| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 228930 = | 99 (0.950) | 10 (0.100) +GCGCTATACAT |
8/258 | 2.9 | 10.2% | noncoding (3/77 nt) | aspU | tRNA‑Asp |
| ? | NC_000913 | = 781147 | 92 (0.880) | noncoding (1/76 nt) | lysY | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGG > NC_000913/781012‑781287 | caccacTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCg > 1:172915/1‑141 (MQ=255) cTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGc > 2:1559610/1‑141 (MQ=255) cTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGc > 2:1559916/1‑141 (MQ=255) cTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGc > 2:1560047/1‑141 (MQ=255) tGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAg < 2:1496116/141‑1 (MQ=255) ccggcggGATCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGTACGTCCCTTACACGGAGGGGGTAGGCGTTTCTATCCCGTCAACACCCAACAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGtt < 1:310675/140‑1 (MQ=17) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:1850321/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:732329/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:1850253/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:1704104/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:1704071/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:1874146/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:157728/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:116399/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:502208/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:514990/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:989395/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:951110/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:479640/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:822251/1‑141 (MQ=255) cGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 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agtagtTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACt > 1:547652/1‑141 (MQ=255) agtagtTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 2:714546/1‑141 (MQ=255) agtagtTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 1:1335602/1‑141 (MQ=255) ttGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATc < 2:740089/141‑1 (MQ=37) tGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATc < 1:1302031/141‑1 (MQ=25) agtaTCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAtt > 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gggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAg > 1:1442421/1‑141 (MQ=255) gggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAg > 1:1442393/1‑141 (MQ=255) gggtTCGGGGGTTCGTTCCCTTCTTCA‑CCACCCC‑CCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCg < 2:940435/141‑1 (MQ=11) ggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGt < 1:714546/141‑1 (MQ=255) ggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGt > 1:266878/1‑141 (MQ=255) gTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGatgtatagcgcagcggtagttcagtcggttagaataccggcctgtcacgccgggggtcgcgggttcgagtcccgtccgttccgccacttattaagaagcctcgagt < 1:1759768‑M2/141‑107 (MQ=255) gTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTg > 2:1759591/1‑141 (MQ=255) gTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTg > 2:1759578/1‑141 (MQ=255) gTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTg > 1:712311/1‑141 (MQ=255) gTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCAAGCACGACCCACCAGAATTAACATCAAACACAGATGTTAAGCGTg > 1:1206115/1‑141 (MQ=11) tCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGa < 1:1559610/141‑1 (MQ=255) 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1:126955/5‑141 (MQ=11) caagcGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCg < 1:620798/137‑1 (MQ=255) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACGTCAAAAACAGATGTTAATCGTGAAGGATAACGTTTCGCCCGCAACGGCCCGTTggg > 2:1775335/1‑141 (MQ=11) | CACCACTAATGACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGTTTGTAGTATCCAGCGCAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCAAACTCAGATGTTAAGCGTGAAGGATAACGTTGCGCCAGCAACGGCCCGTAGGG > NC_000913/781012‑781287 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |