| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 592 (0.990) | 182/194 | 0.0 | 67.9% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589683 = | 559 (0.940) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor | |||||
Only 100 of 1215 total aligned reads displayed.
TGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCCTTAAAGAA > NC_000913/4589583‑4589783 | tgAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGt > 2:4881480/1‑101 (MQ=255)ctcactcattaggcaccccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgt > 2:6970450‑M2/101‑101 (MQ=255) gAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGtt < 1:9342943/101‑1 (MQ=255) tAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGttnnn > 2:7389964/1‑98 (MQ=255) aaaTTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAAc < 2:1685042/101‑1 (MQ=255) aaaTTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAAc > 1:7822869/1‑101 (MQ=255) aaTTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACg < 1:6756716/101‑1 (MQ=255) cACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATc > 1:12895544/1‑101 (MQ=255) ccTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCa < 1:13036179/100‑1 (MQ=255) nnnaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAAt < 2:13879697‑M2/17‑1 (MQ=255) cgaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgggagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTatcaaannn > 2:13450983‑M2/84‑98 (MQ=255) ccaggctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAAtt < 1:434591‑M2/18‑1 (MQ=255) gctttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGa < 2:802135‑M2/22‑1 (MQ=255) attacactttatgcttccggctcgtatggtgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacggctaagTTAAAACGAAACAaaattgttnnn > 2:11594729‑M2/78‑97 (MQ=255) ttacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCa > 2:3155594‑M2/77‑101 (MQ=255) tcCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAg < 1:9967603/101‑1 (MQ=255) tacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctctgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAg < 1:14292870‑M2/26‑1 (MQ=255) tacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAg < 2:2200726‑M2/26‑1 (MQ=255) tacactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAg > 2:906166‑M2/76‑101 (MQ=255) cactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCt > 1:960612‑M2/74‑101 (MQ=255) cactttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCt > 1:2799166‑M2/74‑101 (MQ=255) gcgGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCtt < 2:3432790/101‑1 (MQ=255) cgGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTa > 1:5134405/1‑101 (MQ=255) gggATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAc < 1:1045949/101‑1 (MQ=255) ttatgcttccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAct > 1:3675771‑M2/70‑101 (MQ=255) ttatgcttccggctcgtatgttgtgtcgaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAAATGTGACCAGCTTAct < 2:6034180‑M2/32‑1 (MQ=255) nnntatTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTagt < 2:11143450/98‑3 (MQ=255) tatgcttccggctcgtatgttgtgtggaagtgggagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActg < 1:12161715‑M2/33‑1 (MQ=255) atatTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgc > 1:8292637/1‑101 (MQ=255) tatTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActnnn > 2:10340324/1‑98 (MQ=255) nnnaTAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTActgctcg < 2:10894686/98‑3 (MQ=255) tCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGt < 1:11114448/101‑1 (MQ=255) nnngctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGttt < 2:14193244‑M2/40‑1 (MQ=255) ccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGttt < 1:1494126‑M2/40‑1 (MQ=255) ccggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGttt > 1:8089129‑M2/62‑101 (MQ=255) tAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGtttt > 1:1184857/1‑101 (MQ=255) ggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTg > 2:2461227‑M2/60‑101 (MQ=255) ggctcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTg < 1:13976116‑M2/42‑1 (MQ=255) nnncgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTgg < 2:10147575‑M2/43‑1 (MQ=255) aGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGc > 2:6843234/1‑101 (MQ=255) tcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc < 1:6484934‑M2/45‑1 (MQ=255) tcgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGcc < 1:7086944‑M2/45‑1 (MQ=255) cgtatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTtttggnnn > 2:12703056‑M2/56‑98 (MQ=255) tatgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTGACTGCTGGTTTtggccnnn > 2:9424625‑M2/54‑98 (MQ=255) tgttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGtttt < 1:1257419‑M2/50‑1 (MQ=255) tcctttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGtttt > 1:11335060/1‑101 (MQ=255) gttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttttt > 2:4601263‑M2/51‑101 (MQ=255) gttgtgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGttttt < 2:2662600‑M2/51‑1 (MQ=255) nnntgtggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTg < 2:13216387‑M2/52‑1 (MQ=255) tttccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTgg > 2:4315104/1‑101 (MQ=255) tccAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGcc > 1:1086286/1‑101 (MQ=255) ggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCttt < 1:8591458‑M2/58‑1 (MQ=255) ggaattgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCttt < 2:2008863‑M2/58‑1 (MQ=255) nnngAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTa < 2:11389862/98‑1 (MQ=255) gCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTa > 2:851361/1‑101 (MQ=255) attgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGgcctttnnn > 2:10676212‑M2/41‑98 (MQ=255) attgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTAc < 1:2649793‑M2/61‑1 (MQ=255) attgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTAc > 1:2443579‑M2/41‑101 (MQ=255) ttgtgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa < 2:5477105‑M2/62‑1 (MQ=255) nnntgagcggataacaatttcacacaggaaacagctatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa < 2:8770076‑M2/62‑1 (MQ=255) cGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACa > 1:13373999/1‑101 (MQ=255) gAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTannn > 2:12367700/1‑98 (MQ=255) 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tatgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCCTTaa > 1:2133565‑M2/5‑101 (MQ=255) gTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGc > 2:291366‑M2/2‑93 (MQ=255) gTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCCGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCCTTAAAGa < 1:5688364‑M2/100‑1 (MQ=255) | TGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACAGGAAAGAGAAACCATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGCCTTAAAGAA > NC_000913/4589583‑4589783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |