Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NZ_CP009273 4531522 4531557 36 2 [0] [1] 2 fimB/fimE type 1 fimbria switch DNA invertase FimB/type 1 fimbria switch DNA invertase FimE

AATTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTAACCATATCCATACAA  >  NZ_CP009273/4531454‑4531521
                                                                   |
aaTTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTAACCATATCCATACaa  <  1:226851/68‑1 (MQ=255)
aaTTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTAACCATATCCATACaa  >  2:226851/1‑68 (MQ=255)
                                                                   |
AATTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTAACCATATCCATACAA  >  NZ_CP009273/4531454‑4531521

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: