New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4037216 = | 83 (0.730) | 4 (0.040) | 4/462 | NT | 5.1% | noncoding (76/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile |
? | NC_000913 | 4037237 = | 68 (0.620) | intergenic (+20/‑23) | ileT/alaT | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala |
ACACCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGATTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCGAAGTTTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAA > NC_000913/4036938‑4037492 | caacccgaagatgtttctttcgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaaaacttcgcagtgaacctttgcaggtacactctgaagtattttttatttaatcactacagagatggtggagctatgcgggatcgaaccgcagacctcctgcgtgcaaagcaggcgctctcccagctgagctatagccccataacatgtagttaaaacctcttCa < 1:1081238‑M1/2‑1 (MQ=255) acCATGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTCGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTGCAAGTCCAGCAAGGCCTCCCAAAt > 1:541304/1‑281 (MQ=12) aTGGGAGTGGGTTGAAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCCCTTGGTGATTAATGACTGGGGTGAAGTCGCAACAAGTTAACAGCCGGGGAACATGCGGTTTGATCCTCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCCTTGAAGTGCTCACACAGATTTTCTGATGAAAC‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGGTTTGTAGCTCAGGAGGTTAGAGCGCACCCCTGCTAGCGGTGAAGTGCGTGGTTCAAGTCTCTACAGGCCCACAAAAtttc > 2:739509/1‑280 (MQ=11) tGGGAGTGGGTTGCAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGCAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGCGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGTCTTGTAGACCAGGTGGGTAGAGCGCACCCAGGATAAGGGTAAGGTCCGTGGTTCAAGTCCACCAAGGTCTACCAAAttcac > 2:235659/1‑278 (MQ=11) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |