| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4037216 = | 83 (0.730) | 4 (0.040) | 4/462 | NT | 5.1% | noncoding (76/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile |
| ? | NC_000913 | 4037237 = | 68 (0.620) | intergenic (+20/‑23) | ileT/alaT | tRNA‑Ile/tRNA‑Ala | |||||
CAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGATTAAATAAAAAATACTTCAGAGTGTACCTGCAAAGGTTCACTGCGAAGTTTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGAAAGAAACATCTTCGGGTTG > NC_000913/4036957‑4037515 | cAAAAGAAGTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGCCTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACTAAATTCGCACGGCAAAATTGa > 1:248629/1‑281 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aagaagTGGGTGGCTTAACCTTGCGGAGGGCGATTAACACTTTGTGATTCATGACTAGGGTGAAGTCGTAACAACTTAACCGTAGGAGAACATGCGGTTGGATCACCTCCTAACCTTAAAGAAGCGTTCTGTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGAGGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACGGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAAAGCGCACCCCTGGTAAGGATGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAag < 2:724648/280‑1 (MQ=11) aagaagTAGGTAGCTTAACCTTCGGGAGGGCGCTTACCACTTTGTGATTCATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTGGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAA‑TGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAag < 1:446978/280‑1 (MQ=32) aagaagGTGGTGGCTTAACCGTCGGGAGAGGGCTTACCTCTTGGTGATTCATTACTGGGGTTAAGTCGTAACGAGGTAACCGTAGGGGAACCTGCGGTTTGATCACCTCCTTACCTTAAAGAAGCGTTCTGTGAAGTGCTCACCCGGGTTGTCTGGTGAAAA‑TGAGCAGTAGAACCTCGACGGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGTGCGCACCCCTGATAGGGGTGAGGTCAGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAaga < 2:326483/281‑1 (MQ=11) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |