| New junction evidence | |||||||||||
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| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3709 total aligned reads displayed.
TCCCCAGGTTCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTCTGTGTAAGAGACGAGGTCGGCTCGTCCAGTATCAACACCTTCGCCTTCTTGTAGACAGCTCTTGCTATCTCCACCATCTGCTGAATCGCTATGGAGTATTTCCCCAACTTCTCCTCAGGATCTATCTCTATGCCAAATTCCTCCTTCATGAACTTCTCCGCTTCCCTGTACATCTTCTTGTAATCTATAAAGATCCCTCTCTTCTCTTCGTCCCCCATGAATATGTTCTCCGCAACC > NC_021214/1828920‑1829399 | ccccAGTTTCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCCCCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCtt < 1:694161/240‑1 (MQ=255) ccAGGTTCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTc < 1:450273/240‑1 (MQ=255) ggTTCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTc < 1:591246/237‑1 (MQ=255) ttCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTCtgt < 2:687428/238‑1 (MQ=255) ttCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTCtg < 1:152859/237‑1 (MQ=255) ttCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTGCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTCtg < 2:191127/237‑1 (MQ=255) cATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTCTGTGTaa < 2:245262/240‑1 (MQ=255) 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aaaGAGTTTTTCCGTCTCTTTCTGTGTAAGAGACGAGGTCGGCTCGTCCAGTATCAACACCTTCGCCTTCTTGTAGACAGCTCTTGCTATCTCCACCATCTGCTGAATCGCTATGGAGTATTTCCCCAACTTCTCCTCAGGATCTATCTCTATGCCAAATTCCTCCTTCATGAACTTCTCCGCTTCCCTGTACATCTTCTTGTAATCTATAAAGATCCCTCTCTTCTCTTCGTCCCCCAt < 1:100028/240‑1 (MQ=255) gTCTCTTTCTGTGTAAGAGACGAGGTCGGCTCGTCCAGTATCAACACCTTCGCCTTCTTGTAGACAGCTCTTGCTATCTCCACCATCTGCTGAATCGCTATGGAGTATTTCCCCAACTTCTCCTCAGGATCTATCTCTATGCCAAATTCCTCCTTCATGAACTTCTCCGCTTCCCTGTACATCTTCTTGTAATCTATAAAGATCCCTCTCTTCTCTTCGTCCCCCATGAATATGTtctc > 1:833773/1‑239 (MQ=255) | TCCCCAGGTTCATGCGCTTCTTTTATGTAAAACTTCTCTAATTTCCTTCCCACCATCATCTCCACGATCTTTTCTTTCGTCAGGTTCTCTATGCTATCTGTTCCTATGTACTCCCCATCTCTCAGCACGCTCACCTTGTCACAGATCTCGAAGATCTCTTCCAGCCTGTGCGATATGAAGATTATTGCCACACCTTTCTCCTTGAGACTCTTCACAACCTCAAAGAGTTTTTCCGTCTCTTTCTGTGTAAGAGACGAGGTCGGCTCGTCCAGTATCAACACCTTCGCCTTCTTGTAGACAGCTCTTGCTATCTCCACCATCTGCTGAATCGCTATGGAGTATTTCCCCAACTTCTCCTCAGGATCTATCTCTATGCCAAATTCCTCCTTCATGAACTTCTCCGCTTCCCTGTACATCTTCTTGTAATCTATAAAGATCCCTCTCTTCTCTTCGTCCCCCATGAATATGTTCTCCGCAACC > NC_021214/1828920‑1829399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |