| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | 3816618 = | 51 (2.200) | 3 (0.130) | 3/164 | 1.9 | 6.7% | coding (859/2109 nt) | spoT | bifunctional GTP diphosphokinase/guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase |
| ? | NZ_CP009273 | 3816703 = | 34 (1.520) | coding (944/2109 nt) | spoT | bifunctional GTP diphosphokinase/guanosine‑3',5'‑bis pyrophosphate 3'‑pyrophosphohydrolase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCCGCGTCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTGGGCTTATAAAGAGCA > NZ_CP009273/3816614‑3816790 | gCCGCGTCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACgg > 1:101183/1‑90 (MQ=255) CGTCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGtgtg < 2:554005‑M1/90‑1 (MQ=255) CGTCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGtgtg < 2:320980‑M1/90‑1 (MQ=255) CGTCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGtgtg < 2:218476‑M1/90‑1 (MQ=255) TCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCACTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGcc > 2:386027‑M1/1‑90 (MQ=255) gggCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGt > 1:359639/1‑90 (MQ=255) ggCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGtt < 2:541307/90‑1 (MQ=255) gCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTg < 2:489226/90‑1 (MQ=255) gCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTg < 1:405049/90‑1 (MQ=255) ccGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGa < 2:43541/90‑1 (MQ=255) ccGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGa < 1:606848/90‑1 (MQ=255) tGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTcc < 1:359473/90‑1 (MQ=255) tcgaggtgtgcaaagactgatagccgttcgcttttggaatggcgatatagtctttcacgcggcccgcacgGTGTGCCGGTTGAGGTCCAg < 2:494371‑M2/20‑1 (MQ=255) cTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCg > 2:85352/1‑90 (MQ=255) gcaaagactgatagccgttcgcttttggaatggcgatatagtctttcacgcggcccggacgGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTAcc < 2:398739‑M2/29‑1 (MQ=255) cGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGa < 1:343960/90‑1 (MQ=255) ccATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAg > 2:457610/1‑90 (MQ=255) ccATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAg > 2:224059/1‑90 (MQ=255) aTTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGat > 1:423135/1‑90 (MQ=255) ctgatagccgttcgcttttggaatggcgatatagtctttcacgcggcccggacgGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGata < 1:514687‑M2/36‑1 (MQ=255) gAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGAt < 2:101183/90‑1 (MQ=255) gAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGAt > 1:531207/1‑90 (MQ=255) tCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGa < 1:119004/62‑1 (MQ=255) tCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGa > 2:119004/1‑62 (MQ=255) tttGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGa < 2:490714/42‑1 (MQ=255) tttGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGa > 1:490714/1‑42 (MQ=255) tttGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGgtgt > 2:319636/1‑90 (MQ=255) tttGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGgtgt < 2:359639/90‑1 (MQ=255) gCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATgggc > 2:358919/1‑65 (MQ=255) gCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGAc < 1:358919/67‑1 (MQ=255) acCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGa > 2:124866/1‑35 (MQ=255) acCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGa < 1:124866/35‑1 (MQ=255) cGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACt < 2:429697/90‑1 (MQ=255) cGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACt < 2:435563/90‑1 (MQ=255) cGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACt < 1:22153/90‑1 (MQ=255) cGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACt < 1:153307/90‑1 (MQ=255) cGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACt < 1:569777/90‑1 (MQ=255) atgatCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTgg < 1:589009/90‑1 (MQ=255) cGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTGGGCTta > 2:441020/1‑90 (MQ=255) gCCCGCACGGTGTGCCGGTTGATGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTGGGCTtata < 2:577849/90‑1 (MQ=255) cGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTGGGCTTATAAag > 2:307389/1‑90 (MQ=255) cgGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTGGGCTTATAAAGAGCa < 1:307389‑M2/88‑1 (MQ=255) | GCCGCGTCCGGGCCGCGTGAAAGACTATATCGCCATTCCAAAAGCGAACGGCTATCAGTCTTTGCACACCTCGATGATCGGCCCGCACGGTGTGCCGGTTGAGGTCCAGATCCGTACCGAAGATATGGACCAGATGGCGGAGATGGGTGTTGCCGCGCACTGGGCTTATAAAGAGCA > NZ_CP009273/3816614‑3816790 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |