New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | = 322269 | 258 (2.190) | 8 (0.080) | 8/150 | 3.9 | 3.8% | coding (690/1671 nt) | betA | choline dehydrogenase |
? | NZ_CP009273 | = 322352 | 177 (1.700) | coding (607/1671 nt) | betA | choline dehydrogenase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CGCCTGCACATAACAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCACGCGC > NZ_CP009273/322181‑322358 | cgcCTGCACATAACAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGtt > 2:2572318/1‑90 (MQ=255) cTGCACATAACAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGc < 2:3089258/90‑1 (MQ=255) tAACAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCaaa > 2:1972900/1‑90 (MQ=255) tAACAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCaaa < 1:2724095/90‑1 (MQ=255) aCAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCCTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCaaaaa > 1:1487627/1‑90 (MQ=255) aGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAatg < 2:365829/90‑1 (MQ=255) aGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAatg < 2:2724431/90‑1 (MQ=255) aGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAatg < 2:2242396/90‑1 (MQ=255) gCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAatga < 1:2769681/90‑1 (MQ=255) gCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAatga > 1:688546/1‑90 (MQ=255) cACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAatgat > 1:778613/1‑90 (MQ=255) cttcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGAtgt > 1:1109886/1‑90 (MQ=255) cttcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGAtgt > 2:1729065/1‑90 (MQ=255) cttcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGAtgt > 1:866344/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCTGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 1:959832/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 1:2994853/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 2:3238157/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 2:554184/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa < 1:554184/90‑1 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 1:1395204/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 2:388580/1‑90 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa < 1:3328924/90‑1 (MQ=255) tcttTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGa > 2:2968175/1‑90 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTTTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:1962061/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:2884656/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:3238157/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 2:304628/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:2254812/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 2:1183752/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:2082567/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:1863540/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 2:1960608/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:1729065/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:1622721/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 2:574363/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:1452563/90‑1 (MQ=255) tttGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 2:1395204/90‑1 (MQ=255) ttgttgGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCg > 1:2668989/1‑90 (MQ=255) ttgttgGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCg > 1:2799634/1‑90 (MQ=255) gttgGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc > 2:523881/1‑87 (MQ=255) ttgGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTc > 2:3279810/1‑90 (MQ=255) ttgGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTc < 2:2067570/90‑1 (MQ=255) ttgGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTc < 1:177284/90‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGc < 2:1507684/65‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 2:3123938/84‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCAt < 2:2327931/90‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCAt > 1:2327931/1‑90 (MQ=255) ggCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCAt > 1:2480642/1‑90 (MQ=255) gCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCCTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATa < 2:1487627/90‑1 (MQ=255) ccGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCGAAAATGATGTGATCGGTCATAg > 1:3160531/1‑90 (MQ=255) ccGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCAt > 2:1142909/1‑88 (MQ=255) ccGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCAt < 1:1142909/88‑1 (MQ=255) ccGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAg > 2:1694142/1‑90 (MQ=255) ccGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAg > 1:1344285/1‑90 (MQ=255) gTTGTGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCGTCCCAGCCATACAACGCCTCCCGCGCGTTTGCCGTCCAGAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 2:856348/90‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 1:3341488/90‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 1:900020/90‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 1:3119043/90‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 1:3279810/90‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 2:1346678/90‑1 (MQ=255) gTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 2:726589/90‑1 (MQ=255) ttGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGt < 1:358581/90‑1 (MQ=255) tGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTg < 1:2486752/90‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGa < 1:616981/90‑1 (MQ=255) gcgcGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGa < 2:2668989/90‑1 (MQ=255) ttGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGaa < 1:2248574/90‑1 (MQ=255) ttGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGaa < 1:1276170/90‑1 (MQ=255) gATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGt < 1:1974152/90‑1 (MQ=255) gTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc < 1:1423115/62‑1 (MQ=255) gTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATc > 1:537745/1‑62 (MQ=255) gTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAgg > 2:934463/1‑90 (MQ=255) gTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAgg > 1:2271322/1‑90 (MQ=255) gTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAgg > 1:2546474/1‑90 (MQ=255) gTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAgg > 1:515050/1‑90 (MQ=255) gTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGaa < 1:736155/77‑1 (MQ=255) gTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGaa > 2:736155/1‑77 (MQ=255) gTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAgg > 2:18207/1‑90 (MQ=255) tCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGa > 1:2379702/1‑90 (MQ=255) gCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGAcg < 2:621381/90‑1 (MQ=255) gCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGAcg < 2:2686161/90‑1 (MQ=255) gCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGAcg < 2:1228683/90‑1 (MQ=255) cAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGAttt < 1:3141828/90‑1 (MQ=255) aGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTg > 1:220497/1‑90 (MQ=255) cATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGcc < 1:2968175/90‑1 (MQ=255) cATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGcc < 2:2473877/90‑1 (MQ=255) tCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGa < 2:1109886/90‑1 (MQ=255) gACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATc < 2:2305309/90‑1 (MQ=255) gACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATc < 2:456811/90‑1 (MQ=255) gACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATc < 1:155024/90‑1 (MQ=255) cccACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCgaga > 1:1439989/1‑90 (MQ=255) gcgcgTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGAttt > 2:29337/1‑71 (MQ=255) gcgcgTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGAttt < 1:29337/71‑1 (MQ=255) gcgcgTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGc > 2:810456/1‑74 (MQ=255) cgcgTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCAc > 1:446340/1‑90 (MQ=255) cgTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCAcgc < 1:1167714/90‑1 (MQ=255) gTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCg < 1:652145/35‑1 (MQ=255) tttGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCAcgcgc < 1:1637537/90‑1 (MQ=255) tttGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCAcgcgc < 2:2828108/90‑1 (MQ=255) tttGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCAcgcgc < 1:1247302/90‑1 (MQ=255) tttGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCAcgcgc < 2:1275319/90‑1 (MQ=255) | CGCCTGCACATAACAGCACTTCTTTGTTGGCCGTTGCGCGGGTTGGGATGGTGCTGTCGCCTTCCAGCCATTCGACGCCCACCGCGCGTTTGCCGTCAAAAATGATGTGATCGGTCATAGCGTGAGTACGAATGGTCAGGTTAGGACGCGATTTGGCCTGATCGAGATAGCCACGCGC > NZ_CP009273/322181‑322358 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |