Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2474106	2474159	54	6 [0]	[0] 2	[emrY]	[emrY]

TTCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAACCCCC  >  NZ_CP009273/2474016‑2474105                                                                                          | ttCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAAccccc  <  1:11720/90‑1 (MQ=255) ttCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAAccccc  <  1:232067/90‑1 (MQ=255) ttCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAAccccc  <  1:290452/90‑1 (MQ=255) ttCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAAccccc  <  2:201531/90‑1 (MQ=255) ttCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAAccccc  <  2:320387/90‑1 (MQ=255) ttCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAAccccc  <  2:46394/90‑1 (MQ=255)                                                                                          | TTCAACGCAGCATCGCAATCCTTTCCCTGGGTGAGCGATGCTGCCGATGGCGCAGACTTAAGATCCCCGGTCTTACCCGCTATAACCCCC  >  NZ_CP009273/2474016‑2474105

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑