Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 4,092,014 | 3461 bp→GCATGCGGATCCTCTAGAGTCGACATATG | [rhaD]–rhaB | [rhaD], rhaA, rhaB |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4092014 | 4095474 | 3461 | 270 [0] | [1] 274 | [rhaD]–rhaB | [rhaD],rhaA,rhaB |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4092013 | 0 (0.000) | 182 (1.010) +GCATGCGGATCCTCTAGAGTCGACATATG |
96/116 | 0.0 | 99.8% | coding (283/825 nt) | rhaD | rhamnulose‑1‑phosphate aldolase |
? | NC_000913 | 4095475 = | 1 (0.000) | intergenic (‑4/‑284) | rhaB/rhaS | rhamnulokinase/DNA‑binding transcriptional activator for rhaBAD and rhaT, L‑rhamnose‑binding |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GGCTGCGGCATTCACGCTCGTAACGCGCCAGCATCACGCGCCCACTGGATGCGCCGAGATCGACGGCGACACAATTGCGAAAGGTCATAATGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCA > NC_000913/4095384‑4095567 | gtggggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatggta > 1:915549‑M2/92‑93 (MQ=255) aggacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATc < 1:5346880‑M2/6‑1 (MQ=255) tacggcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCct < 1:2533748‑M2/8‑1 (MQ=255) gcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcctgctc > 1:5846184‑M2/83‑93 (MQ=255) gcttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATcctgcta > 1:2247492‑M2/83‑93 (MQ=255) ttcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGt > 2:3059141‑M2/81‑82 (MQ=255) tcgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTgaaa > 1:3091339‑M2/80‑93 (MQ=255) cgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGa > 2:711431‑M2/79‑82 (MQ=255) cgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGa < 2:5398368‑M2/4‑1 (MQ=255) cgttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAatg > 1:3786200‑M2/79‑93 (MQ=255) agttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAtt < 1:1091249‑M2/16‑1 (MQ=255) gttggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAattc > 1:6048331‑M2/78‑93 (MQ=255) tggttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCa < 1:473181‑M2/19‑1 (MQ=255) cgttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt < 1:6964579‑M2/20‑1 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCata > 1:3886831‑M2/74‑93 (MQ=255) gttaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAtt > 1:1247195‑M2/74‑94 (MQ=255) ataacccccaaagaacgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa < 1:2351692‑M2/22‑1 (MQ=255) taacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgct > 2:1023702‑M2/72‑82 (MQ=255) taacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgct < 2:1583379‑M2/11‑1 (MQ=255) gaacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTAc < 1:628411‑M2/23‑1 (MQ=255) caacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTAc < 1:2692902‑M2/23‑1 (MQ=255) aacccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCctgctg > 2:6932912‑M2/71‑82 (MQ=255) gcccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtccctgtcgacgcatgcggatcctctagtgtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGa < 1:3174907‑M2/25‑1 (MQ=255) acccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGa > 2:4611987‑M2/70‑82 (MQ=255) tccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAc < 1:4035074‑M2/26‑1 (MQ=255) cccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGaa < 2:351194‑M2/14‑1 (MQ=255) cccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAc > 1:5016199‑M2/69‑94 (MQ=255) ccccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGAcc > 1:7271299‑M2/68‑94 (MQ=255) cccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAtt < 2:5940288‑M2/16‑1 (MQ=255) ccaaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAAttt < 2:7383054‑M2/17‑1 (MQ=255) caaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTc > 2:7296890‑M2/65‑82 (MQ=255) aaagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCa > 2:903379‑M2/64‑82 (MQ=255) aagaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCAt < 2:2320358‑M2/20‑1 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa > 2:5812118‑M2/61‑82 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa < 2:2176863‑M2/22‑1 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTa > 2:1500541‑M2/61‑82 (MQ=255) gaatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaa > 1:2121393‑M2/61‑94 (MQ=255) catgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTaaa < 1:4832828‑M2/35‑1 (MQ=255) aatgtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTAc > 2:5494585‑M2/60‑82 (MQ=255) gtggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGCATTTCATTACGAc > 2:4151269‑M2/57‑82 (MQ=255) cggtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAgc < 1:4604978‑M2/39‑1 (MQ=255) gtagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAg < 2:378147‑M2/29‑1 (MQ=255) agagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAgcgc < 1:4270546‑M2/41‑1 (MQ=255) tagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGt < 2:2071809‑M2/30‑1 (MQ=255) gagcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGcc < 1:3277854‑M2/42‑1 (MQ=255) ggcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCt < 1:3116201‑M2/43‑1 (MQ=255) agcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCt > 1:1379119‑M2/52‑94 (MQ=255) gcccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTg > 1:291483‑M2/51‑94 (MQ=255) tcgcgccgtcgctgtcgacgcatgcgtatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCctgca < 1:7201397‑M2/46‑3 (MQ=255) ccgcgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTgat > 1:2015757‑M2/49‑93 (MQ=255) cgccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAatta > 1:1677490‑M2/46‑93 (MQ=255) tccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcg < 1:3226119‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATtcga > 1:7339276‑M2/44‑93 (MQ=255) ccgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATtcga > 1:3444545‑M2/44‑93 (MQ=255) cgtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAgcg > 2:2731323‑M2/43‑82 (MQ=255) gtcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAgcgc > 2:4490737‑M2/42‑82 (MQ=255) tcgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGcc > 2:6563029‑M2/41‑82 (MQ=255) ggctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGAcc < 1:5715798‑M2/55‑1 (MQ=255) cgctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCt < 2:3010720‑M2/43‑1 (MQ=255) gctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTg > 2:4972381‑M2/39‑82 (MQ=255) ctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa > 2:6105265‑M2/38‑82 (MQ=255) ctgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGa < 2:6299252‑M2/45‑1 (MQ=255) tgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGaa < 2:1762146‑M2/46‑1 (MQ=255) tgtcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc < 1:756555‑M2/58‑1 (MQ=255) ttcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtct < 1:174132‑M2/59‑1 (MQ=255) ctcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtct < 1:5472028‑M2/59‑1 (MQ=255) tcgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCttctt > 1:6388975‑M2/35‑93 (MQ=255) acgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtctc < 1:2069827‑M2/60‑1 (MQ=255) cgacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTc > 2:5687171‑M2/34‑82 (MQ=255) tacgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGt < 1:4079523‑M2/62‑1 (MQ=255) acgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgc > 2:6018413‑M2/32‑82 (MQ=255) cgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgcg < 2:4541714‑M2/52‑1 (MQ=255) cgcatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTcgcg > 2:4683778‑M2/31‑82 (MQ=255) gatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACt < 1:2412204‑M2/66‑1 (MQ=255) aatgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACt < 1:5419432‑M2/66‑1 (MQ=255) tgcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCt < 2:263522‑M2/56‑1 (MQ=255) gcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCtt < 2:7067304‑M2/57‑1 (MQ=255) gcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCtt < 2:5214117‑M2/57‑1 (MQ=255) gcggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGAc < 1:5949847‑M2/69‑1 (MQ=255) cggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTtc < 2:6675933‑M2/58‑1 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGAcat > 1:4205460‑M2/24‑93 (MQ=255) ggatcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCCGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGAcac > 1:6868829‑M2/24‑93 (MQ=255) atcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACaggg > 1:5823923‑M2/22‑93 (MQ=255) atcctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGa > 1:1037278‑M2/22‑94 (MQ=255) ctctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGgaaat > 1:7025365‑M2/19‑93 (MQ=255) tctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTAc < 2:1546964‑M2/65‑1 (MQ=255) tctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAAt < 1:3605293‑M2/77‑1 (MQ=255) cctagagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAAt < 1:2731826‑M2/77‑1 (MQ=255) agagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGa > 2:1226326‑M2/15‑82 (MQ=255) gagtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGAc > 2:5759243‑M2/14‑82 (MQ=255) ttcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCa < 1:6204877‑M2/83‑1 (MQ=255) gtcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAg > 2:686638‑M2/12‑82 (MQ=255) tcgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAgg > 2:3425361‑M2/11‑82 (MQ=255) cgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGa < 2:814364‑M2/73‑1 (MQ=255) cgacatatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCAtt < 1:6591008‑M2/85‑1 (MQ=255) catatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATtggg > 1:1928722‑M2/7‑93 (MQ=255) atatgGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAAt < 2:7336322‑M2/77‑1 (MQ=255) tgtgATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCa < 1:7422097/94‑1 (MQ=255) gtgATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGcc < 2:7046323/82‑1 (MQ=255) gtgATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGcc > 2:3987393/1‑82 (MQ=255) | GGCTGCGGCATTCACGCTCGTAACGCGCCAGCATCACGCGCCCACTGGATGCGCCGAGATCGACGGCGACACAATTGCGAAAGGTCATAATGTGATCCTGCTGAATTTCATTACGACCAGTCTAAAAAGCGCCTGAATTCGCGACCTTCTCGTTACTGACAGGAAAATGGGCCATTGGCAACCA > NC_000913/4095384‑4095567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |