New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | AE015451 | 2478409 = | 39 (0.210) | 4 (0.030) | 3/184 | 17.5 | 13.0% | coding (106/444 nt) | PP_2172 | conserved exported protein of unknown function |
? | AE015451 | = 2478405 | 23 (0.160) | coding (102/444 nt) | PP_2172 | conserved exported protein of unknown function | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGT > AE015451/2478290‑2478522 | gAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTGGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtgg < 2:1961297/124‑1 (MQ=255) aGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATTTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggt > 1:1961354/1‑124 (MQ=255) aGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggt > 1:1961321/1‑124 (MQ=255) gCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCACGggtggtggtg > 2:1961353/1‑124 (MQ=255) gAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCTCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGTCAAGggtggtggtgg < 2:1961298/122‑1 (MQ=255) aaCAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtg > 2:1961372/1‑120 (MQ=255) aCAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggt < 2:1961299/124‑1 (MQ=255) aaaaaaTGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtg > 1:1961402/1‑123 (MQ=255) aaaaaTGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtg > 2:1961341/1‑122 (MQ=255) aaaaaTGAAAAAACCTTTGATTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtgg < 2:1961300/123‑1 (MQ=255) aaaTGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtggtgg < 1:1961301/124‑1 (MQ=255) aaaTGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggt > 1:1961397/1‑119 (MQ=255) aaTGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtggtggt > 2:1961345/1‑124 (MQ=255) aTGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtggtggtg > 2:1961329/1‑124 (MQ=255) aaaaCCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtggtggtggtggt > 1:1961338/1‑124 (MQ=255) tGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTggtggcggtg > 1:1961380/1‑123 (MQ=255) ggTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtggtggcggtggcggtgg < 1:1961303/120‑7 (MQ=255) gCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGggtggtggtggtggtggtggtggtgg < 2:1961304/110‑1 (MQ=255) tGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGTCGGCATTCTGGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTggtggcggtggc > 1:1961358/1‑118 (MQ=255) tGTCTTTGCTTGTGCATGGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGcggtggcggtgg < 1:1961305/123‑1 (MQ=255) gtttttGCTTGGGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTggtggcgg < 2:1961306/110‑1 (MQ=255) tCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTggtggcggtggc < 1:1961307/116‑1 (MQ=255) cATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGaaa > 2:1961370/1‑124 (MQ=255) cACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGcggtggcggtgg > 2:1961381/1‑94 (MQ=255) cTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACgg > 2:1961391/1‑119 (MQ=255) gggATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACgg < 1:1961310/116‑1 (MQ=255) gggATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAG‑‑‑GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATg > 1:1961336/1‑124 (MQ=255) ttGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTgg > 1:1961374/1‑119 (MQ=255) gCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCAt < 2:1961311/111‑1 (MQ=255) ccgccgATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGc > 2:1961396/1‑100 (MQ=255) ccgccgATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAggg < 2:1961312/116‑1 (MQ=255) atatCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGgtggtggtggtggtggtggtggtggtg < 1:1961314/60‑1 (MQ=255) atatCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACAt < 2:1961315/101‑1 (MQ=255) atatCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATgg < 1:1961313/103‑1 (MQ=255) tcCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAG‑‑‑GGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACg > 2:1961548/1‑82 (MQ=38) cccGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATggg < 1:1961316/108‑1 (MQ=255) tCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGaa > 1:1961368/1‑124 (MQ=255) ccTAGGCCAAGGGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTgg < 1:1961318/124‑1 (MQ=255) ccAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGt > 1:1961371/1‑122 (MQ=255) cAAGGGGGGTGGTGGTGGTGGGGGTGGTGGtggcggtggcgg < 2:1961319/42‑1 (MQ=18) aaGGGTGGGGGGGGTGGGGGTGGGGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCt < 2:1961320/113‑1 (MQ=255) | GAGCCGAACAAAAAATGAAAAAACCTTTGGTTGCTGTCTTTGCTTGTGCATTGGCACTCGGGATGACGGCATTCTTGCCCGCCGATATCTCCCCGATCAGTTCCGCCTATGCCAAGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCGGTGGCGGTGGTCATGGCGGTGGAAACGGTGCCGGACATGGCGGTGGCATGGGAGGGCATAGTGGAAGCGGGAAGGGCCTTGGAAGT > AE015451/2478290‑2478522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |