| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NZ_CP009273 | 1,613,500 | Δ4 bp | coding (124‑127/435 nt) | marR → | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NZ_CP009273 | 1613500 | 1613503 | 4 | 36 [0] | [0] 36 | marR | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 1613499 | 0 (0.000) | 36 (0.780) | 29/244 | 0.3 | 100% | coding (123/435 nt) | marR | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR |
| ? | NZ_CP009273 | 1613504 = | 0 (0.000) | coding (128/435 nt) | marR | multiple antibiotic resistance transcriptional regulator MarR | |||||
GGGCAACTAATGTGAAAAGTACCAGCGATCTGTTCAATGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTG > NZ_CP009273/1613366‑1613637 | gccagggcaactaatgtgaaaagtaccagcgatctgttcaatgaaattattccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcat > 1:574823‑M2/139‑139 (MQ=255) tgaaaagtaccagcgatctgttcaatgaaattattccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTgctctgctct < 2:676743‑M2/17‑1 (MQ=255) ctgttcaatgaaattattccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCgtg > 1:410220‑M2/106‑139 (MQ=255) ttcaatgaaattattccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTAAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCgcggc < 1:716710‑M2/31‑1 (MQ=255) ttccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGaa < 2:906951‑M2/50‑1 (MQ=255) ttccattgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGaa < 1:232583‑M2/50‑1 (MQ=255) ttgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGa > 2:167943‑M2/85‑138 (MQ=255) tgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcg < 2:483251‑M2/27‑1 (MQ=255) tgggtcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcg > 1:483251‑M2/84‑110 (MQ=255) tcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGcgcg < 2:149891‑M2/29‑1 (MQ=255) tcgcttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGcgcg > 1:149891‑M2/80‑108 (MQ=255) cttaatccatatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTAt > 2:84021‑M2/77‑139 (MQ=255) catatggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTgtcggt < 1:84021‑M2/70‑1 (MQ=255) atggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGa > 2:24240‑M2/67‑139 (MQ=255) tggttaatcagaagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGa < 1:911559‑M2/73‑1 (MQ=255) aagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTgg > 1:731251‑M2/55‑132 (MQ=255) aagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTgg < 2:731251‑M2/78‑1 (MQ=255) aagaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACt < 2:410220‑M2/85‑1 (MQ=255) gaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcg < 1:258115‑M2/27‑1 (MQ=255) gaaagatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTgcg > 2:258115‑M2/53‑79 (MQ=255) agatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 1:466934‑M2/90‑1 (MQ=255) agatcgcctgcttaacgagtatctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 2:548593‑M2/90‑1 (MQ=255) 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tctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaa < 2:846500‑M2/55‑1 (MQ=255) tctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc > 2:572251‑M2/29‑118 (MQ=255) tctgtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGAccc < 1:572251‑M2/90‑1 (MQ=255) gtctccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGt > 2:551548‑M2/26‑138 (MQ=255) tccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaa < 1:26296‑M2/55‑1 (MQ=255) tccgctggatattaccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGaa > 2:26296‑M2/23‑77 (MQ=255) taccgcggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGa > 1:830361‑M2/11‑137 (MQ=255) cggcaTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTg > 2:53282‑M2/6‑139 (MQ=255) | GGGCAACTAATGTGAAAAGTACCAGCGATCTGTTCAATGAAATTATTCCATTGGGTCGCTTAATCCATATGGTTAATCAGAAGAAAGATCGCCTGCTTAACGAGTATCTGTCTCCGCTGGATATTACCGCGGCACAGTTTAAGGTGCTCTGCTCTATCCGCTGCGCGGCGTGTATTACTCCGGTTGAACTGAAAAAGGTATTGTCGGTCGACCTGGGAGCACTGACCCGTATGCTGGATCGCCTGGTCTGTAAAGGCTGGGTGGAAAGGTTG > NZ_CP009273/1613366‑1613637 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |