Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3798164	3798203	40	2 [0]	[1] 3	rfaS	LPS core biosynthesis protein RfaS

ACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATT  >  NZ_CP009273/3798175‑3798293                              |                                                                                          aCAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATg                               <  1:153224/90‑1 (MQ=255)                              aCAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCAtt  <  1:5974/90‑1 (MQ=255)                              aCAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCAtt  <  1:64878/90‑1 (MQ=255)                              |                                                                                          ACAGTATTTCTTAGAAGCAAAACTTTATGACAGTTAATATTTTTTAATATTTGTTTATTGATACCTTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATT  >  NZ_CP009273/3798175‑3798293

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑