Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_021214 | 621,104 | C→T | D331N (GAT→AAT) | TMARI_RS03010 ← | manganese‑dependent inorganic pyrophosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_021214 | 621,104 | 0 | C | T | 98.8% | 868.1 / ‑0.9 | 245 | D331N (GAT→AAT) | TMARI_RS03010 | manganese‑dependent inorganic pyrophosphatase |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 |
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
AGAAGAGTGTATCGGAAACGATACCCGAGAGCAGAATTCCGGCTATCTCCCTTTCCATCTTCACACCGTTTTTCAAGAAGAACTCTGCCACTATTGTTGAGGTGCTTCCGACGGGTTCGTTGTAGAAGAAAACGGGATTCAGAGTGCTCAGTCCACCGAGCCTGTGATGGTCTATGATCTCGAGGATTTCCGCTTTCTCGACTCCTTCCGGTGCCTGGGTGATCTCGTTGTGATCCACAAGGATCACCTTTTTCCTCACATCTTTGAGCAGGTCCGTCCTAGTTATAACACCACAAAGCCGCCCTTTCTCGTCTTCTACGAACGCTGCTCTTATCTTCGAGGTGAAGACGATCTCTTTTACTTCCTCGAGTGTGTCCTTCTTCGTCACCGTGGGGAATTTCTTGCTCATCACGAGGGTCACGGGGAGTGAAAGGTTTATGAGCTTTGCGGCGCTGAACGCGTCGAACTTCA > NC_021214/620870‑621340 | agaagaGTGTATCGGAAACGATGCCCGAGAGCAGAATTCCGGCTATCTCCCTTTCCATCTTCACACCGTTTTTCAAGAAGAACTCTGCCACTATTGTTGAGGTGCTTCCGACGGGTTCGTTGTAGAAGAAAACGGGATTCAGAGTGCTCAGTCCACCGAGCCTGTGATGGTCTATGATCTCGAGGATTTCCGCTTTCTCGACTCCTTCCGGTGCCTGGGTGATCTCGTTGTGATTcaca < 1:1376760/239‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |