New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_021214 | = 1335343 | 369 (1.070) | 4 (0.010) | 4/410 | 25.1 | 1.2% | intergenic (+50/‑27) | TMARI_RS06690/TMARI_RS06695 | hypothetical protein/Cys‑rich RiPP peptide |
? | NC_021214 | = 1335323 | 342 (1.090) | intergenic (+30/‑47) | TMARI_RS06690/TMARI_RS06695 | hypothetical protein/Cys‑rich RiPP peptide | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
TAATAAGGAAGGGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACCACATACGAAAGGAGGGGATGCTATGCAGAAGATGCCAAAACCAGTTGTTCCTAATGATTATTTGAACCCAGGAAAAGGATGTGGAGGAGCTGGTCTCGTCTGTGGTTGGTGTGGTTAAGGAAAAATAGCAGCCGCTTTTTTCCCTTTCCCCTGGCGAAAGGCCAGGGGAAGGGGTTCATCAAGAGGCTCTATTTCATTTTACCAAGGAGGTTTTAAGAGATGATAACCATTAA > NC_021214/1335105‑1335580 | taataaGGAAGGGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGaa < 1:719776/240‑1 (MQ=255) aggaaggGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACcac < 2:554776/240‑1 (MQ=255) ggaaggGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCTCAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGGTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACcaca > 2:1291214/1‑240 (MQ=255) ggaaggGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGCAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGACCACCGGTGTTCGGAAACcaca > 2:249805/1‑240 (MQ=255) ggaaggGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACcaca > 1:221315/1‑240 (MQ=255) ggaaggGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACcaca > 1:358049/1‑240 (MQ=255) ggaaggGGGGTGAAAATCGTGAGAAGGATCATTCTCACAATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACcaca > 1:1441883/1‑240 (MQ=255) 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cacaATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACCACATACGAAAGGAGGGGATGCTATGCAGAAGATGCCaa > 1:612634/1‑240 (MQ=255) cacaATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACCACATACGAAAGGAGGGGATGCTATGCAGAAGATGCCaa > 1:1430199/1‑240 (MQ=255) cacaATAGTTATTCTGCTTTCTCTCTTATACACGCTTGTGTTTCCCAGTCCTTCTGATGATTATCAAACGACAGTGAGGAAAAAAACTGTTGTTCACACCTTCCTGATAGAGAAGTTGCATTCGGAAGATTTAACTGTTGGAAATTAGGGTTTCTTTTGTTTATTAAGTAATTCTGAATCCGAACACCGGTGTTCGGAAACCACATACGAAAGGAGGGGATGCTATGCAGAAGATGCCaa > 2:1077745/1‑240 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |