Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	578771	578984	214	3 [1]	[0] 4	BW25113_RS26085/appY	tail fiber assembly protein/DNA‑binding transcriptional activator AppY

ATAATTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAA  >  NZ_CP009273/578985‑579022 |                                      ataatTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCaa  <  1:279038/38‑1 (MQ=255) ataatTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCaa  <  1:328739/38‑1 (MQ=255) ataatTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCaa  >  2:279038/1‑38 (MQ=255) ataatTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCaa  >  2:328739/1‑38 (MQ=255) |                                      ATAATTTAATCTTAAATGAAATTTATTAAAATTTGCAA  >  NZ_CP009273/578985‑579022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑