| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 592 (0.990) | 182/194 | 0.0 | 67.9% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589683 = | 559 (0.940) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor | |||||
Only 100 of 657 total aligned reads displayed.
CGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGC > NC_000913/365427‑365627 | tctttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 1:6141941‑M1/101‑101 (MQ=255)tctttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac < 1:1375681‑M1/1‑1 (MQ=255)tctttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattctgatacgttttaac > 2:662272‑M1/101‑101 (MQ=255) ctttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaacccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa > 1:5129762‑M1/100‑101 (MQ=255) ctttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa < 1:7389964‑M1/2‑1 (MQ=255) ctttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCa < 1:11955065‑M1/2‑1 (MQ=255) tttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCAt > 1:4586877‑M1/99‑101 (MQ=255) ttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaacnnn < 2:14049532‑M1/4‑4 (MQ=255) ttaaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaacnnn < 2:7727332‑M1/4‑4 (MQ=255) nnnaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATa > 2:10201349‑M1/98‑101 (MQ=255) nnnggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAg > 2:9823372‑M1/97‑101 (MQ=255) aaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaacatnnn < 2:11682453‑M1/6‑4 (MQ=255) aaggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGc < 1:12221296‑M1/6‑1 (MQ=255) ggcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTg > 1:14052233‑M1/94‑101 (MQ=255) gcattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaac > 2:291366‑M1/93‑93 (MQ=255) cattaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGtt > 1:1974215‑M1/92‑101 (MQ=255) ttaaaggacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 1:11552864‑M1/12‑1 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 1:11313510‑M1/12‑1 (MQ=255) ttaaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTc < 2:7201584‑M1/12‑1 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCt > 2:6461280‑M1/88‑101 (MQ=255) aaagaacagaccgcctgatgtcagttggaaaaggacaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCACAGCTGTTTCCt < 2:2722291‑M1/14‑1 (MQ=255) nnnacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt > 2:8694322‑M1/86‑101 (MQ=255) agaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgt > 1:12589399‑M1/86‑101 (MQ=255) gaacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtg < 1:13300291‑M1/17‑1 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt > 1:2270247‑M1/84‑101 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt < 1:8998606‑M1/18‑1 (MQ=255) aacagaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCtgtgt < 1:1304807‑M1/18‑1 (MQ=255) nnnccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa > 2:13684749‑M1/81‑101 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 1:3988955‑M1/21‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 1:3267213‑M1/21‑1 (MQ=255) agaccgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaa < 2:1599652‑M1/21‑1 (MQ=255) accgcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAAt > 2:3723653‑M1/79‑101 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGaaatnnn < 2:12395374‑M1/26‑4 (MQ=255) gcctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGt < 1:8206969‑M1/26‑1 (MQ=255) cctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt > 2:4498068‑M1/75‑101 (MQ=255) cctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGtt < 1:12907525‑M1/27‑1 (MQ=255) ctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa < 1:8030901‑M1/28‑1 (MQ=255) ctgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTa > 1:7675468‑M1/74‑101 (MQ=255) ccgatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAattgnnn < 2:11456107‑M1/28‑4 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc < 1:471659‑M1/30‑1 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc > 1:6441767‑M1/72‑101 (MQ=255) gatgtcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATc < 1:12420612‑M1/30‑1 (MQ=255) tcagttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTtatccnnn < 2:14515852‑M1/34‑4 (MQ=255) agttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTca < 1:3065887‑M1/36‑1 (MQ=255) gttgtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGCTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTcac > 1:11774124‑M1/65‑101 (MQ=255) gtaaaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAAt > 1:2443579‑M1/62‑101 (MQ=255) aaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaGATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc < 1:10965257‑M1/43‑1 (MQ=255) aaaggccaaaaacggccaaaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTcc < 2:2008863‑M1/43‑1 (MQ=255) 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aaaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCgg < 1:1494126‑M1/61‑1 (MQ=255) aaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACgagccnnn < 2:14739283‑M1/62‑4 (MQ=255) aaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGa > 1:10331733‑M1/40‑101 (MQ=255) aaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGa < 1:6679842‑M1/62‑1 (MQ=255) aaccagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGa < 1:9670545‑M1/62‑1 (MQ=255) accagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa < 2:2286459‑M1/63‑1 (MQ=255) accagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa < 1:2654285‑M1/63‑1 (MQ=255) accagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGGGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaa < 1:14297841‑M1/63‑1 (MQ=255) cagcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGc > 2:6328537‑M1/37‑101 (MQ=255) gcagtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCAt > 1:3543‑M1/35‑101 (MQ=255) cagtaagctggtcacaattttgatacggtttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGaagcnnn < 2:8069209‑M1/68‑4 (MQ=255) gtaagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAgcatnnn < 2:11973854‑M1/70‑4 (MQ=255) aagctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgt > 1:999841‑M1/30‑101 (MQ=255) agctggtcacaattttgatacgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAgtg > 1:2799166‑M1/29‑101 (MQ=255) 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acgttttaaCATAGCTGTTTCGTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGAAAAGCCTGGGgtgccnnn < 2:14328512‑M1/92‑4 (MQ=255) acgttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTaa > 2:2525451‑M1/10‑101 (MQ=255) gttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtg > 1:14498051‑M1/8‑101 (MQ=255) ttttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtga < 1:2976639‑M1/95‑1 (MQ=255) ttaaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCtaatgnnn < 2:10787109‑M1/97‑4 (MQ=255) nnnaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTACAGCCTGGGGTGCCTAAtgagt > 2:13225020‑M1/5‑101 (MQ=255) taaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtgagtg > 1:4263534‑M1/4‑101 (MQ=255) aaCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtgagtga > 1:867705‑M1/3‑101 (MQ=255) aaCATAGCTGTTACCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAAtgagtga > 1:7824466‑M1/3‑101 (MQ=255) aCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGTGGTGCCTAAtgagagag < 1:371088‑M1/100‑1 (MQ=255) | CGAAAGGGGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTAAAACGACGGCCAGTGAATCCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTAATGAGTGAGC > NC_000913/365427‑365627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |