Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NZ_CP009273 1700629 1700674 46 2 [1] [1] 5 rsxB electron transport complex subunit RsxB

TGCGTTAATTACCGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGATTGCCGTTGCCGCCGTGAG  >  NZ_CP009273/1700539‑1700639
                                                                                         |           
tGCGTTAATTACCGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGAttgccgtt             >  1:186230/1‑90 (MQ=255)
           ccGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGATTGCCGTTGCCGCCGTGAg  >  2:179332/1‑90 (MQ=255)
                                                                                         |           
TGCGTTAATTACCGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGATTGCCGTTGCCGCCGTGAG  >  NZ_CP009273/1700539‑1700639

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: