| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 290192 | 39 (1.670) | 21 (0.900) | 13/166 | 0.5 | 35.0% | coding (319/855 nt) | BW25113_RS01425 | hypothetical protein |
| ? | NZ_CP009273 | = 378046 | NA (NA) | pseudogene (262/264 nt) | BW25113_RS23340 | acetyltransferase | |||||
ATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCATTTTTCTA > NZ_CP009273/290103‑290281 | aTCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCg > 1:509761/1‑90 (MQ=255)aTCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCg > 2:505158/1‑90 (MQ=255) aatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCt > 1:655009‑M1/81‑90 (MQ=255) gCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCtt < 1:134022/90‑1 (MQ=255) aaTGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatt < 1:592345‑M1/90‑7 (MQ=255) aTGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGa > 2:674481/1‑90 (MQ=255) gATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGAt < 1:274355/90‑1 (MQ=255) gATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGAt > 1:665624/1‑90 (MQ=255) gATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGAt > 2:274355/1‑90 (MQ=255) aTTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccct < 1:150906‑M1/90‑14 (MQ=255) tttAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 1:699/90‑1 (MQ=255) tttAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 1:698052/90‑1 (MQ=255) tttAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 1:403802/90‑1 (MQ=255) tttAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 1:612734/90‑1 (MQ=255) aaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGctt > 2:674366‑M1/68‑90 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGctttcttt < 2:12805‑M1/28‑1 (MQ=255) tagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGctttcttt > 1:699165‑M1/63‑90 (MQ=255) aCTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccaga < 2:37193‑M1/90‑25 (MQ=255) cATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacat < 1:440051‑M1/90‑28 (MQ=255) cATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATaga < 1:540974/90‑1 (MQ=255) cATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATaga > 1:466377/1‑90 (MQ=255) cATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATaga < 1:337719/90‑1 (MQ=255) tgatgTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAgaga < 1:159956/90‑1 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 1:44898‑M1/23‑1 (MQ=255) tatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGctt > 2:44898‑M1/51‑73 (MQ=255) gTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACtt > 2:420776/1‑90 (MQ=255) ttCGTTTTCCAGATTAACGACCACTACTCTTCCAGAGTTACTTCTCTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacacctgttat < 2:509761‑M1/90‑35 (MQ=255) tCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatc > 2:86849‑M1/1‑55 (MQ=255) tCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatt < 1:233472‑M1/73‑19 (MQ=255) tCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatt > 2:233472‑M1/1‑55 (MQ=255) tCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTa > 2:69152/1‑90 (MQ=255) gTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcac > 2:177995‑M1/1‑53 (MQ=255) gTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAAc > 1:644661/1‑90 (MQ=255) tatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAgg < 2:281892‑M1/47‑1 (MQ=255) aGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 1:262619‑M1/90‑45 (MQ=255) aGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 2:230441‑M1/90‑45 (MQ=255) aGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 2:144370‑M1/90‑45 (MQ=255) cAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCa < 1:589928/90‑1 (MQ=255) gTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATaga < 1:218220/60‑1 (MQ=255) gTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATaga > 2:218220/1‑60 (MQ=255) gTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCAtt > 2:338553/1‑90 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtcTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTAt < 1:475862‑M1/67‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGa < 1:305858/90‑1 (MQ=255) tCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAc < 2:665624/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 2:283150/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 2:97788/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 2:597279/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 2:130341/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 1:90749/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 1:187473/90‑1 (MQ=255) ccAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGAcc < 1:505158/90‑1 (MQ=255) agagTTACTTCTGTTTTACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagat > 2:612322‑M1/1‑23 (MQ=255) agagTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt > 2:155032/1‑39 (MQ=255) agagTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 1:155032/39‑1 (MQ=255) gTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt > 1:4828/1‑36 (MQ=255) gTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGctt < 2:4828/36‑1 (MQ=255) tACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATg > 2:410914/1‑90 (MQ=255) tACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATg > 2:479925/1‑90 (MQ=255) tGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGAtt > 1:540380/1‑90 (MQ=255) ttttACCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcga < 2:527496‑M1/90‑81 (MQ=255) TACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCAtt > 2:695608‑M1/1‑90 (MQ=255) TACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCAtt > 1:635039‑M1/1‑90 (MQ=255) aCCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc < 1:133962‑M1/50‑45 (MQ=255) aCCTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccc > 2:133962‑M1/1‑6 (MQ=255) ccTCGtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgat < 2:102095‑M1/90‑86 (MQ=255) ccTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCAtttt < 1:69152/90‑1 (MQ=255) gtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc > 2:469145‑M1/1‑1 (MQ=255) gtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc > 2:139683‑M1/1‑1 (MQ=255) gtggatttgcccctatatttccagacatctgttat > 2:463616‑M1/1‑1 (MQ=255) gtggatttgcccctatatttccagacatctgttat < 1:463616‑M1/35‑35 (MQ=255) ggCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCATTTTTCTa > 2:457649/1‑90 (MQ=255) ggCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCATTTTTCTa > 1:187461/1‑90 (MQ=255) | ATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGAACTTTAACAGGTCATTTTTTATTTCATTTATTGACCAGTTATGACGATTGCATTTTTCTA > NZ_CP009273/290103‑290281 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |