New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2115728 | 300 (1.010) | 3 (0.010) | 3/172 | 43.5 | 1.2% | coding (701/1281 nt) | wcaK | colanic acid biosynthesis protein |
? | NC_000913 | = 2454891 | 240 (0.940) | intergenic (‑57/+146) | sixA/fadJ | phosphohistidine phosphatase/fused enoyl‑CoA hydratase and epimerase and isomerase/3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ATTGACCACCCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGTTCCAC > NC_000913/2115628‑2115828 | ttGACCACCCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGGAATGGCAACCGTTTTCtt > 1:5906136/1‑100 (MQ=255) gACCACCCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCtgtt < 1:38194/101‑1 (MQ=255) accaccCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCtgttg < 2:3632981/101‑1 (MQ=255) accaccCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCtgttg > 1:2230250/1‑101 (MQ=255) accCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGc > 1:5824095/1‑101 (MQ=255) cccGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCgg > 1:1333064/1‑101 (MQ=255) cccGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCgg > 1:1647502/1‑101 (MQ=255) accGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCgg < 2:6960708/100‑1 (MQ=255) ccGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGc > 1:2538041/1‑101 (MQ=255) ggCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCaa > 2:6314054/1‑101 (MQ=255) ggCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCaa > 2:3897980/1‑101 (MQ=255) ggCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCaa > 1:6992495/1‑101 (MQ=255) cAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACg > 1:2151617/1‑101 (MQ=255) cAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACg > 1:2177175/1‑101 (MQ=255) cAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACg < 2:1615086/101‑1 (MQ=255) cAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACg < 1:5052280/101‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGt < 2:5308101/101‑1 (MQ=255) aaaGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGt > 1:2018614/1‑101 (MQ=255) aaGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTc > 1:295957/1‑101 (MQ=255) aGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTcc < 1:4215994/101‑1 (MQ=255) aGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTcc > 2:950744/1‑101 (MQ=255) ggCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTcca < 1:106228/101‑1 (MQ=255) ttttCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTccagcca > 1:3342982/1‑101 (MQ=255) ttttCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTAGTGGGGCAACGTcaagcca < 2:2021395/101‑1 (MQ=255) ttCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAgt < 1:5230111/101‑1 (MQ=255) aTACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGtt > 2:1512116/1‑101 (MQ=255) aTACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGtt < 2:3079516/101‑1 (MQ=255) aCGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGa < 2:1322962/101‑1 (MQ=255) cGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGaa > 1:3610603/1‑101 (MQ=255) gCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTTCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGATGAAc > 2:2918995/1‑101 (MQ=255) gCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAAc < 1:700975/101‑1 (MQ=255) cTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACg > 2:2764011/1‑101 (MQ=255) ttgttgAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACgg > 1:4919806/1‑101 (MQ=255) tgttgAGGGGTGCGGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGc < 2:4826907/101‑1 (MQ=255) gttgAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCa > 1:3686266/1‑101 (MQ=255) gttgAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGAGTTGAACGGCa > 1:514197/1‑101 (MQ=255) tgAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATa > 1:4471720/1‑101 (MQ=255) gAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAg > 2:4565899/1‑101 (MQ=255) gtggtgCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCt < 1:5287017/101‑1 (MQ=255) ggtgCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTgg > 2:2391499/1‑101 (MQ=255) gtgCCGAGTCGTTTGTCAAAAGGTTCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACCGCATAGCTGGc > 2:3220256/1‑101 (MQ=255) gtgCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGc > 2:4618162/1‑101 (MQ=255) gtgCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGc < 2:6577909/101‑1 (MQ=255) gtgCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGc < 1:5545377/101‑1 (MQ=255) gCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCgg < 2:1829176/101‑1 (MQ=255) gCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCgg < 1:2890327/101‑1 (MQ=255) gagaCGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGa > 2:3424598/1‑101 (MQ=255) gagaCGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGGAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGa > 2:2993577/1‑101 (MQ=255) aCGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGt > 1:858568/1‑101 (MQ=255) cGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGtc > 2:2453805/1‑101 (MQ=255) gTTTGTTAAACGGTGTCATGTCGCGCAGGGTAATAGCCACCTTTGTCTGTTGTGCTGCGGCTTCCAGCCAGTGGTTAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGtct > 2:6827216/1‑101 (MQ=255) tttGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGtctt > 2:3768744/1‑101 (MQ=255) tttGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGtctt < 1:468264/101‑1 (MQ=255) aaaCGGTGCCAGTTCGCGCAGGGAAAGGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGCCTTAtgtga > 2:1162494/1‑100 (MQ=255) aaCGGTGCCAGTTCGTGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCtgtgtg > 2:1746773/1‑101 (MQ=255) aaCGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCtgtgtg > 1:3514971/1‑101 (MQ=255) aaCGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCtgtgtg < 1:5974101/101‑1 (MQ=255) aCGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTgtgg < 2:359281/101‑1 (MQ=255) cGGTACCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTgtggt < 2:549509/101‑1 (MQ=255) tgtcAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTTTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGac > 2:2180695/4‑100 (MQ=255) gCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATc < 1:758333/101‑1 (MQ=255) catttCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGa > 2:2287768/4‑101 (MQ=255) cAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGa > 2:5238876/1‑101 (MQ=255) aGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGAc > 2:469872/1‑101 (MQ=255) aGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGAc < 2:1222360/101‑1 (MQ=255) gTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGAcc > 2:5784441/1‑101 (MQ=255) ttCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGAccg > 2:4279042/1‑100 (MQ=255) tCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAg < 2:5929295/101‑1 (MQ=255) gcgcAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGTCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGcc < 2:5132166/101‑1 (MQ=255) cgcAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCa < 2:6034425/101‑1 (MQ=255) cAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCAcg > 2:1185829/1‑101 (MQ=255) aGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCAcgc > 1:6710709/1‑101 (MQ=255) gggTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCAcgcg > 1:3229492/1‑101 (MQ=255) ggTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCgg > 2:1647490/1‑101 (MQ=255) gTAATGGCCACCGGTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGt > 1:1487458/1‑101 (MQ=255) aaTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTAt > 1:2813586/1‑101 (MQ=255) aaTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTAt > 2:2728310/1‑101 (MQ=255) aaTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGGCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGGGAAGTCTTCTGTGTGGGGATCGACCAGCCACGCGGTAt > 1:5646056/1‑101 (MQ=255) aTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATc > 2:2612474/1‑101 (MQ=255) aTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATc > 1:4023305/1‑101 (MQ=255) aTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATc > 1:3930441/1‑101 (MQ=255) aTGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATc < 1:6916554/101‑1 (MQ=255) tGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCg > 2:4137077/1‑101 (MQ=255) ggCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGa < 1:2318021/101‑1 (MQ=255) tccACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGAc < 2:6218955/100‑1 (MQ=255) gCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGAc > 1:4972142/1‑101 (MQ=255) gCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGGGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGAc > 2:76290/1‑101 (MQ=255) ccACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACg > 2:7040529/1‑101 (MQ=255) ccACAGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGACTTCTGTGTGGTTATCGACCAGCCACGCGGTAACggcn > 2:2088827/1‑98 (MQ=255) aCCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGcc < 1:6385234/101‑1 (MQ=255) ccGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCa < 2:1413588/101‑1 (MQ=255) cGTTTTCTGTTGTGCGGCACCGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCAt < 2:6694402/101‑1 (MQ=255) cGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCAt < 1:2088356/101‑1 (MQ=255) cGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCAt < 2:5601484/101‑1 (MQ=255) ttttCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGt < 1:950744/101‑1 (MQ=255) tttCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGtt > 1:268752/1‑101 (MQ=255) tttCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGtt < 2:5047188/101‑1 (MQ=255) tttCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGtt > 1:6652231/1‑101 (MQ=255) tCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGTTcc > 1:5404331/1‑101 (MQ=255) tgttgtGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTAAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGTTCCAc > 2:4437859/1‑101 (MQ=255) | ATTGACCACCCCGGCAAAGGCTTTTTCATACGCTTGTTGAGTGGTGCCGAGACGTTTGTCAAACGGTGCCAGTTCGCGCAGGGTAATGGCCACCGTTTTCTGTTGTGCGGCAACGTCCAGCCAGTGTTGAACGGCATAGCTGGCGGTGAAGTCTTCTGTGTGGTGATCGACCAGCCACGCGGTATCGACGCCATGTTCCAC > NC_000913/2115628‑2115828 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |