| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | 360104 = | NA (NA) | 71 (0.910) | 29/160 | 0.8 | 45.8% | intergenic (‑35/+251) | lacZ/BW25113_RS23320 | beta‑galactosidase/relaxase/mobilization nuclease domain‑containing protein |
| ? | NZ_CP009273 | = 360286 | 84 (1.070) | intergenic (‑217/+69) | lacZ/BW25113_RS23320 | beta‑galactosidase/relaxase/mobilization nuclease domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TCAGGAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCTTT > NZ_CP009273/360197‑360374 | tCAGGAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGggg‑aatt < 1:2406709/90‑1 (MQ=38) ggAGATCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGggg‑aattgg > 2:958748/1‑89 (MQ=255) ggAGATCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGggg‑aattgg < 1:958748/89‑1 (MQ=255) ggAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGggg‑aattggg > 2:27058/1‑90 (MQ=255) ggAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaat < 1:1127310‑M2/90‑4 (MQ=255) ggAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaat < 2:363143‑M2/90‑4 (MQ=255) ggAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaat < 1:537905‑M2/90‑4 (MQ=255) gagCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcc < 1:1405992‑M2/90‑7 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGTCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGggg‑aatt < 1:2059694/82‑1 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 1:884626‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 2:773811‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 2:440119‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 2:319019‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 2:1848823‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 2:1260809‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 2:1199536‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctg < 1:1062764‑M2/90‑9 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattc < 1:818630‑M2/87‑6 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGaatta > 2:2085348/1‑90 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGaatta > 1:1935752/1‑90 (MQ=255) gTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggc > 2:1442295‑M2/1‑80 (MQ=255) gTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggc > 2:207956‑M2/1‑80 (MQ=255) ttCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggca < 1:1347183‑M2/90‑12 (MQ=255) cACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCt > 2:1537484/1‑90 (MQ=255) cACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTAGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggc > 1:500386‑M2/1‑77 (MQ=255) cACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTAGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggc < 2:500386‑M2/87‑11 (MQ=255) cGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAACCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGa > 1:2023656/1‑90 (MQ=255) acaaacaaCAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAg > 1:1566776/1‑90 (MQ=255) acaGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAg < 2:1935752/90‑1 (MQ=255) gATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcc > 1:2513495‑M2/1‑62 (MQ=255) gATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcc > 1:363143‑M2/1‑62 (MQ=255) gATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcggcc < 2:257246‑M2/90‑29 (MQ=255) aaaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcc > 1:2008115‑M2/1‑58 (MQ=255) aaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcggggggcctgccc < 2:79879‑M2/90‑34 (MQ=255) aaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgccc > 1:1199536‑M2/1‑57 (MQ=255) aaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGt > 1:756172/1‑90 (MQ=255) aCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGGGAATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgccc > 2:87486‑M2/1‑57 (MQ=255) cGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTg > 1:1726956/1‑70 (MQ=255) cGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTg < 2:2255468/70‑1 (MQ=255) cGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTg < 2:1726956/70‑1 (MQ=255) cGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGa > 1:1407297/1‑90 (MQ=255) cGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGa > 2:1761318/1‑90 (MQ=255) aaaGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgcca > 2:1318097‑M2/1‑53 (MQ=255) aaaGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgcca > 1:1898016‑M2/1‑53 (MQ=255) aaaGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgcca > 1:840150‑M2/1‑53 (MQ=255) aaGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATAc > 1:944147/1‑90 (MQ=255) aGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgccccccacc > 1:2150338‑M2/1‑51 (MQ=255) ggCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGc < 2:2303726/90‑1 (MQ=255) cAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcggggggcctggccccccccccccc < 2:2411174‑M2/90‑45 (MQ=255) cAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTAt < 1:782122/90‑1 (MQ=255) cAGTCTTTCGACTGAACCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTAt < 2:2023656/90‑1 (MQ=255) ttCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat < 2:756172/90‑1 (MQ=255) ttCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat > 1:2231219/1‑90 (MQ=255) ttCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat < 2:1242904/90‑1 (MQ=255) tCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgtt > 1:1554609‑M2/1‑39 (MQ=255) aCTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGt < 1:2251917/90‑1 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTATTTGATTCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTa > 2:2012217/1‑90 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTc > 1:1163292/1‑65 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCt > 2:821208/1‑76 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCt < 1:821208/76‑1 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat > 1:248387/1‑84 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTa > 2:1847686/1‑90 (MQ=255) gAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTaa < 2:2231219/90‑1 (MQ=255) aGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgc > 2:1060310‑M2/1‑32 (MQ=255) gCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat > 1:1527879/1‑81 (MQ=255) gCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat < 2:1527879/81‑1 (MQ=255) ccTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaa > 1:79879‑M2/1‑30 (MQ=255) ccTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaa > 2:537905‑M2/1‑30 (MQ=255) ccTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgattcgcaa > 2:1347183‑M2/1‑30 (MQ=255) cTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTc < 2:521141/90‑1 (MQ=255) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCt > 1:1131817/1‑70 (MQ=255) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCt < 2:1131817/70‑1 (MQ=255) tttCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCa < 1:440119/90‑1 (MQ=255) gTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATggg < 2:1465909/90‑1 (MQ=255) ttttATTTGATGCCTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcggcccgccccccccccccccggcccttgcttcgcaaccttcaa < 2:2166194‑M2/90‑68 (MQ=255) ttttATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTaa > 2:1002668/1‑80 (MQ=255) ttttATTTGATGCCTGGGA‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTaa < 1:1002668/80‑1 (MQ=255) tttATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGaa > 1:583862/1‑90 (MQ=255) ttATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGAt < 2:1087802/57‑1 (MQ=255) ttATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat > 1:1254279/1‑71 (MQ=255) ttATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAg > 1:2368160/1‑90 (MQ=255) gATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAg > 1:342422/1‑90 (MQ=255) gATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAg > 1:410108/1‑90 (MQ=255) tGCCTGGGG‑AATTaattcctgggagtttatgccgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctccc > 1:319019‑M2/1‑13 (MQ=255) cTGGGG‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccatccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggc > 2:2233204‑M2/1‑10 (MQ=255) tGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGAt > 1:1470055/1‑45 (MQ=255) tGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGa > 1:1096349/1‑79 (MQ=255) tGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGc < 2:1594699/85‑1 (MQ=255) tGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGc > 1:1594699/1‑85 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgctcgcc > 1:840780‑M2/1‑5 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgctcgcc < 2:840780‑M2/41‑37 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatt > 1:216281‑M2/1‑5 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatt > 1:2196348‑M2/1‑5 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatt > 1:1776995‑M2/1‑5 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatt > 1:1260809‑M2/1‑5 (MQ=255) g‑AATTaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatt > 2:1405992‑M2/1‑5 (MQ=255) attgggaattAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCCATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCtt > 2:1116356/1‑90 (MQ=255) ttaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgcccccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatttgt > 1:2262121‑M2/1‑2 (MQ=255) ttaattcctggcagtttatggcgggcgtcctgcccgccaccctccgggccgttgcttcgcaacgttcaaatccgctcccggcggatttgt > 1:1757761‑M2/1‑2 (MQ=255) tgggaattAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat < 2:812118/51‑1 (MQ=255) | TCAGGAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTGATGCCTGGGG‑AATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCTTT > NZ_CP009273/360197‑360374 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |