| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 624,598 | 0 | A | T | 34.4% | 92.3 / 14.5 | 65 | intergenic (‑88/‑287) | fepB/entC | ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein/isochorismate synthase EntC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (22/20); new base T (0/22); total (22/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.16e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCAAAAGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTTCTCATT > NC_000913/624459‑624737 | gCAAAAGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGagag < 2:2101751/141‑1 (MQ=255) aaaaGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAggg < 2:1508141/141‑1 (MQ=255) aaaGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGt > 2:2270057/1‑141 (MQ=255) cTGTTAATCGAAGGGCGTTGCGGTCGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGt > 2:2349583/1‑141 (MQ=255) tAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGa > 2:1213373/1‑141 (MQ=255) cgCGGGGCGATTCACAAAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGAAAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGTAGAGGGTTTGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGa < 2:2252286/140‑1 (MQ=255) agCGGGGCTAGTCACACAAATCAGATTCCTGTTATTAATATGTTTAAGGGCGTAATGACAAATACCACAAAGCGCAAAAGCCGGCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGTGTTTTTGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGa < 2:259722/141‑1 (MQ=255) agCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGa < 2:599486/141‑1 (MQ=255) agCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGa < 2:599391/141‑1 (MQ=255) agCGGGGCGAGTCTAACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTATGGGCGTAATGAAAAATTCCACAAAGCGCACAATCCGTCCCCCCGCCCCTTTGGGGAGTGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGa < 2:1147560/141‑1 (MQ=38) gggggCGAGTCTCACAAATCAGCTTCGTGTTATTAATACGGTTAAGGGCGTAATGACAATTTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTGGGGGAGTGGGTTAGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAAc < 2:1810426/140‑1 (MQ=255) cGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAAc < 2:569987/141‑1 (MQ=255) ggggCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACa > 1:1275569/1‑141 (MQ=255) ggCGAGTCTCACAAAACAGCTTCCTTTTATTAATAAGGTTAAGGGCTTAATGACAAATTCGACAAAGCGCAAAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACAtt < 2:1521628/141‑1 (MQ=255) tatcAAAATTCTGCTTCTTTTTTTTAATTAGTTTATGGGCTTATTCAAAATTTCGAAAACGCGCAAAATCGGTCCCCCCGCCCTTTGGGGTTGTGTGTTTGGGTGTGGGCAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCt < 1:2102319/139‑1 (MQ=255) ctcACAAATCAGCTACCTGTTATTAATAAGGTTACGGGCGTAATCACAAATTCGACAAAGCGCCAAATCCGTCCCCACGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTc < 2:144303/141‑1 (MQ=37) cccacaAATCCGCTTCCTGTAATTAATACGGTTAAGGGCGTAATGAAAAATTCGACAACGCGCAAAATCCGTCCCCCCGCCCCTTTGGGTATTGGGTTTGGGTGAGGGCAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTc < 1:93492/139‑1 (MQ=255) caaaaaaaTCTGATTCTTTTTTTTAATATGGTTTGGGGCTTATTTAAAATTTCGAAAAAGCAAAAAATCCGTCCCCTCGCCGTTTGGGGGTTTGGGTTTGGTTGGGGGTAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTc < 1:1756577/136‑1 (MQ=255) atcACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTATGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGTGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTc < 2:1998583/140‑1 (MQ=255) cacaAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCAc > 1:625805/1‑141 (MQ=255) cacaAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCAc > 1:624804/1‑141 (MQ=255) aaaTCAGCTTCCTTTTATTAATATGGTTAAGGGCTTATTCAAAAATTCCAAAACGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGATTGGGTTAGGGTGCGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCAcccc < 1:1672721/141‑1 (MQ=25) aaaTCAGCTTCCTGTTATTATTAAGGTTACGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTGGGGGTGAGGGTTCGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCAcccc < 2:2664549/141‑1 (MQ=255) aaaTCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTATGGGCGTAATTACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCAcccc < 2:2663875/141‑1 (MQ=255) aGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGccc > 1:1094041/1‑141 (MQ=255) aGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGccc > 1:1094047/1‑141 (MQ=255) aGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGccc > 1:1094307/1‑141 (MQ=255) aGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGccc > 1:1743851/1‑141 (MQ=255) ctaccTGTTATTAATATGGTTACGGGCTTAAACACAAATACCACAAAGCGAACAAACCGACCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGTTTAGGGTGAGGGCAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTc < 2:1738044/138‑1 (MQ=21) cTTCCTGTTATTAATAAGTTTAAGGGCGTAATCACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGTGAGGTTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCTAACCCTc < 2:1723876/141‑1 (MQ=37) cTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACACTCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTc < 2:491828/141‑1 (MQ=255) cTTCCTGTAATTAATAAGTTTACGGCCGAAAGGACAAATTCCAAAAACCCCACAAGCCGTCCCCACGCCCCTTGGGGTTTTGGGTTTGGGTGTGGGTAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTc < 1:480576/141‑1 (MQ=255) tCCTTTTATTAATAAGTTTAAGGGCTTAATGAAAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGTAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCAc < 2:1099890/141‑1 (MQ=37) tCCTTTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCAc < 2:430111/141‑1 (MQ=255) attaATTCGTTTATGGGCTTAATCAAAAATCCCAAAAAGCGCACATTCGGTCCCCGCCCCCCTTTGGGTTGTGGTTTTGGGGTGGGGGAACCGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGaa < 1:1089267/141‑1 (MQ=255) attaATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGaa > 2:2703492/1‑141 (MQ=255) attaATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGaa > 2:2500034/1‑141 (MQ=255) attaATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGaa > 2:2703503/1‑141 (MQ=255) ttaATAAGGTTAAGGGCTTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAg < 2:761756/141‑1 (MQ=255) atggTTAAGGGCTTAATTACAAATCCTACAACGCGAACAACCCGACCCCCCGCCCCTTGGGGTTGTGGTTTTGGGTGTGGGCAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCTCCCTGGAAGGgaga < 1:1637591/139‑1 (MQ=19) agtttACGGGCTTAATCAAAAATTCTAAAAAGCGCACAATCGGTCCCCTCGCCCGTTTGGGTTGTGGGTTTGGGTGCGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGagag < 1:1311332/138‑1 (MQ=255) agtttAAGGGCTTAAGTAAAATTTCCAAAAAGCGCACAATCCGCCCCCTCCCCCTTTGGGGGTGTGGTTTTGGGTGAGGGCAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGagag < 1:2270057/138‑1 (MQ=255) aGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGagag > 2:2101760/1‑141 (MQ=255) aGGGTAAGGGCGTAATGACCAATACGACAAAGCGCACAAACCGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGCGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCCCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGagag < 2:824413/141‑1 (MQ=25) ggTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAgg > 2:2702331/1‑141 (MQ=255) gTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACg > 1:1158244/1‑141 (MQ=255) gTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACg > 1:2331595/1‑141 (MQ=255) tGACAAATTCGACAACGCGCACAATCCGTCCCCACCCCCCTTTGGGGAGAGGGTTTGGGTGAGGGTAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGgcgc < 1:1910031/141‑1 (MQ=255) tGAAAATTTCTACAACGCCCACAATCCGTCCCCCCCCCCATTGGGGTCGCGGTTTCGGGTGCGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGgcgc < 1:840813/141‑1 (MQ=255) tGAAAAATTCGACAACGCGCAAAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGTGGTTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGgcgc < 1:1959953/141‑1 (MQ=25) tGAAAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTCGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGgcgc < 1:1959925/141‑1 (MQ=255) aatttCGAAAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGTTGTGGGTTTGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGa < 1:2660403/138‑1 (MQ=25) aaaTTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGa > 2:1565078/1‑141 (MQ=255) ttctaaaaaGCGAACAATCCGTCCCCTCGCCCTTTTGGGTTGTGGTTTTGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACAt < 1:331407/135‑1 (MQ=255) ttCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACCTTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACAt < 2:604233/141‑1 (MQ=255) ttCGACAAAGCGCACAATCCGGCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGTGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACAt < 2:2230115/141‑1 (MQ=255) cAAAGCACACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTGGGGTAGTGGTTTTGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACAt < 1:181616/141‑1 (MQ=255) cAAAGCACACAATCCGTCCCCCCGCCCCTTTGGGGTGAGGTTTTGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACAt < 1:181561/141‑1 (MQ=255) ccccTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATcc > 1:808413/1‑141 (MQ=255) ccccTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATcc > 1:808216/1‑141 (MQ=255) cccTCGCCCCTTTGGGGAGTGGGTTAGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCa < 2:2178350/141‑1 (MQ=255) ccTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCAt > 1:486718/1‑141 (MQ=255) tttGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCGTATGCGAATCCATCAATAATGc > 1:2412926/1‑141 (MQ=255) ggggAGTGGTTTCGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTtc < 1:1403695/141‑1 (MQ=255) ggggAGTGGGTTTGGGTGTGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGATTCCATCAATAATGCTtc < 1:1277681/141‑1 (MQ=255) ggggAGTGGGTTTGGGTGCGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTtc < 1:1403313/141‑1 (MQ=255) gagGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGACCGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAAAAATGCTTCTCAtt > 1:451862/1‑141 (MQ=255) gagGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTTCTCAtt > 1:867578/1‑141 (MQ=255) gagGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTTCTCAtt > 2:30868/1‑141 (MQ=255) gagGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTTCTCAtt > 1:1917611/1‑141 (MQ=255) gagGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTTCTCAtt > 2:1959689/1‑141 (MQ=255) | GCAAAAGTCCTGTTAATAGAAGGGCGTTGCGGTAGAGCGGGGCGAGTCTCACAAATCAGCTTCCTGTTATTAATAAGGTTAAGGGCGTAATGACAAATTCGACAAAGCGCACAATCCGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGTGAGGGGAACAGCCAGCACTGGTGCGAACATTAACCCTCACCCCAGCCCTCACCCTGGAAGGGAGAGGGGGCAGAACGGCGCAGGACATCACATTGCGCTTATGCGAATCCATCAATAATGCTTCTCATT > NC_000913/624459‑624737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |