| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_021214 | 1,815,540 | Δ28 bp | intergenic (‑23/‑201) | TMARI_RS09405 ← / → TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | = 1815539 | 1 (0.000) | 3050 (8.900) | 321/446 | 0.0 | 100.0% | intergenic (‑22/‑229) | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase |
| ? | NC_021214 | 1815568 = | 1 (0.000) | intergenic (‑51/‑200) | TMARI_RS09405/TMARI_RS09410 | maltose/maltodextrin ABC transporter substrate‑binding protein MalE/alpha‑amylase | |||||
Only 100 of 3193 total aligned reads displayed.
CCCTGTCCCTGTGGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAAGAGTTTACCGTCAGAAAATTCACAAAATGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGT > NC_021214/1815300‑1815775 | ctttccttttccgcgtttgtgtcaaaagcgacaGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGattacaatgttt > 2:423855‑M1/34‑235 (MQ=255) ttttccgcgtttgtgtcaaaagcgacaGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCctttagattacaatgtttcactaa > 1:349533‑M1/28‑229 (MQ=255) ttttccgcgtttgtgtcaaaagcgacaGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCctttagattacaatgtttcactaa > 1:1189453‑M1/28‑229 (MQ=255) tttccgcgtttgtgtcaaaagcgacaGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTcctttagattacaatgtttcactaag < 2:574403‑M1/214‑13 (MQ=255) cTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaa > 2:767092‑M1/1‑198 (MQ=255) cGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaat < 1:1263188‑M1/240‑56 (MQ=255) tACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaat < 2:13181‑M1/211‑29 (MQ=255) aCTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcgg < 1:917976‑M1/240‑59 (MQ=255) tCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgttttta > 1:996489‑M1/1‑174 (MQ=255) aGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaatt > 1:1215307‑M1/1‑169 (MQ=255) aGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgt < 1:560147‑M1/203‑35 (MQ=255) gATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattac < 2:664128‑M1/238‑73 (MQ=255) gATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatc < 1:100222‑M1/222‑57 (MQ=255) ttCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactca < 2:693332‑M1/239‑76 (MQ=255) tCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatc > 1:1243940‑M1/1‑163 (MQ=255) gTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaac < 1:531546‑M1/240‑81 (MQ=255) gTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatca > 2:848334‑M1/1‑160 (MQ=255) cTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatct < 1:1165251‑M1/202‑46 (MQ=255) tttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 2:341419‑M1/1‑156 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 2:982918‑M1/1‑155 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 1:227608‑M1/1‑155 (MQ=255) ttGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtt > 2:1417430‑M1/1‑155 (MQ=255) ttGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattc < 1:844228‑M1/240‑91 (MQ=255) gAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcag > 1:1031577‑M1/1‑148 (MQ=255) cttcCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaatt < 2:718373‑M1/213‑71 (MQ=255) tcCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatc < 2:874065‑M1/240‑100 (MQ=255) ccGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaa > 1:588611‑M1/1‑138 (MQ=255) tttCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattcc > 2:1198278‑M1/1‑133 (MQ=255) ggagtaTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTTCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaa < 2:1085050‑M1/240‑113 (MQ=255) ggaggaTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaa < 1:609787‑M1/240‑113 (MQ=255) aTGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggactcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaaccta > 2:202156‑M1/1‑123 (MQ=255) tGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaa > 1:933433‑M1/1‑122 (MQ=255) aCCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca < 1:1481115‑M1/240‑124 (MQ=255) aCCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca < 1:66855‑M1/240‑124 (MQ=255) cGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaat < 1:510928‑M1/240‑134 (MQ=255) ggAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaatt < 2:958293‑M1/240‑135 (MQ=255) aaCACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattg < 2:183154‑M1/239‑136 (MQ=255) acacCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattggg > 1:388168‑M1/1‑103 (MQ=255) acacCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgg < 1:316282‑M1/239‑137 (MQ=255) ccAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgt < 2:227608‑M1/240‑141 (MQ=255) ccAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgt < 1:781520‑M1/240‑141 (MQ=255) tGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca > 2:517672‑M1/1‑95 (MQ=255) tGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataa > 1:1083627‑M1/1‑92 (MQ=255) gAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaa > 2:367742‑M1/1‑91 (MQ=255) gAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaa < 1:413489‑M1/240‑150 (MQ=255) tttgtttgTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaat < 2:1365179‑M1/231‑145 (MQ=255) tgATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttg > 2:495347‑M1/1‑79 (MQ=255) tgATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttg > 2:134570‑M1/1‑79 (MQ=255) tgATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttg > 1:864627‑M1/1‑79 (MQ=255) tAACACCAGAGCAGAAACCCCAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 2:745302‑M1/240‑165 (MQ=255) tAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 2:1022998‑M1/240‑165 (MQ=255) tAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 1:459159‑M1/240‑165 (MQ=255) acacCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgtta > 1:43657‑M1/1‑74 (MQ=255) acacCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgtta > 1:762870‑M1/1‑74 (MQ=255) cAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaattt > 2:451162‑M1/1‑70 (MQ=255) gagCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacg < 1:13218‑M1/223‑156 (MQ=255) aGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattg < 2:1148034‑M1/238‑175 (MQ=255) aGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattg < 2:792123‑M1/238‑175 (MQ=255) gAAACCACAATAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaactatcgcaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggctttttgttcacttattgatc > 2:1255465‑M1/1‑63 (MQ=255) gAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatc > 2:1053699‑M1/1‑63 (MQ=255) gAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca < 2:62525‑M1/186‑124 (MQ=255) aaCCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgt > 2:402819‑M1/1‑61 (MQ=255) acaaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgt < 1:633241‑M1/240‑187 (MQ=255) caaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaatt > 1:1107619‑M1/1‑53 (MQ=255) caaGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaac < 2:1472767‑M1/133‑81 (MQ=255) tAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatg < 1:16664‑M1/171‑126 (MQ=255) aaCGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatga < 1:195665‑M1/240‑198 (MQ=255) gAGCAGTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga < 1:893815‑M1/240‑201 (MQ=255) gAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga > 1:258275‑M1/1‑40 (MQ=255) gAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga < 1:1450166‑M1/240‑201 (MQ=255) gAGCAGTCTCTTCACCAAGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga < 2:822428‑M1/240‑201 (MQ=255) gAGCAGTCTCCTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaaccccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga < 1:1288739‑M1/240‑201 (MQ=255) aGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggag > 1:824853‑M1/1‑39 (MQ=255) gTCTCTTCACCATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggattgtttcgaaaatgtggagtgaa > 1:1374506‑M1/1‑35 (MQ=255) gTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaa > 1:1138724‑M1/1‑35 (MQ=255) ttCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttg < 2:540061‑M1/240‑211 (MQ=255) cATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaag > 2:162336‑M1/1‑25 (MQ=255) cATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgagga > 2:31308‑M1/1‑25 (MQ=255) cATGGACACTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacg > 1:481950‑M1/1‑25 (MQ=255) cacTTCCTTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcga > 1:727993‑M1/1‑19 (MQ=255) cctcctTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggatggaaggttggtaagaagcctgt > 2:908631‑M1/1‑17 (MQ=255) cctcctTTAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgt < 2:1390931‑M1/181‑165 (MQ=255) tttAGTTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaactgacgtatttgtgttaatttattgttcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgcaggttgtgacgaagcatttttt > 1:963166‑M1/1‑12 (MQ=255) tttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagcctttttt > 1:1430841‑M1/1‑12 (MQ=255) tttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagcctttttt > 2:1235982‑M1/1‑12 (MQ=255) ttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagcctttttt > 2:470250‑M1/1‑11 (MQ=255) ttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagcctttttt > 1:140373‑M1/1‑11 (MQ=255) ttAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggt > 1:694792‑M1/1‑11 (MQ=255) tAGATTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttact > 1:807770‑M1/1‑10 (MQ=255) aTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgcaggttgtgatgaagccttttttactgctt > 2:1118779‑M1/1‑7 (MQ=255) aTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgctt > 2:1441377‑M1/1‑7 (MQ=255) aTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgctt > 2:258058‑M1/1‑7 (MQ=255) aTTACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgaca > 2:933999‑M1/1‑7 (MQ=255) ttACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgctt < 2:1286466‑M1/239‑234 (MQ=255) ttACAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgct < 2:1169642‑M1/238‑233 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttattgcttgct > 2:289056‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgcttgct < 1:105551‑M1/240‑237 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgcttgct > 1:283062‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggttgtgaagaagccttttttactgcttgct > 1:1348487‑M1/1‑4 (MQ=255) aCAAtgtttcactaaggattttaacaccgaattttcgtgatgtcaatctggattcgaatcggtgtttttaaattactcatcaactgtttcattcagaaatatcgaaattccgttaaccctatcgacatgttatgaattgggtgttaatataaacagacggatttgtgttaatttattgatcgtggaatgtttcgaaaatgaggagtgaaggtggtgaagaagccttttttactgcttgct > 2:597349‑M1/1‑4 (MQ=255) | CCCTGTCCCTGTGGAGCCGCCGTCAGGAATTTGGATTTGATGCTTCCAAAATCGACGTACTGAACTTCAACAGGGATTCCGTACTTTGCCTTGAATTCTTCCCCGAGTTTCTGGAGGATGTCAACCTGCTTTTCGGAACACCAGATGGTGAGCTTTGTTTGTGATAACACCAGAGCAGAAACCACAACAAGCATTAAAACGAGCAGTCTCTTCACCATGGACACCTCCTTTAGATTACAAAGAGTTTACCGTCAGAAAATTCACAAAATGTTTCACTAAGGATTTTAACACCGAATTTTCGTGATGTCAATCTGGATTCGAATCGGTGTTTTTAAATTACTCATCAACTGTTTCATTCAGAAATATCGAAATTCCGTTAACCCTATCGACATGTTATGAATTGGGTGTTAATATAAACAGACGGATTTGTGTTAATTTATTGATCGTGGAATGTTTCGAAAATGAGGAGTGAAGGT > NC_021214/1815300‑1815775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |