCTTGAAGTGTGGACAaagaag < 2:1438409/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |