| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 374922 = | 174 (1.460) | 9 (0.100) | 6/206 | 3.3 | 6.3% | intergenic (+41/‑537) | mhpE/mhpT | 4‑hydroxy‑2‑oxovalerate aldolase/3‑hydroxyphenylpropionate/3‑ hydroxycinnamate:H(+) symporter |
| ? | NC_000913 | 377430 = | 139 (1.590) | intergenic (+119/+105) | yaiL/frmB | DUF2058 domain‑containing protein YaiL/S‑formylglutathione hydrolase FrmB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTGGCGTGGTAGGCAAT > NC_000913/377290‑377570 | gCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTgcg > 2:1899642/1‑141 (MQ=255) aTGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGc < 1:1855821/141‑1 (MQ=255) tgtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCg < 1:790876/141‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 2:716972/141‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 2:716818/141‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 2:191556/141‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 1:1747838/141‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 2:1326316/141‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGa < 1:1632318/141‑1 (MQ=255) tgGTAAACATAGCTCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGAc < 2:1586364/141‑1 (MQ=255) tgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGa < 1:2130808/141‑1 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAc < 1:1873345/141‑1 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACg > 1:1541991/1‑141 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGc > 2:1841896/1‑141 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTgc < 2:38042/141‑1 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTgc < 2:70665/141‑1 (MQ=255) tAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTgcgc > 1:646868/1‑141 (MQ=255) tAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTgcgc > 2:1055980/1‑141 (MQ=255) aGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg < 2:828107/141‑1 (MQ=255) aGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg < 2:520712/141‑1 (MQ=255) gATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 2:1158370/141‑1 (MQ=255) gATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGt < 2:677966/141‑1 (MQ=255) acaGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTCGGCGCGCTGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGcgcg < 2:1121773/139‑1 (MQ=21) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGC‑TAACGCGTCTTAt > 1:312704/1‑141 (MQ=17) 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tGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:466230/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:86510/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 1:706323/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTAc < 2:1660962/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 2:2061145/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 2:1071237/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 2:722776/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 2:1860314/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCTA‑ACGC‑‑‑GTCTGATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 2:1306995/141‑1 (MQ=255) tGATGCGACGCT‑GGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 1:1364022/141‑1 (MQ=255) 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gATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 1:1048263/141‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 1:2019084/141‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 1:301595/141‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACg < 1:2094541/141‑1 (MQ=255) gACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGa < 1:916086/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=11) gtAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTGCGGGCGACGTGTTGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTg > 1:1518758/1‑141 (MQ=18) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATc > 2:263264/1‑141 (MQ=255) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATc > 1:1224900/1‑141 (MQ=255) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATc > 1:1453734/1‑141 (MQ=255) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATc > 2:555668/1‑141 (MQ=255) attaGGCGTTCACGCCGCATCCGGCTGTGGTGCGA‑GATGGCTGATGCGAGTCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCa < 1:1269950/138‑1 (MQ=18) aTAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCa < 2:457613/141‑1 (MQ=255) aTAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCa < 1:1809757/141‑1 (MQ=255) tAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCa < 1:77686/141‑1 (MQ=255) tAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCa < 1:2120488/141‑1 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCatat > 2:1239355/1‑141 (MQ=255) 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2:311691/1‑141 (MQ=255) gcATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCGTATAAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATACAAGCATATTCAGTTTa > 1:1677183/1‑141 (MQ=21) aTCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTAtt < 1:1903040/141‑1 (MQ=255) ccGGCAGTCGTGCGC‑CCTGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTgg < 1:383721/141‑1 (MQ=255) ccGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTgg < 1:1639778/141‑1 (MQ=255) cAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTGGCGTg > 1:116727/1‑141 (MQ=255) cAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTGGCGTg < 2:2129646/141‑1 (MQ=255) gcgc‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTGGCGTGGTAGGCa < 2:657566/141‑1 (MQ=255) | GCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGC‑‑‑GTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGC‑CATGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTACGGGCGAAGTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCTATTATCAACGCATATTCAGTTTATTGGCGTGGTAGGCAAT > NC_000913/377290‑377570 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |