| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.60e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
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gTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCGATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTcc < 1:1034149/141‑1 (MQ=255) gTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTcc < 1:1034025/141‑1 (MQ=255) gTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTcc < 2:1405217/141‑1 (MQ=255) tttCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGa < 2:2520993/141‑1 (MQ=255) gcgAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGtt > 2:966912/1‑141 (MQ=255) cgAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTa < 2:2664931/141‑1 (MQ=255) cgAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTa < 2:2667668/141‑1 (MQ=255) tAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAAAAATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATAGc > 1:1260455/1‑141 (MQ=255) | ATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGA‑CGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGC > NC_000913/361190‑361457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |