| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_021214 | 1,110 | +CTCCACAATGAAAAGAATAGATGGTAAGGTGTGCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAAC | intergenic (+1035/+2045) | TMARI_RS09660 → / ← TMARI_RS00005 | hypothetical protein/IGHMBP2 family helicase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_021214 | 1081 = | 52 (0.160) | 248 (0.910) +AAGCACACCTTACCATCTATTCTTTTCATTGTGGAG |
114/386 | 0.5 | 85.7% | noncoding (670/2694 nt) | CRISPR | repeat region |
| ? | NC_021214 | = 1110 | 46 (0.140) | noncoding (699/2694 nt) | CRISPR | repeat region | |||||
Only 100 of 621 total aligned reads displayed.
GTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATCACAAGCCCGTTTCCGTT > NC_021214/873‑1347 | aactggaaaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAAc < 1:1307302‑M1/30‑1 (MQ=255) accctGAGTTTCAATCCTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGGTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctc > 1:399344‑M2/2‑236 (MQ=255) aagtttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATc > 1:592416‑M1/201‑239 (MQ=255) ttCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGATTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTTAATGTTATAGTAATAGCAGAGATGGTGATGTTGTGTTCAAAACTTCCTTAGAGGTAGGGAAATccccacactgat < 2:973409‑M2/239‑13 (MQ=255) ttcaatacttccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGa > 1:481221‑M1/197‑238 (MQ=255) caatactgccttaaaggtaaggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGatat > 1:100158‑M1/195‑239 (MQ=255) aaTACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTTCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaag < 2:610311‑M2/239‑16 (MQ=255) aCTTTCTTAGAGTCATAGAAACTCTTTTTACCTTTTCTCAGACATCGTCAACTAGAAAAGTTTCAATACTTCCTGAGATGGTTGGAAACTCGATTATTGCTTTGACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATGCTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGAGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaat > 2:412196‑M2/1‑221 (MQ=255) aCTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaat > 1:379172‑M2/1‑221 (MQ=255) ccttagaggtatggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTAAA‑ACCTCCTTAAACGGAAGGAAAATCTCCAAAtcgatataaaaaattt < 2:388678‑M1/53‑8 (MQ=255) agagGTATGGAAACAAGTTTTGCCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTGTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGGGGTGATGTTAGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggta > 1:298755‑M2/1‑213 (MQ=255) gTATGGAAACAAGTTTTACCCTTTCTCAGCGAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTATACAACGACATGCGATCATACAAGTTCCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAGAGGAGCAGATGTGAGTTGCAATAAATCCATAGAGGTATGGAAACatccacaatgaaaagactagatggtaagag < 2:194300‑M2/239‑31 (MQ=255) gtatggaaactcgattattgcttttacaaagacatgcggtcattcaagttacaatactgtcttagaggtttgaaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCtta > 2:1377043‑M1/179‑238 (MQ=255) tGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGCCATGCGCTCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGCAGAAATCGCAAAGGTGTTGACGTTAGTTTCATTAATTACTTAGAGGTATGGAAACccctcaatggaaaagaatgtatggcaaggtgtg < 2:710083‑M2/239‑34 (MQ=255) tGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgt < 1:761242‑M2/238‑33 (MQ=255) tGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGCTGCTAGTTTAAATACTTCATTCGAGGTATGGAAACctcaaca < 2:808312‑M2/213‑8 (MQ=255) tggaaactcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTtattat < 1:1387122‑M1/64‑1 (MQ=255) gtaaactggattattacttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttcctgagaggtatggaaactatacgttgtagaaatggcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagagttatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATtata > 2:878538‑M1/175‑239 (MQ=255) tcgattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatgttaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTc < 1:1269324‑M1/71‑1 (MQ=255) gattattttttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgattttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCaa > 2:45907‑M1/167‑239 (MQ=255) gattatttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCaa > 1:1103402‑M1/167‑239 (MQ=255) tttAACTTTTATCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTATCAAAGACATGCGATCATAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGTAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgcttcaa > 2:167024‑M2/1‑195 (MQ=255) tACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatac > 1:349960‑M2/1‑193 (MQ=255) tttcttttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGAATGGAAACTCGCGAATCAGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACt < 1:1291338‑M1/77‑1 (MQ=255) tttacaaagacatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATAttt > 1:906058‑M1/157‑211 (MQ=255) ctcAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttag > 1:362519‑M2/1‑185 (MQ=255) aCAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaa > 2:476116‑M2/1‑180 (MQ=255) acatgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggcggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATgg < 1:1070126‑M1/92‑1 (MQ=255) catgctatcatacaagttaaaattcttctttagtggtatggaaactattcgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaattcttccttagaggtatggaaacctcctcaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATg > 2:1152965‑M1/147‑237 (MQ=255) catgcgatcatacaagtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATg > 1:577701‑M1/147‑237 (MQ=255) aaCTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggta > 1:1177004‑M2/1‑172 (MQ=255) aaaGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaa > 1:1081428‑M2/1‑165 (MQ=255) agtttcaatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGt < 1:244762‑M1/107‑1 (MQ=255) aatacttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCATTATTATATGTTTCAATAATTCCTTAGAGGTATGGAAACCAGCATCACGTAGGTAt < 1:454838‑M1/113‑1 (MQ=255) tACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataat > 1:1258829‑M2/1‑155 (MQ=255) aCTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatc > 1:463219‑M2/1‑154 (MQ=255) ttccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTAttgctt > 2:677015‑M1/122‑239 (MQ=255) ccttagaggtatggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTAttgcttg < 1:677764‑M1/119‑1 (MQ=255) tAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttc > 1:1140237‑M2/1‑147 (MQ=255) tggaaactatacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATTGAAACCCACACCTCGTAGGCATTacttgcctgcgcttc < 2:1081783‑M1/129‑8 (MQ=255) ggAAACTCTATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattata > 2:49469‑M2/1‑138 (MQ=255) cTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCTATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgttt > 1:803477‑M2/1‑133 (MQ=255) atacgttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCa < 1:1094673‑M1/139‑1 (MQ=255) tattTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatac > 1:499566‑M2/1‑127 (MQ=255) tattCCTTTTACAAAGACAGTAGTATATACAATTTTAAATACTTCCTTAGAAGTATTGAAACTATTCGTTGTAGAAAACGCAAATGTGGTGATGTTAGTTTCAATTCTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatac > 2:941476‑M2/1‑127 (MQ=255) gttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 1:1038785‑M1/97‑239 (MQ=255) gttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 1:39175‑M1/97‑239 (MQ=255) gttgtagaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaaaagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATATCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 1:984811‑M1/97‑239 (MQ=255) gttgtagaaatcgaaaagttggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaaccgccacaatgaaaataatagatggtaaggtgtgcttTTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATAc > 2:394097‑M1/97‑239 (MQ=255) agaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCg < 1:330438‑M1/99‑1 (MQ=255) agaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCg > 2:330438‑M1/92‑190 (MQ=255) agaaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCATTACTTCCt < 1:1350245‑M1/148‑1 (MQ=255) tttACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGATGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttcctta > 1:629454‑M2/1‑120 (MQ=255) tttACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatgttaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatattt < 2:906058‑M2/211‑92 (MQ=255) tttACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttcctta < 1:522397‑M2/239‑120 (MQ=255) aaatcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTa > 1:884726‑M1/90‑239 (MQ=255) atcgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTaga > 1:1122602‑M1/88‑239 (MQ=255) cgcaaaggtggtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATCTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAgg < 1:115847‑M1/154‑1 (MQ=255) aaaGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggagtgcttgtttcaatacttccttagcggtatggaaactctcgaatccgaaataattctattcacttaatatctttttcaatacttccttaaggga < 2:774503‑M2/239‑125 (MQ=255) gtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatgttaaggtgtacttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACACGCATCTCGAAGGTATTGATTGCATTCTGTTACCTTGTTTCACTACTTCCTTACAGGTATggaaatt < 2:304860‑M1/164‑3 (MQ=255) gtgatgttagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGaaact < 2:356141‑M1/164‑1 (MQ=255) tCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgc > 1:610311‑M2/1‑103 (MQ=255) cATACAAGTTTAAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgca > 1:122814‑M2/1‑102 (MQ=255) tagtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTg < 1:154960‑M1/171‑1 (MQ=255) agtttcaatacttccttagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGt < 1:424986‑M1/172‑1 (MQ=255) aGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgt > 1:178450‑M2/1‑96 (MQ=255) ccTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatac < 1:231814‑M2/129‑47 (MQ=255) tagaggtatggaaacctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATTATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACACGCATCTAGTAGCTATTGATTGCATTCTCTTCCCTTTTTTAAATACTTCCTTAGAGGTAGGTAAACTAAATTTGACAatcattttaaaa < 2:1199281‑M1/186‑5 (MQ=255) gTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggggtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatatattcatatttcctgattatatgtttcaatacttccttagaggtatgtaaaacagcatctcgtaggtattgcttgccttctgt < 2:1022155‑M2/238‑164 (MQ=255) aTGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttcttttc < 2:205318‑M2/238‑166 (MQ=255) acctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTAGAATCCGATATAATCATATTTCCATATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGATCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGCATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTCTTGAAGACTtagaacaacatt < 2:817291‑M1/201‑4 (MQ=255) tccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCa < 2:1112088‑M1/204‑1 (MQ=255) tttgTATAAATCGCAAAGGTTGTGATTTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagattgtaaggtttgcttttttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatac > 2:1029484‑M2/2‑60 (MQ=255) gTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatac > 1:270869‑M2/1‑60 (MQ=255) tGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttcctta > 2:1300115‑M2/1‑58 (MQ=255) aaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCt < 1:1207966‑M1/213‑1 (MQ=255) aaaagaatagatggtaaggtgtgcttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCt < 1:550587‑M1/213‑1 (MQ=255) aaaTTGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttcctta < 1:786919‑M2/239‑187 (MQ=255) aaaGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTATAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggt < 2:557553‑M2/76‑31 (MQ=255) aaaGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgaatctcgtaggtattgcttgacttctgttcccttgtttcaatcattccttagaggtat < 2:1171488‑M2/239‑194 (MQ=255) gtgATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatctaatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaactggcatatcgaatcgttttcttacattctgttaccttgtttcaatacttccttagaggtatgaaatca < 2:75547‑M2/239‑201 (MQ=255) gATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaa > 1:710083‑M2/1‑37 (MQ=255) cttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCg < 1:652584‑M1/99‑1 (MQ=255) cttGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGcc < 2:525794‑M1/236‑1 (MQ=255) tAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagagggatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaaccagaatctcgtagcttttgcttgccttcttttctcttgtttcaatacttccttagctgtatggaaactaaactag < 2:734347‑M2/239‑208 (MQ=255) tAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatac < 2:1044675‑M2/78‑47 (MQ=255) aGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaa < 1:1135665‑M2/95‑65 (MQ=255) tttCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAAAAAAGTTTAAATAATTCCTTAGAGGAATGGAAACGAAAAGccagaa > 2:1250031/1‑235 (MQ=255) aaTACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACg < 1:205318/239‑1 (MQ=255) tACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCt < 2:233037/239‑1 (MQ=255) tCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaaatccttttga > 1:307723‑M2/1‑19 (MQ=255) tCCTTAGAGGTATGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttcct > 2:915531‑M2/1‑19 (MQ=255) ccTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCtcatc > 1:995641/1‑238 (MQ=255) ccTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCtcatc > 1:727860/1‑238 (MQ=255) cTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATcac < 1:836435/239‑1 (MQ=255) tGGAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatac < 2:830359‑M2/186‑180 (MQ=255) tGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTATAGGTATGGAAACGGAACGCCCGCAAACTCCAATGCCAACCccgtt > 2:318076/1‑238 (MQ=255) ggAAACctccacaatgaaaagaatagatggtaagttgtgattgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaaatccttttgaagacttagaacaa > 2:286465‑M2/1‑6 (MQ=255) aaCTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATCACAAGCccgtttccgt < 1:96849/239‑1 (MQ=255) aCctccacaatgaaaagaatagatggtaaggtgtgcttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactctcgaatccgatataatcatatttccttattatatgtttcaatacttccttagaggtatggaaacccgcatctcgtaggtattgcttgccttctgttcccttgtttcaatacttccttagaggtatggaaactaaacttgtaaatccttttgaagacttagaacaacgtt < 1:441169‑M2/239‑238 (MQ=255) | GTTCCCTGAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACAAGTTTTACCTTTTCTCAGACAACTTCAACTGGAAAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCGATTATTTCTTTTACAAAGACATGCGATCATACAAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTATACGTTGTAGAAATCGCAAAGGTGGTGATGTTAGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTCTCGAATCCGATATAATCATATTTCCTTATTATATGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACCCGCATCTCGTAGGTATTGCTTGCCTTCTGTTCCCTTGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACTAAACTTGTAAATCCTTTTGAAGACTTAGAACAACGTTTCAATACTTCCTTAGAGGTATGGAAACGAAACGCCCGCAAACGCTCATCACAAGCCCGTTTCCGTT > NC_021214/873‑1347 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |